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高产纤维素酶柄蓝状菌的基因敲除以及对CRISPR/Cas9系统的初步探究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
引言第13-14页
第1章 文献综述第14-26页
    1.1 木质纤维素生物质第14-15页
        1.1.1 木质纤维素生物质简介第14页
        1.1.2 木质纤维素的组成及其性质第14-15页
    1.2 纤维素酶第15-17页
        1.2.1 纤维素酶的简述第15页
        1.2.2 纤维素酶的组成第15页
        1.2.3 纤维素酶的作用机理第15-16页
        1.2.4 产纤维素酶的微生物第16页
        1.2.5 纤维素酶的应用第16-17页
    1.3 丝状真菌中纤维素酶的合成诱导调控及转录调控第17-20页
        1.3.0 碳源对丝状真菌纤维素酶的合成调控第17页
        1.3.1 转录调控因子第17-18页
        1.3.2 纤维素酶的诱导调控第18页
        1.3.3 糖转运蛋白第18-19页
        1.3.4 染色质调控及其他相关调控第19-20页
    1.4 丝状真菌的基因敲除技术第20-23页
        1.4.1 基因敲除技术的概述第20页
        1.4.2 基因敲除技术的分类第20-22页
            1.4.2.1 传统的基因敲除方法第20-21页
            1.4.2.2 新兴的基因敲除技术第21-22页
        1.4.3 丝状真菌基因敲除技术的存在问题及其研究现状第22-23页
    1.5 丝状真菌的基因改造手段第23-24页
        1.5.1 PEG/CaCl2原生质体转化第23页
        1.5.2 农杆菌介导的遗传转化第23页
        1.5.3 其他转化方法第23-24页
    1.6 课题研究依据第24-26页
第2章 材料与方法第26-32页
    2.1 实验仪器第26页
    2.2 实验所用主要培养基第26-27页
    2.3 实验所用酶与分子试剂第27页
    2.4 实验所用菌株与质粒第27页
    2.5 主要实验试剂及溶液的配制第27-29页
    2.6 基础实验操作第29-32页
        2.6.1 大肠杆菌感受态的制备第29-30页
        2.6.2 葡萄糖和木糖标准曲线的制作第30页
        2.6.3 菌种储藏第30-32页
第3章 碳阻遏因子creA基因敲除及对纤维素酶表达的影响第32-60页
    3.1 前言第32页
    3.2 实验材料第32-34页
        3.2.1 菌株与质粒第32页
        3.2.2 实验用酶和试剂第32-33页
        3.2.3 实验用溶液的配制第33-34页
    3.3 基因敲除原理第34页
    3.4 creA基因缺失菌株的构建第34-44页
        3.4.1 creA基因的扩增第34-37页
        3.4.2 creA同源臂creA1,creA2的扩增第37-38页
        3.4.3 同源臂(Sph1)creA1(Nco1)与marker质粒PGApyrF的连接第38-39页
        3.4.4 同源臂creA2与PGApyrF-creA1的连接第39-40页
        3.4.5 creA基因一次同源重组第40-41页
        3.4.6 中间转化子基因组提取和PCR的验证第41页
        3.4.7 柄蓝状菌creA缺失突变株的获取第41-42页
        3.4.8 creA缺失菌株的形态学分析第42页
        3.4.9 creA缺失菌株的纤维素酶和木糖酶的酶活测定第42-43页
        3.4.10 creA缺失菌株和EMM在筛选平板上的生长第43-44页
    3.5 实验结果第44-57页
        3.5.1 从柄蓝状菌EMM中获得creA基因第44-47页
        3.5.2 creA敲除基因盒PGcreA1-ApyrF-creA2的构建第47-52页
        3.5.3 一次同源重组转化子的获取第52-53页
        3.5.4 中间转化子的鉴定第53页
        3.5.5 标记基因循环(二次同源重组)转化子的获取第53-54页
        3.5.6 creA基因缺失菌株△creA的获取第54页
        3.5.7 △creA菌株的形态学分析第54-55页
        3.5.8 敲除creA基因对纤维素酶和木聚糖酶酶活的影响第55-57页
        3.5.9 creA缺失菌株和EMM在筛选平板上透明圈的生长情况第57页
    3.6 本章小结第57-60页
第4章 柄蓝状菌Ku70缺失菌株的构建第60-78页
    4.1 前言第60-61页
    4.2 实验材料第61-62页
        4.2.1 菌株与质粒第61页
        4.2.2 实验用酶和生物试剂第61页
        4.2.3 实验所用溶液第61-62页
    4.3 基因敲除原理第62页
    4.4 Ku70基因敲除盒的构建第62-65页
        4.4.1 Ku70基因扩增第62-63页
        4.4.2 Ku70同源臂Ku70-1 和Ku70-2 的扩增第63-64页
        4.4.3 同源臂Ku70-1,Ku70-2 与循环标记质粒PGApyrF的连接第64页
        4.4.4 诱导Ku70第一次同源重组第64页
        4.4.5 中间转化子的验证第64页
        4.4.6 柄蓝状菌Ku70缺失菌株的获取第64页
        4.4.7 Ku70缺失菌株的特性研究第64-65页
    4.5 实验结果第65-76页
        4.5.1 从柄蓝状菌EMM中获取Ku70基因第65-68页
        4.5.2 同源臂Ku70-1、Ku70-2 的扩增第68-70页
        4.5.3 Ku70敲除基因盒PGApyrF-Ku70的构建第70-73页
        4.5.4 PEG/CaCl2原生质体转化第73-74页
        4.5.5 转化子的鉴定第74-75页
        4.5.6 循环标记基因第75-76页
        4.5.7 △ku70菌株的获取第76页
    4.6 本章小结第76-78页
第5章 CRISPR/Cas9系统的初步探究第78-88页
    5.1 前言第78页
    5.2 CRISPR/Cas9系统实现多基因编辑原理第78-80页
    5.3 实验材料第80-81页
        5.3.1 菌株和质粒第80页
        5.3.2 分子试剂第80-81页
        5.3.3 实验溶液第81页
    5.4 实验方法第81-83页
        5.4.1 Cas9基因的获得第81页
        5.4.2 质粒PG-Cas9的构建第81-82页
        5.4.3 PCPtcbh2质粒的抽提第82页
        5.4.4 PCPtcbh2-Cas9重组载体的构建第82-83页
        5.4.5 原生质体转化第83页
    5.5 实验结果第83-86页
        5.5.1 质粒PG-Cas9质粒的构建第83-84页
        5.5.2 重组质粒PCP-Cas9(GFP)的构建第84-85页
        5.5.3 Cas9基因的表达第85-86页
    5.6 小结第86-88页
第6章 总结与展望第88-90页
    6.1 总结第88-89页
    6.2 展望第89-90页
参考文献第90-98页
攻读硕士期间已发表的论文第98-100页
致谢第100页

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