| 目录 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 英文缩略词表 | 第12-13页 |
| 引言 | 第13-20页 |
| 材料和方法 | 第20-42页 |
| ·研究对象 | 第20页 |
| ·实验材料 | 第20-22页 |
| ·主要仪器及设备 | 第20-21页 |
| ·主要试剂 | 第21-22页 |
| ·主要生物软件和网上分析工具 | 第22页 |
| ·实验方法及工作流程 | 第22-42页 |
| ·样品采集,运输和保存 | 第22-23页 |
| ·病毒载量检测 | 第23-24页 |
| ·流式细胞仪检测HIV感染者T淋巴细胞计数 | 第24-26页 |
| ·RNA提取(参照QIAGEN公司Viral RNA Extraction Kit操作步骤) | 第26-28页 |
| ·MagNA Pure自动核酸提取 | 第28页 |
| ·RT-PCR操作规程 | 第28-34页 |
| ·PCR扩增产物鉴定和凝胶成像 | 第34-36页 |
| ·PCR产物直接测序 | 第36-39页 |
| ·测序所得序列的拼接与编辑 | 第39-40页 |
| ·基因型耐药的判断与分析 | 第40-42页 |
| 结果 | 第42-57页 |
| ·患者基本信息及治疗效果 | 第42-43页 |
| ·低载量出现耐药对后期治疗的影响 | 第43-45页 |
| ·连续随访患者在低病毒载量时的耐药程度 | 第43-44页 |
| ·低水平病毒载量对临床治疗效果的影响 | 第44-45页 |
| ·长期治疗中非核苷类抑制剂相关耐药的发展 | 第45-48页 |
| ·长期使用NVP患者非核苷类耐药位点的发展 | 第46页 |
| ·单个患者准种毒株主要NNRTI耐药位点的发展 | 第46-48页 |
| ·补偿性位点的发展及其对长期抗病毒治疗的影响 | 第48-57页 |
| ·M43E位点与耐药位点M41L的协同进化 | 第48-50页 |
| ·L228R与耐药位点H221Y的替代关系 | 第50-52页 |
| ·M41L、L228R与其相关耐药位点及其周边区域的3D结构模拟 | 第52-54页 |
| ·M41L和K43E位点的Jaccard similarity和Ka/Ks分析 | 第54-55页 |
| ·在队列人群中的补偿位点K43E | 第55-57页 |
| 讨论 | 第57-62页 |
| 参考文献 | 第62-70页 |
| 综述 | 第70-79页 |
| 参考文献 | 第76-79页 |
| 个人基本情况 | 第79-80页 |
| 发表或待发表文章 | 第80-81页 |
| 致谢 | 第81页 |
