摘要 | 第3-6页 |
Abstract | 第6-8页 |
英文缩写词及中文对照 | 第9-14页 |
1 前言 | 第14-24页 |
1.1 昆虫免疫系统的概述 | 第14-17页 |
1.1.1 细胞免疫 | 第14-15页 |
1.1.2 体液免疫 | 第15-17页 |
1.2 模式识别受体 | 第17-18页 |
1.3 PGRPS的研究进展 | 第18-21页 |
1.3.1 PGRP的发现 | 第18页 |
1.3.2 PGRP的类型和结构 | 第18-20页 |
1.3.3 PGRPs在昆虫先天免疫中的作用 | 第20-21页 |
1.4 RNAI技术及其应用 | 第21-22页 |
1.5 DGE在昆虫研究中的应用 | 第22-23页 |
1.6 本研究的意义及其立题依据 | 第23-24页 |
2 实验材料和方法 | 第24-52页 |
2.1 实验材料 | 第24-27页 |
2.1.1 供试昆虫 | 第24页 |
2.1.2 质粒与菌株 | 第24页 |
2.1.3 主要仪器设备 | 第24-25页 |
2.1.4 主要试剂药品 | 第25页 |
2.1.5 主要培养基 | 第25-26页 |
2.1.6 主要试剂的配制 | 第26-27页 |
2.2 实验方法 | 第27-29页 |
2.2.1 小菜蛾的饲喂 | 第27页 |
2.2.2 Bt菌液的配置 | 第27页 |
2.2.3 Bt对于小菜蛾LC50的测定 | 第27页 |
2.2.4 处理与收集样品 | 第27页 |
2.2.5 RNA的提取 | 第27-28页 |
2.2.6 测序文库的构建和上机 | 第28-29页 |
2.3 DGE数据分析流程 | 第29-32页 |
2.3.1 原始数据处理 | 第29页 |
2.3.2 去除杂质数据 | 第29-30页 |
2.3.3 Clean Reads数据 | 第30页 |
2.3.4 与参考基因组进行比对分析 | 第30-31页 |
2.3.5 测序饱和度分析 | 第31页 |
2.3.6 测序随机性分析 | 第31页 |
2.3.7 基因功能注释 | 第31页 |
2.3.8 差异表达基因筛选 | 第31-32页 |
2.3.9 差异表达基因引物设计及Quantitative Real-time PCR(q RT-PCR)检测 | 第32页 |
2.4 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因的克隆及序列分析 | 第32-41页 |
2.4.1 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2 Unigene的克隆 | 第32-38页 |
2.4.2 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因全长序列的获得 | 第38-41页 |
2.5 小菜蛾PGRP-LB1和PGRP-LB2基因的时空表达特异性 | 第41-43页 |
2.5.1 Bt菌液的配制 | 第41页 |
2.5.2 处理与收集样品 | 第41页 |
2.5.3 Real-Time荧光定量PCR | 第41-43页 |
2.6 小菜蛾PGRP-LB1和PGRP-LB2基因的RNAI | 第43-52页 |
2.6.1 L4440-PGRP-LB1和L4440-PGRP-LB2重组表达载体的构建 | 第43-48页 |
2.6.2 大肠杆菌(E. coli)HT115(DE3)表达ds RNA方法 | 第48-50页 |
2.6.3 小菜蛾饲喂RNAi | 第50-52页 |
3 结果和分析 | 第52-79页 |
3.1 BT对小菜蛾LC50的测定 | 第52页 |
3.2 基因表达谱测序结果 | 第52-63页 |
3.2.1 测序质量评估 | 第52-54页 |
3.2.2 测序饱和度分析 | 第54-55页 |
3.2.3 测序随机性分析 | 第55-56页 |
3.2.4 差异表达分析 | 第56-60页 |
3.2.5 GO功能显著性富集分析 | 第60-61页 |
3.2.6 差异表达基因的q RT-PCR验证 | 第61-63页 |
3.3 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因CDNA全长的克隆和序列分析 | 第63-69页 |
3.3.1 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2 Unigene序列的克隆 | 第63-66页 |
3.3.2 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因c DNA全长的克隆 | 第66-67页 |
3.3.3 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因c DNA全序列的拼接和分析 | 第67-69页 |
3.4 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因进化关系分析及同源性比较 | 第69-72页 |
3.5 基因的表达模式分析 | 第72-77页 |
3.5.1 PGRP-LB1和PGRP-LB2基因在注射活的Bt后的表达情况 | 第72-75页 |
3.5.2 抗菌肽基因在注射活的Bt后的表达情况 | 第75-77页 |
3.6 RNAI实验结果 | 第77-79页 |
3.6.1 L4440-Px PGRP-LB1和L4440-Px PGRP-LB2重组表达载体的成功构建 | 第77页 |
3.6.2 L4440- Px PGRP-LB1和L4440-Px PGRP-LB2在大肠杆菌HT115中的鉴定 | 第77-78页 |
3.6.3 饲喂ds RNA对小菜蛾存活率的影响 | 第78-79页 |
4 结论与讨论 | 第79-82页 |
4.1 结论 | 第79-80页 |
4.2 讨论 | 第80-81页 |
4.3 本研究的创新点 | 第81页 |
4.4 需要进一步探讨的问题 | 第81-82页 |
致谢 | 第82-84页 |
参考文献 | 第84-90页 |
附录 1:PMD18-VECTOR MAP | 第90-91页 |
附录 2:L4440- VECTOR MAP | 第91-92页 |
附录 3:引物序列列表 | 第92-94页 |
附录 4:差异基因的GO分类分析 | 第94-96页 |
附录 5:攻读硕士期间发表论文情况 | 第96页 |