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拟南芥中MBD7参与调控ROS1介导的DNA去甲基化机制的研究

摘要第4-5页
Abstract第5页
第一章 文献综述第10-29页
    1.1 DNA甲基化第10-15页
        1.1.1 动物中DNA甲基化的建立第10-11页
        1.1.2 植物中DNA甲基化的建立第11-13页
        1.1.3 DNA甲基化的维持第13-15页
    1.2 DNA去甲基化第15-22页
        1.2.1 DNA去甲基化的意义第15-17页
        1.2.2 DNA主动去甲基化第17-20页
        1.2.3 DNA去甲基化酶的招募第20-22页
    1.3 MBD蛋白家族研究进展第22-28页
        1.3.1 动物中的MBD蛋白第22-25页
        1.3.2 植物中的MBD蛋白第25-28页
    1.4 本研究的目的和意义第28-29页
第二章 实验材料与方法第29-57页
    2.1 主要实验材料第29-31页
        2.1.1 植物材料第29页
        2.1.2 菌类材料及载体第29页
        2.1.3 实验试剂第29-30页
        2.1.4 实验仪器第30-31页
    2.2 植物和菌体的培养第31-32页
        2.2.1 培养基的配制第31页
        2.2.2 植物的培养第31页
        2.2.3 菌体的培养第31-32页
    2.3 mbd7突变体的获得第32-33页
        2.3.1 突变体筛选第32页
        2.3.2 突变体遗传学分析第32-33页
    2.4 图位克隆第33-36页
        2.4.1 构建克隆群体第33页
        2.4.2 植物DNA提取第33页
        2.4.3 图位克隆第33-35页
        2.4.4 图位克隆引物第35-36页
    2.5 构建载体第36-41页
        2.5.1 片段和载体信息第36-37页
        2.5.2 构建载体引物第37页
        2.5.3 目的片段准备第37-38页
        2.5.4 酶切和连接第38-39页
        2.5.5 制备大肠杆菌感受态细胞第39-40页
        2.5.6 大肠杆菌热击转化第40页
        2.5.7 鉴定阳性克隆第40-41页
    2.6 农杆菌介导的拟南芥转化第41-42页
        2.6.1 制备农杆菌热击感受态第41页
        2.6.2 农杆菌热击转化第41-42页
        2.6.3 农杆菌转染拟南芥第42页
        2.6.4 转基因植株的筛选第42页
    2.7 mbd7突变体的互补实验第42页
    2.8 亚细胞定位和组织定位第42-43页
        2.8.1 MBD7的亚细胞定位第42-43页
        2.8.2 GUS基因表达的组织化学定位第43页
    2.9 植物RNA相关实验的分析方法第43-45页
        2.9.1 TRIzol法提取植物总RNA第43-44页
        2.9.2 RNA反转录第44页
        2.9.3 实时荧光定量PCR第44-45页
        2.9.4 实时荧光定量PCR引物第45页
    2.10 DNA甲基化分析方法第45-49页
        2.10.1 DNA甲基化抑制剂5-Aza-dC相关实验第45-46页
        2.10.2 特异位点的DNA甲基化水平分析第46-48页
        2.10.3 基因组DNA甲基化水平分析第48-49页
    2.11 蛋白质相互作用分析方法第49-54页
        2.11.1 萤火虫荧光素酶互补实验第49页
        2.11.2 酵母双杂交实验第49-50页
        2.11.3 pull-down第50-52页
        2.11.4 免疫共沉淀实验第52-54页
    2.12 DNA体内结合实验第54-57页
        2.12.1 试剂配制第54-55页
        2.12.2 实验步骤第55-57页
第三章 实验结果与分析第57-85页
    3.1 mbd7突变体的筛选和表型分析第57-61页
        3.1.1 突变体的筛选第57-59页
        3.1.2 突变体的表型分析第59-61页
    3.2 mbd7突变体的图位克隆和互补第61-63页
        3.2.1 mbd7突变体的图位克隆第61-62页
        3.2.2 mbd7突变体的互补实验第62-63页
    3.3 MBD7蛋白的亚细胞定位和MBD7基因的组织定位第63-65页
        3.3.1 MBD7蛋白的亚细胞定位第63-64页
        3.3.2 MBD7基因的组织定位第64-65页
    3.4 MBD7对pro35S::NPTII位点的调控第65-68页
        3.4.1 DNA甲基化抑制剂处理释放pro35S::NPTII位点的沉默第65-66页
        3.4.2 mbd7突变体中T-DNA位点上DNA甲基化的变化第66-68页
    3.5 MBD7参与基因组特定位点上的DNA去甲基化第68-73页
        3.5.1 mbd7突变体全基因组的DNA甲基化变化第68-71页
        3.5.2 MBD7调控位点的特征第71-73页
    3.6 MBD7与ROS1、ROS4/IDM1、ROS5/IDM2在参与DNA去甲基化中的关系第73-80页
        3.6.1 MBD7与ROS5/IDM2在参与DNA去甲基化中的关系第74-77页
        3.6.2 MBD7与ROS1、ROS4/IDM1不直接相互作用第77-78页
        3.6.3 MBD7与ROS1、ROS4/IDM1、ROS5/IDM2共同抑制DNA甲基化过度积累第78-79页
        3.6.4 MBD7、ROS1、ROS4/IDM1和ROS5/IDM2调控位点在基因组上的分布第79-80页
    3.7 MBD7对内源作用位点的结合第80-85页
        3.7.1 MBD7体内结合实验的检测位点第80-83页
        3.7.2 MBD7对内源作用位点的结合第83-85页
第四章 讨论与结论第85-91页
    4.1 结果讨论第85-90页
        4.1.1 MBD7参与DNA去甲基化的作用机制第85-86页
        4.1.2 MBD7调控DNA去甲基化位点的特征第86-87页
        4.1.3 MBD7对pro35S::NPTII转基因位点的调控第87-89页
        4.1.4 MBD7在动植物MBD蛋白研究中的意义第89-90页
    4.2 结论第90-91页
参考文献第91-104页
致谢第104-106页
作者简历第106页

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