| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 前言 | 第8-12页 |
| 1.1 项目背景 | 第8-9页 |
| 1.2 国内外现状 | 第9-10页 |
| 1.3 本文的主要研究内容 | 第10-12页 |
| 第二章 基本理论与方法 | 第12-30页 |
| 2.1 分子生物学中的基本概念 | 第12-15页 |
| 2.2 生物信息学中的一些比对方法 | 第15-19页 |
| 2.3 多序列比对（MSA）问题 | 第19-28页 |
| 2.4 本章小结 | 第28-30页 |
| 第三章 一种基于隐马尔科夫模型的PHMM优化算法 | 第30-45页 |
| 3.1 算法的引入 | 第30-35页 |
| 3.2 基于POA算法的HMM模型优化算法PHMM | 第35-40页 |
| 3.3 实验结果 | 第40-42页 |
| 3.4 算法分析 | 第42页 |
| 3.5 性能分析 | 第42-44页 |
| 3.6 本章小结 | 第44-45页 |
| 第四章 基于PHMM算法的玉米常见病病原菌的基因分析 | 第45-51页 |
| 4.1 实验数据来源 | 第45-46页 |
| 4.2 BLAST比对 | 第46-48页 |
| 4.3 PHMM算法的多序列比对 | 第48-50页 |
| 4.4 本章小结 | 第50-51页 |
| 第五章 结论与展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 作者简介 | 第57-58页 |
| 致谢 | 第58页 |