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条斑紫菜丝状体黄斑病菌群特征及其与水体环境关系的研究

摘要第4-5页
Abstract第5-6页
引言第9-12页
1 综述第12-20页
    1.1 栽培型紫菜的主要病害第12-14页
    1.2 紫菜病害的研究方法第14-16页
    1.3 测序技术及其应用第16-18页
    1.4 本文主要研究内容第18-20页
2 条斑紫菜贝壳丝状附生菌群研究第20-32页
    2.1 材料与方法第21-22页
        2.1.1 样本采集和处理第21页
        2.1.2 DNA制备和 16S rDNA扩增第21页
        2.1.3 文库质量控制和测序第21页
        2.1.4 数据分析第21-22页
    2.2 结果第22-30页
        2.2.1 测序数据量和覆盖度第22-23页
        2.2.2 贝壳丝状体附生微生物组成第23-28页
        2.2.3 贝壳丝状体菌群的alpha多样性第28-29页
        2.2.4 贝壳丝状体菌群在样本间的聚类关系第29页
        2.2.5 患病贝壳丝状体菌群的物种变化第29-30页
    2.3 讨论第30-32页
3 丝状体育苗池的微生态变化第32-53页
    3.1 材料与方法第33-34页
        3.1.1 贝壳丝状体培养条件第33页
        3.1.2 育苗池水样采集第33页
        3.1.3 理化因子测定第33页
        3.1.4 总DNA抽提第33页
        3.1.5 基因扩增第33-34页
        3.1.6 高通量测序第34页
        3.1.7 数据处理和统计第34页
    3.2 结果第34-51页
        3.2.1 数据量和测序覆盖度第34-37页
        3.2.2 微生物群落多样性和聚类第37-39页
        3.2.3 细菌分类与群落组成第39-45页
        3.2.4 群落动态和疾病相关变化第45-48页
        3.2.5 水体理化因子的变化第48页
        3.2.6 微生物群落与环境因子的相关第48-51页
    3.3 讨论第51-53页
4 结论与展望第53-55页
    4.1 本文主要结论第53页
    4.2 有待深入研究的问题第53-54页
    4.3 本文研究创新点第54-55页
参考文献第55-61页
研究生期间学术论文发表情况第61-62页
致谢第62页

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