| 缩略词表 | 第5-6页 |
| 中文摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-10页 |
| 前言 | 第11-14页 |
| 第一章 基于Ion Torrent平台测序数据的微生物全基因组序列组装 | 第14-41页 |
| 1. Ion Torrent平台简介 | 第14-16页 |
| 2.全基因组组装算法和组装软件的选择 | 第16-19页 |
| 3.微生物全基因组组装辅助工具 | 第19-29页 |
| 4.讨论 | 第29-41页 |
| 第三章 微生物基因组分析方法 | 第41-46页 |
| 1. COG注释 | 第41-43页 |
| 2.不同菌株同源基因含量比较 | 第43页 |
| 3. 细菌毒力因子的查找 | 第43-44页 |
| 4. 讨论 | 第44-46页 |
| 结论 | 第46-47页 |
| 参考文献 | 第47-51页 |
| 综述 | 第51-62页 |
| 参考文献 | 第59-62页 |
| 附录 | 第62-68页 |
| 个人简历 | 第68-69页 |
| 致谢 | 第69页 |