| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 前言 | 第11-25页 |
| 1. 大黄鱼养殖主要病害 | 第11-14页 |
| ·病毒性疾病 | 第11-12页 |
| ·细菌性疾病 | 第12-13页 |
| ·寄生虫疾病 | 第13页 |
| ·环境因子 | 第13-14页 |
| 2. 鱼类免疫系统及信号通路 | 第14-20页 |
| ·免疫器官 | 第14-15页 |
| ·免疫应答 | 第15-16页 |
| ·固有性免疫应答 | 第15页 |
| ·适应性免疫应答 | 第15-16页 |
| ·免疫相关的信号通路 | 第16-20页 |
| ·TLR 家族及其信号通路 | 第16-17页 |
| ·MAPK家族及其信号通路 | 第17-19页 |
| ·TCR家族及其信号通路 | 第19-20页 |
| 3. 过氧化物酶(Peroxiredoxin)家族的研究进展 | 第20-21页 |
| 4. 转录组学研究 | 第21-25页 |
| ·转录组的概念 | 第22页 |
| ·转录组学主要研究技术 | 第22页 |
| ·转录组技术平台比较 | 第22-23页 |
| ·RNA测序技术(RNA-seq) | 第23-24页 |
| ·Illumina/Solexa | 第24-25页 |
| 第二章 材料与方法 | 第25-45页 |
| 1. 材料 | 第25-28页 |
| ·常用试剂来源 | 第25页 |
| ·主要仪器设备 | 第25页 |
| ·生物材料 | 第25-26页 |
| ·常用试剂配方 | 第26-28页 |
| 2. 实验方法 | 第28-45页 |
| 第三章 Poly（I：C）诱导大黄鱼脾脏转录组分析 | 第45-52页 |
| 1. 引言 | 第45页 |
| 2. 结果 | 第45-50页 |
| ·Poly (I:C)诱导大黄鱼脾脏转录组分析 | 第45-46页 |
| ·基因注释 | 第46页 |
| ·Gene ontology(GO)分类 | 第46-48页 |
| ·KEGG信号通路分析 | 第48页 |
| ·免疫和信号转导相关基因 | 第48-50页 |
| 3. 讨论 | 第50-51页 |
| 4. 小结 | 第51-52页 |
| 第四章 嗜水气单胞菌刺激大黄鱼脾脏转录组和表达谱分析 | 第52-74页 |
| 1. 引言 | 第52页 |
| 2. 结果 | 第52-71页 |
| ·嗜水气单胞菌刺激大黄鱼脾脏转录组分析 | 第52-58页 |
| ·制备样品 | 第52-54页 |
| ·嗜水气单胞菌刺激大黄鱼脾脏转录组概述 | 第54页 |
| ·基因注释 | 第54-55页 |
| ·Gene ontology (GO)分类 | 第55-57页 |
| ·KEGG信号通路分析 | 第57-58页 |
| ·嗜水气单胞菌刺激大黄鱼脾脏表达谱分析 | 第58-71页 |
| ·表达量分布统计 | 第58-59页 |
| ·多标签基因的表达量分析 | 第59页 |
| ·差异表达基因的筛选 | 第59-60页 |
| ·标签的基因注释 | 第60-61页 |
| ·Gene Ontology 功能显著性富集分析 | 第61-63页 |
| ·免疫和信号转导相关基因 | 第63-67页 |
| ·GenMAPP分析TCR和MAPK信号通路 | 第67-71页 |
| 3. 讨论 | 第71-73页 |
| 4. 小结 | 第73-74页 |
| 第五章 Peroxiredoxin4 结构与功能研究 | 第74-82页 |
| 1. 引言 | 第74页 |
| 2. 结果 | 第74-80页 |
| ·大黄鱼Peroxiredoxin4（Prx4）结构和活性位点分析 | 第74-75页 |
| ·Prx4 和其他物种的蛋白序列比对 | 第75-76页 |
| ·Prx4 及其截短蛋白Prx4△62, Prx4△67 的表达 | 第76-77页 |
| ·Prx4 及其截短蛋白Prx4△62, Prx4△67 的纯化复性 | 第77页 |
| ·β折叠与Prx4 过氧化物酶活性之间的关系 | 第77-78页 |
| ·Prx4 及其截短蛋白Prx4△62, Prx4△67 体内活性EMSA实验 | 第78-79页 |
| ·β折叠对Prx4 抗菌活性的影响 | 第79-80页 |
| 3. 讨论 | 第80-81页 |
| 4. 小结 | 第81-82页 |
| 附件 | 第82-92页 |
| 参考文献 | 第92-99页 |
| 硕士在读期间发表的文章 | 第99-100页 |
| 致谢 | 第100页 |
