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Cu,Zn-SOD的理性设计及热稳定性研究

英文缩略词第3-4页
摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 绪论第11-23页
    1.1 概述第11-12页
    1.2 SOD的分类第12页
    1.3 Cu,Zn-SOD结构第12-13页
    1.4 SOD的催化作用机制第13-14页
    1.5 SOD的基因工程研究及分子改造进展第14-15页
    1.6 Cu,Zn-SOD突变与疾病第15-16页
    1.7 SOD的应用第16-17页
        1.7.1 SOD在临床上的应用第16-17页
        1.7.2 SOD在工业上的应用第17页
        1.7.3 SOD在农业上的应用第17页
    1.8 生物信息学辅助蛋白质分子的理性设计第17-21页
        1.8.1 PDB数据库第17-18页
        1.8.2 虚拟氨基酸突变提高蛋白质热稳定性第18页
        1.8.3 突变前后蛋白质折叠自由能的计算第18-19页
        1.8.4 分子动力学模拟(MD)第19-21页
    1.9 本课题技术路线及意义第21-23页
第二章 Cu,Zn-SOD突变体的理性设计第23-31页
    2.1 模型与方法第23-25页
        2.1.1 计算平台第23页
        2.1.2 热稳定性氨基酸突变预测第23-24页
        2.1.3 氨基酸虚拟突变第24-25页
        2.1.4 分子动力学模拟(MD)第25页
    2.2 结果与分析第25-30页
        2.2.1 小鼠Cu,Zn-SOD非保守氨基酸序列的确定第25-26页
        2.2.2 突变位点的热稳定性预测第26-27页
        2.2.3 分子动力学结果分析第27-30页
    本章小结第30-31页
第三章 Cu,Zn-SOD和MCu,Zn-SOD基因克隆、表达及蛋白稳定性测定第31-57页
    3.1 实验材料及方法第31-44页
        3.1.1 实验动物第31页
        3.1.2 菌株及载体第31-32页
        3.1.3 培养基及相关试剂配置第32-34页
        3.1.4 主要试剂及用品第34页
        3.1.5 仪器与设备第34页
        3.1.6 小鼠血液RNA的提取第34-35页
        3.1.7 RNA的反转录第35页
        3.1.8 设计扩增引物第35页
        3.1.9 PCR反应体系第35-36页
        3.1.10 突变基因的获取第36-38页
        3.1.11 扩增基因的检测方法第38页
        3.1.12 基因产物的回收第38页
        3.1.13 感受态细胞的制备(氯化钙法)第38-39页
        3.1.14 双酶切第39页
        3.1.15 目的基因与载体的连接第39-40页
        3.1.16 转化第40页
        3.1.17 菌液PCR第40页
        3.1.18 提取质粒第40页
        3.1.19 重组质粒检测第40页
        3.1.20 超氧化物歧化酶基因的测序第40-41页
        3.1.21 突变型质粒的构建第41页
        3.1.22 重组质粒转化表达菌BL21(DE3)感受态第41页
        3.1.23 导入重组质粒的BL21的检测第41页
        3.1.24 BL21转化菌的诱导表达及蛋白可溶性检测第41页
        3.1.25 SDS-PAGE凝胶电泳第41-42页
        3.1.26 亲和层析纯化可溶性表达的蛋白第42-43页
        3.1.27 蛋白质浓度的测定(Lowry法)第43页
        3.1.28 蛋白质透析第43页
        3.1.29 Cu,Zn-SOD酶活力测定第43-44页
        3.1.30 Cu,Zn-SOD热稳定性的测定第44页
    3.2 结果与分析第44-55页
        3.2.1 野生型Cu,Zn-SOD基因的获取第44-45页
        3.2.2 野生型重组质粒(pGEX6p1WT-SOD)的检测第45-46页
        3.2.3 pGEX6p1WT-SOD重组质粒的双酶切检测第46页
        3.2.4 Cu,Zn-SOD基因的测序结果第46-47页
        3.2.5 突变基因重组质粒的构建第47-51页
        3.2.6 重组质粒的诱导表达及表达产物的鉴定第51-53页
        3.2.7 蛋白质浓度测定第53-54页
        3.2.8 酶活力测定第54-55页
        3.2.9 热稳定性的比较第55页
    本章小结第55-57页
第四章 讨论与展望第57-59页
    4.1 Cu,Zn-SOD突变位点的选择第57页
    4.2 分子动力学模拟时间长短第57页
    4.3 基因突变与疾病第57-58页
    4.4 酶活测定的温度选择第58页
    4.5 Cu,Zn-SOD稳定性第58页
    4.6 展望第58-59页
参考文献第59-67页
在校期间研究成果及发表论文第67-68页
致谢第68页

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