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富营养化沉积物生物修复及生物扰动对微生物群落结构的影响

摘要第4-7页
ABSTRACT第7-10页
引言第14-15页
第一章 生境修复研究及生物扰动研究进展第15-27页
    一、我国海洋富营养化趋势及生境修复研究进展第15-23页
        1. 滩涂的富营养化现状及原因第15-16页
        2. 富营养化生物修复研究进展第16-21页
        3. 研究展望第21-23页
    二、生物扰动对沉积物氮循环及微生物群落结构的影响第23-27页
        1. 生物扰动对沉积物氮循环影响的生态学意义第23-24页
        2. 生物扰动对氮循环影响的研究进展第24-27页
第二章 海洋异养好氧硝化―反硝化细菌的筛选、鉴定及能力测试第27-38页
    1. 前言第27页
    2. 材料与方法第27-30页
        2.1 样品及培养基第27-28页
        2.2 好氧反硝化细菌的筛选和分离第28页
        2.3 菌株的鉴定第28-29页
        2.4 系统进化树的构建第29页
        2.5 氮盐去除能力测试第29页
        2.6 pH、盐度及C:N对菌株去除氮能力的影响第29-30页
        2.7 细菌浓度和氮盐的分析方法第30页
        2.8 统计学分析第30页
    3. 结果第30-35页
        3.1 细菌的筛选及鉴定第30-32页
        3.2 氮的去除能力比较第32-34页
        3.3 不同因子对菌株去除能力的影响第34-35页
    4. 讨论第35-38页
        4.1 细菌的鉴定第35-36页
        4.2 MD5和MD8去除氮的特性第36页
        4.3 不同因子对菌株去除氮能力的影响第36-38页
第三章 实验室条件下生物扰动、物理扰动及微生物强化的组合作用对沉积物中营养盐去除的研究第38-53页
    1. 前言第38页
    2. 材料与方法第38-41页
        2.1 材料第38-39页
        2.2 实验设置第39-40页
        2.3 实验参数的分析第40页
        2.4 数据分析第40-41页
    3. 结果第41-51页
        3.1 单因素实验第41-42页
        3.2 多因素分析第42-51页
    4. 讨论第51-53页
        4.1 不同因子对沉积物中氮磷的影响第51页
        4.2 因子之间的关系第51-52页
        4.3 室内模拟修复实验的局限与意义第52-53页
第四章 滩涂实地条件下生物扰动、物理扰动及微生物强化的正交组合去沉积物中营养盐去除的研究第53-63页
    1. 前言第53-54页
    2. 材料与方法第54-56页
        2.1 实验地点和采样第54-55页
        2.2 正交设计第55-56页
        2.3 沉积物和间隙水的采样第56页
        2.4 间隙水的测试分析第56页
        2.5 沉积物中总氮和总磷的测试分析第56页
        2.6 总氮和总磷的去除率第56页
    3. 结果第56-60页
        3.1 正交实验组中沉积物的总氮、总磷去除率第56-58页
        3.2 因子间的相互作用第58-59页
        3.3 间隙水的理化特征第59-60页
    4. 讨论第60-63页
        4.1 正交实验组中总氮、总磷的去除率第60-61页
        4.2 因子间的相互作用第61-62页
        4.3 间隙水中营养盐含量的影响因子第62-63页
第五章 大型底栖动物的扰动作用对沉积物中微生物群落结构的影响第63-76页
    1. 前言第63页
    2. 材料与方法第63-65页
        2.1 实验地点及实验布置第63-64页
        2.2 沉积物和间隙水的采样第64页
        2.3 沉积物和间隙水的分析第64页
        2.4 沉积物中DNA提取、PCR扩增及illumine Miseq测序第64-65页
        2.5 实时荧光定量扩增第65页
        2.6 测序分析第65页
        2.7 分析统计方法第65页
    3. 结果第65-73页
        3.1 各组间沉积物和间隙水中营养盐特征第65-67页
        3.2 高通量序列分类组成第67-69页
        3.3 群落结构分析第69-72页
        3.4 古菌及细菌氨加单氧酶基因的丰度第72-73页
    4. 讨论第73-76页
第六章 文蛤中肠道与沉积物中微生物群落结构的关系第76-88页
    1. 引言第76页
    2. 材料与方法第76-78页
        2.1 材料第76-77页
        2.2 文蛤肠道及沉积物DNA提取第77页
        2.3 核酸PCR扩增及illumine Miseq测序第77页
        2.4 实时荧光定量扩增第77页
        2.5 测序分析第77-78页
        2.6 分析统计方法第78页
    3. 结果第78-85页
        3.1 优质序列的获取第78页
        3.2 沉积物与肠道微生物OTU及Venn图第78-79页
        3.3 生物多样性分析第79-80页
        3.4 群落结构分析第80-84页
        3.5 沉积物和文蛤肠道中氨加单氧酶功能基因amoA丰度第84-85页
    4. 讨论第85-88页
        4.1 沉积物和文蛤肠道中微生物群落的组成和特异性第85-86页
        4.2 沉积物与文蛤肠道中微生物群落结构的差异性第86页
        4.3 沉积物与文蛤肠道中氮循环功能细菌之间的关系第86-88页
参考文献第88-105页
读博期间研究成果第105-106页
本研究课题来源第106-107页
致谢第107页

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