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7种榕小蜂的Argonaute蛋白基因的分子进化

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
一 绪论第11-26页
    1 Argonaute蛋白第11-20页
        1.1 Argonaute蛋白概述第11-12页
        1.2 Argonaute蛋白的结构第12-13页
        1.3 Argonaute蛋白的功能第13-20页
            1.3.1 核酸内切酶活性第13-14页
            1.3.2 Argonaute蛋白与表观遗传调控第14-16页
            1.3.3 Argonaute蛋白与mRNA转录和翻译水平的调控第16-19页
            1.3.4 Argonaute蛋白在胚胎发育中的作用第19-20页
            1.3.5 Argonaute蛋白与DNA双链损伤修复第20页
    2 榕小蜂概述第20-23页
        2.1 榕小蜂的生物学特性第20-22页
        2.2 榕小蜂与Argonaute蛋白第22-23页
    3 进化分析第23-25页
        3.1 核苷酸替代模型第23-24页
        3.2 氨基酸选择压力第24页
        3.3 选择压力分析工具PAML的概述第24-25页
    4 研究的目的和意义第25-26页
二 获得几种榕小蜂Argonaute蛋白基因的保守片段第26-42页
    1 材料与方法第26-29页
        1.1 材料第26-27页
            1.1.1 材料的采集地点和时间第26-27页
            1.1.2 榕小蜂的收集和保存第27页
        1.2 试剂第27-29页
            1.2.1 电泳缓冲液TAE的配制第28页
            1.2.2 LB培养基(Luria-Bertani)的配制第28-29页
        1.3 设备第29页
    2 方法第29-38页
        2.1 总RNA提取和cDNA合成第29-31页
            2.1.1 总RNA提取第30页
            2.1.2 第一链cDNA的合成第30-31页
        2.2 榕小蜂Argonaute蛋白基因保守片段的获取第31-38页
            2.2.1 简并引物的设计与配对第31-35页
            2.2.2 RT-PCR反应和RT-PCR产物的纯化第35-36页
            2.2.3 连接反应第36页
            2.2.4 转化第36-37页
            2.2.5 单克隆菌落筛选及菌落PCR第37-38页
    3 数据分析第38页
        3.1 保守片段序列分析第38页
    4 结果与分析第38-42页
        4.1 RT-PCR扩增保守片段第38-39页
        4.2 菌落PCR第39-40页
        4.3 数据分析第40-42页
三 获得几种榕小蜂Argonaute蛋白基因第42-55页
    1 材料第42页
    2 方法第42-48页
        2.1 获得榕小蜂Argonaute蛋白基因的保守片段侧翼基因第42-48页
            2.1.1 hiTAIL-PCR引物设计与合成第42-45页
            2.1.2 hiTAIL-PCR扩增第45-47页
            2.1.3 扩增产物的克隆、测序第47-48页
            2.1.4 基于高通量测序数据进行基因注释获得Argonaute蛋白核苷酸序列第48页
    3 数据分析第48-49页
        3.1 序列分析第48-49页
        3.2 选择压力分析第49页
    4 结果与分析第49-55页
        4.1 hiTAIL-PCR产物电泳第49-52页
        4.2 重组菌液PCR第52-53页
        4.3 序列整理和分析第53-55页
四 结果与分析第55-67页
    1 序列的结构域绘图第55-58页
    2 进化分析第58-61页
    3 选择压力分析第61-67页
五 讨论第67-71页
    1 几种榕小蜂的Argonaute蛋白基因保守片段的扩增第67页
    2 hiTAIL-PCR扩增Argonaute蛋白基因的长片段序列第67-68页
    3 选择压力分析第68-69页
    4 Argonaute蛋白的数目差异第69-71页
六结论第71-72页
参考文献第72-77页
附录第77-85页
致谢第85-87页
个人简历第87页

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