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小菜蛾免疫Bt动力学的DGE分析及其PGRP-LB基因的克隆

摘要第3-6页
Abstract第6-8页
英文缩写词及中文对照第9-14页
1 前言第14-24页
    1.1 昆虫免疫系统的概述第14-17页
        1.1.1 细胞免疫第14-15页
        1.1.2 体液免疫第15-17页
    1.2 模式识别受体第17-18页
    1.3 PGRPS的研究进展第18-21页
        1.3.1 PGRP的发现第18页
        1.3.2 PGRP的类型和结构第18-20页
        1.3.3 PGRPs在昆虫先天免疫中的作用第20-21页
    1.4 RNAI技术及其应用第21-22页
    1.5 DGE在昆虫研究中的应用第22-23页
    1.6 本研究的意义及其立题依据第23-24页
2 实验材料和方法第24-52页
    2.1 实验材料第24-27页
        2.1.1 供试昆虫第24页
        2.1.2 质粒与菌株第24页
        2.1.3 主要仪器设备第24-25页
        2.1.4 主要试剂药品第25页
        2.1.5 主要培养基第25-26页
        2.1.6 主要试剂的配制第26-27页
    2.2 实验方法第27-29页
        2.2.1 小菜蛾的饲喂第27页
        2.2.2 Bt菌液的配置第27页
        2.2.3 Bt对于小菜蛾LC50的测定第27页
        2.2.4 处理与收集样品第27页
        2.2.5 RNA的提取第27-28页
        2.2.6 测序文库的构建和上机第28-29页
    2.3 DGE数据分析流程第29-32页
        2.3.1 原始数据处理第29页
        2.3.2 去除杂质数据第29-30页
        2.3.3 Clean Reads数据第30页
        2.3.4 与参考基因组进行比对分析第30-31页
        2.3.5 测序饱和度分析第31页
        2.3.6 测序随机性分析第31页
        2.3.7 基因功能注释第31页
        2.3.8 差异表达基因筛选第31-32页
        2.3.9 差异表达基因引物设计及Quantitative Real-time PCR(q RT-PCR)检测第32页
    2.4 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因的克隆及序列分析第32-41页
        2.4.1 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2 Unigene的克隆第32-38页
        2.4.2 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因全长序列的获得第38-41页
    2.5 小菜蛾PGRP-LB1和PGRP-LB2基因的时空表达特异性第41-43页
        2.5.1 Bt菌液的配制第41页
        2.5.2 处理与收集样品第41页
        2.5.3 Real-Time荧光定量PCR第41-43页
    2.6 小菜蛾PGRP-LB1和PGRP-LB2基因的RNAI第43-52页
        2.6.1 L4440-PGRP-LB1和L4440-PGRP-LB2重组表达载体的构建第43-48页
        2.6.2 大肠杆菌(E. coli)HT115(DE3)表达ds RNA方法第48-50页
        2.6.3 小菜蛾饲喂RNAi第50-52页
3 结果和分析第52-79页
    3.1 BT对小菜蛾LC50的测定第52页
    3.2 基因表达谱测序结果第52-63页
        3.2.1 测序质量评估第52-54页
        3.2.2 测序饱和度分析第54-55页
        3.2.3 测序随机性分析第55-56页
        3.2.4 差异表达分析第56-60页
        3.2.5 GO功能显著性富集分析第60-61页
        3.2.6 差异表达基因的q RT-PCR验证第61-63页
    3.3 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因CDNA全长的克隆和序列分析第63-69页
        3.3.1 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2 Unigene序列的克隆第63-66页
        3.3.2 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因c DNA全长的克隆第66-67页
        3.3.3 Px PGRP-LB1和Px PGRP-LB2基因c DNA全序列的拼接和分析第67-69页
    3.4 PXPGRP-LB1和PXPGRP-LB2基因进化关系分析及同源性比较第69-72页
    3.5 基因的表达模式分析第72-77页
        3.5.1 PGRP-LB1和PGRP-LB2基因在注射活的Bt后的表达情况第72-75页
        3.5.2 抗菌肽基因在注射活的Bt后的表达情况第75-77页
    3.6 RNAI实验结果第77-79页
        3.6.1 L4440-Px PGRP-LB1和L4440-Px PGRP-LB2重组表达载体的成功构建第77页
        3.6.2 L4440- Px PGRP-LB1和L4440-Px PGRP-LB2在大肠杆菌HT115中的鉴定第77-78页
        3.6.3 饲喂ds RNA对小菜蛾存活率的影响第78-79页
4 结论与讨论第79-82页
    4.1 结论第79-80页
    4.2 讨论第80-81页
    4.3 本研究的创新点第81页
    4.4 需要进一步探讨的问题第81-82页
致谢第82-84页
参考文献第84-90页
附录 1:PMD18-VECTOR MAP第90-91页
附录 2:L4440- VECTOR MAP第91-92页
附录 3:引物序列列表第92-94页
附录 4:差异基因的GO分类分析第94-96页
附录 5:攻读硕士期间发表论文情况第96页

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