条斑紫菜丝状体黄斑病菌群特征及其与水体环境关系的研究
摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5-6页 |
引言 | 第9-12页 |
1 综述 | 第12-20页 |
1.1 栽培型紫菜的主要病害 | 第12-14页 |
1.2 紫菜病害的研究方法 | 第14-16页 |
1.3 测序技术及其应用 | 第16-18页 |
1.4 本文主要研究内容 | 第18-20页 |
2 条斑紫菜贝壳丝状附生菌群研究 | 第20-32页 |
2.1 材料与方法 | 第21-22页 |
2.1.1 样本采集和处理 | 第21页 |
2.1.2 DNA制备和 16S rDNA扩增 | 第21页 |
2.1.3 文库质量控制和测序 | 第21页 |
2.1.4 数据分析 | 第21-22页 |
2.2 结果 | 第22-30页 |
2.2.1 测序数据量和覆盖度 | 第22-23页 |
2.2.2 贝壳丝状体附生微生物组成 | 第23-28页 |
2.2.3 贝壳丝状体菌群的alpha多样性 | 第28-29页 |
2.2.4 贝壳丝状体菌群在样本间的聚类关系 | 第29页 |
2.2.5 患病贝壳丝状体菌群的物种变化 | 第29-30页 |
2.3 讨论 | 第30-32页 |
3 丝状体育苗池的微生态变化 | 第32-53页 |
3.1 材料与方法 | 第33-34页 |
3.1.1 贝壳丝状体培养条件 | 第33页 |
3.1.2 育苗池水样采集 | 第33页 |
3.1.3 理化因子测定 | 第33页 |
3.1.4 总DNA抽提 | 第33页 |
3.1.5 基因扩增 | 第33-34页 |
3.1.6 高通量测序 | 第34页 |
3.1.7 数据处理和统计 | 第34页 |
3.2 结果 | 第34-51页 |
3.2.1 数据量和测序覆盖度 | 第34-37页 |
3.2.2 微生物群落多样性和聚类 | 第37-39页 |
3.2.3 细菌分类与群落组成 | 第39-45页 |
3.2.4 群落动态和疾病相关变化 | 第45-48页 |
3.2.5 水体理化因子的变化 | 第48页 |
3.2.6 微生物群落与环境因子的相关 | 第48-51页 |
3.3 讨论 | 第51-53页 |
4 结论与展望 | 第53-55页 |
4.1 本文主要结论 | 第53页 |
4.2 有待深入研究的问题 | 第53-54页 |
4.3 本文研究创新点 | 第54-55页 |
参考文献 | 第55-61页 |
研究生期间学术论文发表情况 | 第61-62页 |
致谢 | 第62页 |