| 中文摘要 | 第8-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-36页 |
| 第一节 多环芳烃菲的微生物降解综述 | 第11-29页 |
| 1 多环芳烃的累积和环境毒性 | 第11-13页 |
| 1.1 PAHs的理化和毒性特征 | 第12页 |
| 1.2 菲的结构特性 | 第12-13页 |
| 2 菲的生物降解 | 第13-25页 |
| 2.1 细菌对菲的好氧降解途径 | 第13-16页 |
| 2.2 真菌对菲的降解途径 | 第16页 |
| 2.3 菲细菌降解途径中的酶系 | 第16-20页 |
| 2.4 菲降解的分子生物学研究 | 第20-25页 |
| 2.5 菲的厌氧降解 | 第25页 |
| 3 菲污染的生物修复 | 第25-29页 |
| 3.1 微生物的引入 | 第26页 |
| 3.2 生物可利用性(bioavailability)对菲降解速率的影响 | 第26-28页 |
| 3.3 营养盐的加入 | 第28页 |
| 3.4 共代谢降解 | 第28-29页 |
| 第二节 细菌谷胱甘肽S-转移酶结构功能及其在芳烃降解中的作用 | 第29-36页 |
| 1 GST的分类及蛋白结构 | 第29-31页 |
| 1.1 GST的分类 | 第29-30页 |
| 1.2 细菌GST的蛋白结构 | 第30-31页 |
| 2 细菌中GST的催化类型 | 第31-32页 |
| 2.1 二氯甲烷脱氯酶(DMCD) | 第31-32页 |
| 2.2 PcpC和LinD | 第32页 |
| 2.3 LigF | 第32页 |
| 2.4 OrfE3和NagL | 第32页 |
| 3 GST在异生物质降解中的作用 | 第32-34页 |
| 4 GST基因的进化路程 | 第34-35页 |
| 5 GST酶的应用潜力 | 第35-36页 |
| 第二章 菲对水田微生态系统的急性效应 | 第36-49页 |
| 1 材料与方法 | 第37-41页 |
| 2 结果 | 第41-47页 |
| 2.1 菲对土壤好氧细菌数量动态变化影响 | 第41页 |
| 2.2 菲对土壤中真菌数量动态变化的影响 | 第41-42页 |
| 2.3 菲对土壤放线菌数量的动态影响 | 第42-43页 |
| 2.4 菲对土壤水解发酵性细菌数量的动态影响 | 第43页 |
| 2.5 菲对土壤厌氧固氮菌数量动态变化的影响 | 第43-44页 |
| 2.6 菲对土壤产甲烷细菌数量动态变化的影响 | 第44页 |
| 2.7 菲对土壤脱氢酶的动态影响 | 第44-45页 |
| 2.8 菲对土壤脲酶活性的动态影响 | 第45-46页 |
| 2.9 菲对稻田土壤微生物(真细菌)群落结构的DGGE分析 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-49页 |
| 3.1 菲对土壤好氧微生物种群的影响 | 第47-48页 |
| 3.2 菲对土壤厌氧微生物种群的影响 | 第48页 |
| 3.3 菲对土壤酶活性的影响 | 第48页 |
| 3.4 菲对土壤微生物(真细菌)多样性的影响 | 第48-49页 |
| 第三章 菲降解菌株分离、鉴定及系统发育研究 | 第49-66页 |
| 1 材料与方法 | 第49-53页 |
| 2 结果 | 第53-64页 |
| 2.1 分离菌株的降解能力 | 第53-54页 |
| 2.2 分离菌株的形态学研究 | 第54-55页 |
| 2.3 分离菌株的生理生化特性 | 第55-56页 |
| 2.4 分离菌株的抗生素敏感性 | 第56-57页 |
| 2.5 分离菌株的全细胞脂肪酸分析 | 第57页 |
| 2.6 G+C mol％含量分析 | 第57页 |
| 2.7 分离菌株碳源利用 | 第57-58页 |
| 2.8 分离菌株的16S rDNA序列分析 | 第58页 |
| 2.9 分离菌株的ITS序列分析 | 第58-60页 |
| 2.10 基于16S rDNA序列系统发育树的构建 | 第60-62页 |
| 2.11 基于分离菌株和同属细菌ITS序列的系统发育树 | 第62-63页 |
| 2.12 遗传距离矩阵建立 | 第63-64页 |
| 3 讨论 | 第64-66页 |
| 第四章 菲降解菌株生长和降解特性研究 | 第66-77页 |
| 1 材料与方法 | 第66-68页 |
| 2 结果 | 第68-76页 |
| 2.1 菲降解菌株生长条件 | 第68-71页 |
| 2.2 降解菌株菲降解途径的初步探讨 | 第71-72页 |
| 2.3 菌株ZX4的菲降解特性 | 第72-76页 |
| 3 讨论 | 第76-77页 |
| 第五章 菲降解菌芳香环羟化双加氧酶铁硫蛋白α亚基基因的克隆 | 第77-89页 |
| 1 材料与方法 | 第78-82页 |
| 2 结果 | 第82-87页 |
| 2.1 引物1扩增和测序结果 | 第82-83页 |
| 2.2 引物2在菌株EVA17中前扩增结果 | 第83页 |
| 2.3 阳性克隆子的筛选与鉴定 | 第83-84页 |
| 2.4 目的基因的序列测定与分析 | 第84-87页 |
| 2.5 系统发育构建 | 第87页 |
| 3 讨论 | 第87-89页 |
| 第六章 菲降解菌间位裂解操纵子基因克隆 | 第89-103页 |
| 1 材料与方法 | 第89-92页 |
| 2 结果 | 第92-101页 |
| 2.1 基因克隆 | 第92页 |
| 2.2 核酸序列测定与分析 | 第92-96页 |
| 2.3 phnH基因编码氨基酸序列推导与分析 | 第96-97页 |
| 2.4 基于MCP水解酶基因序列系统发育树构建 | 第97-98页 |
| 2.5 phnI基因编码氨基酸序列推导与分析 | 第98-100页 |
| 2.6 基于邻苯二酚2，3-双加氧酶基因序列系统发育树构建 | 第100-101页 |
| 3 讨论 | 第101-103页 |
| 第七章 邻苯二酚2，3-双加氧酶编码基因在大肠杆菌中的表达 | 第103-110页 |
| 1 材料与方法 | 第103-106页 |
| 2 结果 | 第106-109页 |
| 2.1 邻苯二酚2，3-双加氧酶编码基因的PCR扩增及表达载体的构建 | 第106-107页 |
| 2.2 重组表达载体的酶切鉴定结果 | 第107-108页 |
| 2.3 外源基因在大肠杆菌中的表达与酶活分析 | 第108-109页 |
| 2.4 重组菌株邻苯二酚2，3-双加氧酶活性的检测 | 第109页 |
| 3 讨论 | 第109-110页 |
| 第八章 谷胱甘肽S-转移酶编码基因的克隆及其在大肠杆菌中的表达 | 第110-121页 |
| 1 材料和方法 | 第110-115页 |
| 2 结果 | 第115-119页 |
| 2.1 GST编码基因的PCR扩增及序列测定 | 第115-116页 |
| 2.2 GST氨基酸序列同源性分析 | 第116-117页 |
| 2.3 表达载体的构建 | 第117-118页 |
| 2.4 GST基因在大肠杆菌中的诱导表达 | 第118-119页 |
| 2.5 Western Blotting test | 第119页 |
| 2.6 重组菌株GST活性的检测 | 第119页 |
| 3 讨论 | 第119-121页 |
| 第九章 GST编码基因克隆引物的应用 | 第121-127页 |
| 1 材料和方法 | 第121-123页 |
| 2 结果 | 第123-126页 |
| 2.1 降解菌株GST酶编码基因的PCR扩增 | 第123-124页 |
| 2.2 基于GST编码基因保守区的系统发育树构建 | 第124页 |
| 2.3 GST与C230共扩增及序列测定 | 第124-125页 |
| 2.4 GST编码基因的引物在污染土壤DNA中的扩增 | 第125-126页 |
| 3 讨论 | 第126-127页 |
| Abstract | 第127页 |
| 本文主要结论及展望 | 第131-134页 |
| 参考文献 | 第134-146页 |
| 博士研究生学习期间论文及获奖情况 | 第146页 |
