摘要 | 第5-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
一 绪论 | 第11-26页 |
1 Argonaute蛋白 | 第11-20页 |
1.1 Argonaute蛋白概述 | 第11-12页 |
1.2 Argonaute蛋白的结构 | 第12-13页 |
1.3 Argonaute蛋白的功能 | 第13-20页 |
1.3.1 核酸内切酶活性 | 第13-14页 |
1.3.2 Argonaute蛋白与表观遗传调控 | 第14-16页 |
1.3.3 Argonaute蛋白与mRNA转录和翻译水平的调控 | 第16-19页 |
1.3.4 Argonaute蛋白在胚胎发育中的作用 | 第19-20页 |
1.3.5 Argonaute蛋白与DNA双链损伤修复 | 第20页 |
2 榕小蜂概述 | 第20-23页 |
2.1 榕小蜂的生物学特性 | 第20-22页 |
2.2 榕小蜂与Argonaute蛋白 | 第22-23页 |
3 进化分析 | 第23-25页 |
3.1 核苷酸替代模型 | 第23-24页 |
3.2 氨基酸选择压力 | 第24页 |
3.3 选择压力分析工具PAML的概述 | 第24-25页 |
4 研究的目的和意义 | 第25-26页 |
二 获得几种榕小蜂Argonaute蛋白基因的保守片段 | 第26-42页 |
1 材料与方法 | 第26-29页 |
1.1 材料 | 第26-27页 |
1.1.1 材料的采集地点和时间 | 第26-27页 |
1.1.2 榕小蜂的收集和保存 | 第27页 |
1.2 试剂 | 第27-29页 |
1.2.1 电泳缓冲液TAE的配制 | 第28页 |
1.2.2 LB培养基(Luria-Bertani)的配制 | 第28-29页 |
1.3 设备 | 第29页 |
2 方法 | 第29-38页 |
2.1 总RNA提取和cDNA合成 | 第29-31页 |
2.1.1 总RNA提取 | 第30页 |
2.1.2 第一链cDNA的合成 | 第30-31页 |
2.2 榕小蜂Argonaute蛋白基因保守片段的获取 | 第31-38页 |
2.2.1 简并引物的设计与配对 | 第31-35页 |
2.2.2 RT-PCR反应和RT-PCR产物的纯化 | 第35-36页 |
2.2.3 连接反应 | 第36页 |
2.2.4 转化 | 第36-37页 |
2.2.5 单克隆菌落筛选及菌落PCR | 第37-38页 |
3 数据分析 | 第38页 |
3.1 保守片段序列分析 | 第38页 |
4 结果与分析 | 第38-42页 |
4.1 RT-PCR扩增保守片段 | 第38-39页 |
4.2 菌落PCR | 第39-40页 |
4.3 数据分析 | 第40-42页 |
三 获得几种榕小蜂Argonaute蛋白基因 | 第42-55页 |
1 材料 | 第42页 |
2 方法 | 第42-48页 |
2.1 获得榕小蜂Argonaute蛋白基因的保守片段侧翼基因 | 第42-48页 |
2.1.1 hiTAIL-PCR引物设计与合成 | 第42-45页 |
2.1.2 hiTAIL-PCR扩增 | 第45-47页 |
2.1.3 扩增产物的克隆、测序 | 第47-48页 |
2.1.4 基于高通量测序数据进行基因注释获得Argonaute蛋白核苷酸序列 | 第48页 |
3 数据分析 | 第48-49页 |
3.1 序列分析 | 第48-49页 |
3.2 选择压力分析 | 第49页 |
4 结果与分析 | 第49-55页 |
4.1 hiTAIL-PCR产物电泳 | 第49-52页 |
4.2 重组菌液PCR | 第52-53页 |
4.3 序列整理和分析 | 第53-55页 |
四 结果与分析 | 第55-67页 |
1 序列的结构域绘图 | 第55-58页 |
2 进化分析 | 第58-61页 |
3 选择压力分析 | 第61-67页 |
五 讨论 | 第67-71页 |
1 几种榕小蜂的Argonaute蛋白基因保守片段的扩增 | 第67页 |
2 hiTAIL-PCR扩增Argonaute蛋白基因的长片段序列 | 第67-68页 |
3 选择压力分析 | 第68-69页 |
4 Argonaute蛋白的数目差异 | 第69-71页 |
六结论 | 第71-72页 |
参考文献 | 第72-77页 |
附录 | 第77-85页 |
致谢 | 第85-87页 |
个人简历 | 第87页 |