| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-22页 |
| 第一节 研究背景 | 第9-20页 |
| 1 化学基因组学 | 第9页 |
| 2 化学基因组学数据来源 | 第9-12页 |
| 3 浏览化学基因组学空间的方法 | 第12-20页 |
| 第二节 研究内容 | 第20-22页 |
| 第二章 基于序列和配体的蛋白质网络的构建与拓扑学分析和比较 | 第22-36页 |
| 第一节 研究背景和意义 | 第22页 |
| 第二节 研究材料和方法 | 第22-29页 |
| 1 数据集 | 第22-23页 |
| 2 分子相似性测量 | 第23-27页 |
| 3 蛋白质相似性测量 | 第27-29页 |
| 4 蛋白质相似性计算、网络构建和比较 | 第29页 |
| 第三节 研究结果和讨论 | 第29-36页 |
| 1 计算基于序列和基于配体的蛋白质网络 | 第29-33页 |
| 2 两类网络的拓扑学性质 | 第33-34页 |
| 3 比较基于配体和基于序列的蛋白质网络 | 第34-36页 |
| 第三章 两个网络的显著分区与LCBN的生物学和化学意义 | 第36-43页 |
| 第一节 研究背景和意义 | 第36页 |
| 第二节 研究材料和方法 | 第36-38页 |
| 1 数据集 | 第36-37页 |
| 2 富集分析 | 第37页 |
| 3 聚类方法 | 第37-38页 |
| 第三节 研究结果和讨论 | 第38-43页 |
| 1 配体和序列网络的显著分区 | 第38页 |
| 2 LCBN的生物学和化学意义 | 第38-43页 |
| 第四章 ePlatton数据库的建立和验证 | 第43-48页 |
| 第一节 研究背景和意义 | 第43页 |
| 第二节 研究材料和方法 | 第43-44页 |
| 1 数据集 | 第43-44页 |
| 2 ePlatton网站的搭建 | 第44页 |
| 第三节 研究结果和讨论 | 第44-48页 |
| 1 ePlatton数据库,一个多靶标的配体查找工具 | 第44页 |
| 2 ePlatton的前溯验证和后溯预测能力 | 第44-48页 |
| 第五章 结论 | 第48-49页 |
| 附录 | 第49-53页 |
| 参考文献 | 第53-57页 |
| 后记 | 第57页 |
