| 摘要 | 第2-3页 |
| ABSTRACT | 第3页 |
| 第一章 绪论：血清蛋白质组学在乳腺癌研究中的应用 | 第6-15页 |
| 1.1 血清蛋白质组学研究中的技术 | 第6-7页 |
| 1.2 血清蛋白质组学在乳腺癌研究中的应用 | 第7-11页 |
| 1.2.1 血清蛋白质组学在乳腺癌早期诊断中的应用 | 第8-10页 |
| 1.2.1.1 应用SELDI-TOF 技术 | 第8-9页 |
| 1.2.1.2 应用其它蛋白质分离方法结合MS 的技术 | 第9-10页 |
| 1.2.2 血清蛋白质组学在乳腺癌转移预后预测中的应用 | 第10页 |
| 1.2.3 血清蛋白质组学在乳腺癌研究中所获数据的分析 | 第10-11页 |
| 1.3 前景与展望 | 第11-15页 |
| 第二章 乳腺癌样品库的建立 | 第15-21页 |
| 2.1 蛋白质组学对于样品库建设的要求 | 第15-16页 |
| 2.1.1 差异表达蛋白质的干扰来源 | 第15-16页 |
| 2.1.2 HUPO PPP 的实践 | 第16页 |
| 2.2 样品库建设 | 第16-21页 |
| 2.2.1 样品收集方法 | 第18-19页 |
| 2.2.2 乳腺癌样品库建设进展 | 第19-21页 |
| 第三章 血清蛋白质组学的质谱分析与数据分析 | 第21-45页 |
| 3.1 质谱分析 | 第21-24页 |
| 3.1.1 实验方法 | 第21-23页 |
| 3.1.1.1 血清 | 第21页 |
| 3.1.1.2 乙醇沉淀去除白蛋白 | 第21-22页 |
| 3.1.1.3 蛋白质样品的酶解 | 第22页 |
| 3.1.1.4 强阳离子交换(Strong Cation Exchange, SCX)液相色谱 | 第22页 |
| 3.1.1.5 LC-MS/MS | 第22页 |
| 3.1.1.6 蛋白质的鉴定 | 第22-23页 |
| 3.1.2 实验结果 | 第23-24页 |
| 3.2 数据分析 | 第24-32页 |
| 3.2.1 分析方法 | 第24-27页 |
| 3.2.1.1 t 检验 | 第24-25页 |
| 3.2.1.2 方差分析（ANOVA） | 第25页 |
| 3.2.1.3 分层聚类分析（Hierarchical Clustering Analysis, HCA） | 第25-26页 |
| 3.2.1.4 主成分分析（Principal Component Analysis, PCA） | 第26-27页 |
| 3.2.1.5 K-均值聚类（K-means clustering） | 第27页 |
| 3.2.2 分析结果 | 第27-32页 |
| 3.2.2.1 t-test 筛选两组之间的显著差异蛋白质 | 第28-29页 |
| 3.2.2.2 ANOVA 筛选三组之间的显著差异蛋白 | 第29页 |
| 3.2.2.3 组间聚类分析 | 第29-31页 |
| 3.2.2.4 K-means 分析三组间差异蛋白质的变化趋势 | 第31-32页 |
| 3.3 确定候选生物标志物蛋白质 | 第32-45页 |
| 3.3.1 筛选原则 | 第32-33页 |
| 3.3.2 待验证蛋白 | 第33-45页 |
| 3.3.2.1 A1BG | 第33-34页 |
| 3.3.2.2 Mimecan | 第34-45页 |
| 第四章 实验验证 | 第45-59页 |
| 4.1 酶联免疫吸附实验(Enzyme Linked ImmunoSorbent Assay,ELISA) 介绍 | 第45-50页 |
| 4.1.1 ELISA 原理 | 第45页 |
| 4.1.2 ELISA 类型 | 第45-48页 |
| 4.1.3 主要试剂 | 第48-50页 |
| 4.2 实验器材与试剂 | 第50-51页 |
| 4.2.1 实验器材 | 第50页 |
| 4.2.2 实验试剂 | 第50-51页 |
| 4.3 实验准备 | 第51页 |
| 4.3.1 整理样品资料 | 第51页 |
| 4.3.2 样品分装 | 第51页 |
| 4.4 实验步骤 | 第51-53页 |
| 4.5 结果和讨论 | 第53-57页 |
| 4.5.1 血清中 A1BG 含量测定 | 第53-56页 |
| 4.5.2 血清中Mimecan 含量测定 | 第56-57页 |
| 4.6 结论 | 第57-59页 |
| 第五章 总结与展望 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文 | 第66-68页 |
