| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-34页 |
| 1.1 植物应对逆境胁迫的策略 | 第14-15页 |
| 1.2 植物非生物逆境胁迫应答反应 | 第15-19页 |
| 1.2.1 植物非生物逆境胁迫应答信号途径 | 第15-16页 |
| 1.2.2 植物非生物逆境胁迫应答信号分子 | 第16-18页 |
| 1.2.3 植物非生物逆境胁迫应答反应的多样性 | 第18-19页 |
| 1.3 植物生物逆境胁迫应答反应 | 第19-26页 |
| 1.3.1 植物与病原菌的相互作用 | 第19-23页 |
| 1.3.2 植物与害虫的相互作用 | 第23-24页 |
| 1.3.3 植物防御反应中的茉莉酸和水杨酸信号路径 | 第24-26页 |
| 1.4 植物生物胁迫与非生物胁迫应答的交互作用 | 第26-29页 |
| 1.4.1 植物激素在生物逆境和非生物逆境信号路径中的交互作用 | 第27-28页 |
| 1.4.2 转录因子的作用 | 第28-29页 |
| 1.5 植物防御反应与生长发育的平衡 | 第29-31页 |
| 1.6 研究目的与意义 | 第31-34页 |
| 第二章 棉花多逆境响应基因的挖掘 | 第34-39页 |
| 2.1 实验材料 | 第34页 |
| 2.2 实验方法 | 第34-35页 |
| 2.2.1 拟南芥多逆境响应基因的分离 | 第34页 |
| 2.2.2 棉花多逆境响应基因的分离 | 第34页 |
| 2.2.3 棉花ABA，NaCl以及冷处理 | 第34页 |
| 2.2.4 RNA提取及qRT-PCR | 第34-35页 |
| 2.3 结果与分析 | 第35-38页 |
| 2.3.1 利用GENEVESTIGATOR分离拟南芥多逆境响应基因 | 第35页 |
| 2.3.2 同源法分离候选棉花多逆境响应基因 | 第35-36页 |
| 2.3.3 棉花候选多逆境响应基因的表达分析 | 第36-38页 |
| 2.4 讨论 | 第38-39页 |
| 第三章 棉花GhATAF1基因的克隆和功能分析 | 第39-56页 |
| 3.1 前言 | 第39页 |
| 3.2 实验材料和方法 | 第39-42页 |
| 3.2.1 实验材料 | 第39页 |
| 3.2.2 实验方法 | 第39-42页 |
| 3.3 结果和分析 | 第42-53页 |
| 3.3.1 GhATAF1基因的克隆及序列比较 | 第42页 |
| 3.3.2 GhATAF1受MeJA，SA以及黄萎病菌诱导表达 | 第42-45页 |
| 3.3.3 GhATAF1蛋白亚细胞定位及蛋白转录自激活活性 | 第45-46页 |
| 3.3.4 超量表达GhATAF1转基因棉花的获得及鉴定 | 第46-47页 |
| 3.3.5 超量表达GhATAF1增强了棉花的抗盐性 | 第47-50页 |
| 3.3.6 GhATAF1超表达棉花株系削弱了对灰霉菌和大丽轮枝菌的抗性 | 第50页 |
| 3.3.7 GhATAF1抑制茉莉酸信号，激活水杨酸信号 | 第50-53页 |
| 3.4 讨论 | 第53-56页 |
| 第四章 棉花GhJAZ2基因的克隆和功能分析 | 第56-86页 |
| 4.1 前言 | 第56页 |
| 4.2 实验材料和方法 | 第56-59页 |
| 4.2.1 实验材料 | 第56-57页 |
| 4.2.2 实验方法 | 第57-59页 |
| 4.3 结果和分析 | 第59-82页 |
| 4.3.1 GhJAZ2基因的克隆及序列比较 | 第59-61页 |
| 4.3.2 GhJAZ2受MeJA，SA以及黄萎病菌诱导表达 | 第61页 |
| 4.3.3 GhJAZ2蛋白定位在细胞核且受MeJA诱导降解 | 第61-62页 |
| 4.3.4 GhJAZ2超表达棉花株系和干涉棉花株系的获得及检测 | 第62页 |
| 4.3.5 GhJAZ2削弱棉花的茉莉酸敏感度 | 第62-64页 |
| 4.3.6 GhJAZ2削弱棉花抗病性和抗虫性 | 第64-67页 |
| 4.3.7 GhJAZ2互作蛋白筛选 | 第67-69页 |
| 4.3.8 GhMYC2-like正调控棉花茉莉酸信号和对黄萎病菌的抗性 | 第69-70页 |
| 4.3.9 GhJAZ2抑制棉花抗病性依赖于GhMYC2-like | 第70-72页 |
| 4.3.10 GhJAZ2和GhJAZ12能够抑制GhMYC2-like的转录活性 | 第72-74页 |
| 4.3.11 GhJAZs在棉花中存在功能冗余 | 第74-76页 |
| 4.3.12 GhJAZ2调控棉花雄蕊发育和抗逆性 | 第76-77页 |
| 4.3.13 GhJAZ2抑制种子大小，促进棉花种子萌发 | 第77-79页 |
| 4.3.14 GhJAZ2调控棉花果枝夹角 | 第79页 |
| 4.3.15 GhJAZ2不同结构域的功能 | 第79-82页 |
| 4.4 讨论 | 第82-86页 |
| 4.4.1 GhJAZ2通过直接抑制GhMYC2-like和GhPR10，GhR1，GhD2等抗病基因负调控棉花抗病和抗虫性 | 第82-83页 |
| 4.4.2 GhJAZ2可能通过调控赤霉素信号调控棉花种子萌发 | 第83-84页 |
| 4.4.3 GhJAZ2可能通过PIF调控棉花果枝夹角 | 第84-85页 |
| 4.4.4 GhJAZ2参与棉花高温胁迫应答和雄蕊发育 | 第85-86页 |
| 第五章 棉花GhHB12基因的克隆和功能分析 | 第86-128页 |
| 5.1 前言 | 第86页 |
| 5.2 实验材料和方法 | 第86-90页 |
| 5.2.1 实验材料 | 第86-87页 |
| 5.2.2 实验方法 | 第87-90页 |
| 5.3 结果和分析 | 第90-122页 |
| 5.3.1 GhHB12基因的克隆及序列比较 | 第90-92页 |
| 5.3.2 GhHB12受MeJA，SA以及黄萎病菌诱导表达 | 第92-93页 |
| 5.3.3 GhHB12启动子分析 | 第93-94页 |
| 5.3.4 GhHB12超表达棉花株系和RNAi干涉棉花株系的获得及检测 | 第94-95页 |
| 5.3.5 GhHB12负调控拟南芥和棉花的抗逆性 | 第95-98页 |
| 5.3.6 GhHB12负调控棉花抗病性 | 第98-100页 |
| 5.3.7 GhHB12影响棉花的株型和花期 | 第100-101页 |
| 5.3.8 GhHB12影响棉花产量和纤维品质 | 第101-102页 |
| 5.3.9 GhHB12调控棉花叶片发育 | 第102-103页 |
| 5.3.10 GhHB12互作蛋白筛选 | 第103页 |
| 5.3.11 GhHB12与GhTCP1的遗传关系 | 第103-108页 |
| 5.3.12 GhHB12抑制棉花生长素信号 | 第108-111页 |
| 5.3.13 GhHB12与GhMiR157-GhSPLs的遗传关系 | 第111-116页 |
| 5.3.14 GhFT、GhSOC1和GhFUL是GhHB12关键靶基因 | 第116-119页 |
| 5.3.15 GhHB12参与棉花光周期反应 | 第119-122页 |
| 5.3.16 GhHB12等调控棉花株型和开花基因在不同棉种中的表达 | 第122页 |
| 5.4 讨论 | 第122-128页 |
| 5.4.1 棉花驯化过程关键基因的选择 | 第122-124页 |
| 5.4.2 棉花顶端优势与侧枝伸长的关系 | 第124-125页 |
| 5.4.3 棉花叶枝、果枝发育和花期的关系 | 第125-126页 |
| 5.4.4 GhHB12基因的多效性 | 第126-128页 |
| 参考文献 | 第128-144页 |
| 附录 | 第144-155页 |
| 附录1 载体构建 | 第144-146页 |
| 附录2 DNA提取及Southern杂交 | 第146-147页 |
| 附录3 RNA提取（改良的异硫氰酸胍法）及Northern杂交 | 第147-149页 |
| 附录4 RNA反转录及qRT-PCR | 第149-150页 |
| 附录5 酵母双杂交实验 | 第150-151页 |
| 附录6 原生质体的分离及双分子荧光互补实验 | 第151-152页 |
| 附录7 双荧光素酶报告基因检测（Dual-luciferase Reporter Assay System） | 第152-153页 |
| 附录8 总可溶性酚和木质素含量测定 | 第153-155页 |
| 攻读学位论文期间发表和待发表的论文 | 第155-157页 |
| 致谢 | 第157-159页 |
