| 中文摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 计算机分子模拟方法简介 | 第10-13页 |
| 1.1.1 分子力学模拟原理 | 第10-12页 |
| 1.1.2 分子动力学模拟原理 | 第12-13页 |
| 1.2 表面分子自组装 | 第13-17页 |
| 1.2.1 表面分子自组装的发展 | 第13-16页 |
| 1.2.2 研究分子表面自组装的意义 | 第16-17页 |
| 1.3 线粒体复合物Ⅰ | 第17-21页 |
| 1.3.1 线粒体复合物Ⅰ的简介 | 第17-20页 |
| 1.3.2 线粒体复合物Ⅰ的研究意义 | 第20-21页 |
| 第二章 分子力学方法研究石墨表面二维自组装图案的机理 | 第21-34页 |
| 2.1 研究背景 | 第21-22页 |
| 2.2 研究所用材料与方法 | 第22-27页 |
| 2.2.1 构建模型 | 第22-23页 |
| 2.2.2 焓变计算方法 | 第23-25页 |
| 2.2.3 熵值的理论计算方法 | 第25-27页 |
| 2.3 研究结果与讨论 | 第27-34页 |
| 2.3.1 构建模型和分子密度 | 第27-28页 |
| 2.3.2 三种结构的势能及其分项 | 第28-30页 |
| 2.3.3 三种结构的焓变 | 第30-31页 |
| 2.3.4 形成三种结构的熵变 | 第31页 |
| 2.3.5 相转变的自由能 | 第31-33页 |
| 2.3.6 小结 | 第33-34页 |
| 第三章 分子动力学研究线粒体复合物Ⅰ中质子迁移的机理 | 第34-47页 |
| 3.1 研究背景 | 第34-36页 |
| 3.2 研究所用材料和方法 | 第36-38页 |
| 3.2.1 蛋白结构 | 第36页 |
| 3.2.2 MD模拟 | 第36-38页 |
| 3.3 研究结果与讨论 | 第38-47页 |
| 3.3.1 跨膜区域中的水分子 | 第38-41页 |
| 3.3.2 连接片段波动引起构象改变 | 第41-44页 |
| 3.3.3 螺旋HL和TM中带电残基Glu的移动 | 第44页 |
| 3.3.4 NuoL、NuoM、NuoN的作用 | 第44-45页 |
| 3.3.5 动力学机制 | 第45-46页 |
| 3.3.6 小结 | 第46-47页 |
| 第四章 分子模拟与实验工作结合 | 第47-54页 |
| 4.1 含水结晶体Schiff-Base分子的荧光性质 | 第47-49页 |
| 4.1.1 研究背景和实验工作 | 第47-48页 |
| 4.1.2 理论计算工作及结论 | 第48-49页 |
| 4.2 利用层状非聚合物凝胶制备二维超薄金薄膜 | 第49-51页 |
| 4.2.1 研究背景和实验工作 | 第49-50页 |
| 4.2.2 理论计算工作及结论 | 第50-51页 |
| 4.3 介孔掺杂硅纳米棒作为联合治疗癌症的多功能药物载体 | 第51-54页 |
| 4.3.1 研究背景和实验工作 | 第51-52页 |
| 4.3.2 理论计算工作及结论 | 第52-54页 |
| 参考文献 | 第54-76页 |
| 攻读学位期间本人出版或公开发表的论著、论文： | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77-78页 |
