| 摘要 | 第1-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 理论和方法 | 第11-37页 |
| ·经典力场模型：分子力学 | 第11-14页 |
| ·GB模型 | 第14-21页 |
| ·副本交换分子动力学 | 第21-26页 |
| ·蛋白质折叠 | 第26-32页 |
| ·蛋白质的折叠密码 | 第27页 |
| ·蛋白质折叠的速度机制 | 第27-28页 |
| ·从氨基酸序列中筛选蛋白质结构 | 第28-30页 |
| ·蛋白质折叠：基础科学的遗产 | 第30-32页 |
| ·蛋白质折叠亟待解决的问题 | 第32页 |
| ·2D力场的发展 | 第32-37页 |
| 第二章 AMBER03~(2D)力场模拟Trp-cage的折叠 | 第37-48页 |
| ·计算方法 | 第37-38页 |
| ·MD模拟设置 | 第37页 |
| ·分析方法 | 第37-38页 |
| ·结果和讨论 | 第38-47页 |
| ·结论 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-55页 |
| 科研成果 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |