| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 缩略词表 | 第11-12页 |
| 一、前言 | 第12-16页 |
| （一）国内外背景及研究现状 | 第12-13页 |
| 1、基于S0A的生物信息工作流 | 第12-13页 |
| 2、web服务调用 | 第13页 |
| （二）本文主要研究思路与主要工作 | 第13-16页 |
| 1、研究思路 | 第13-14页 |
| 2、主要工作及创建点 | 第14-15页 |
| （1）主要工作 | 第14页 |
| （2）创新点 | 第14-15页 |
| 3、文章的结构 | 第15-16页 |
| 二、生物信息工作流的主要支撑技术 | 第16-20页 |
| （一）SOA架构 | 第16页 |
| （二）SPRING框架下的AOP/IOC | 第16-18页 |
| （三）WEBSERVICE技术 | 第18-19页 |
| （四）JDM工具 | 第19页 |
| （五）本章小结 | 第19-20页 |
| 三、生物信息学工作流系统设计与分析 | 第20-25页 |
| （一）需求与功能分析 | 第20页 |
| （二）系统功能模块设计 | 第20-22页 |
| 1、生物信息工作流平台 | 第21-22页 |
| 2、面向web服务的客户端 | 第22页 |
| 3、JDM实现数据挖掘 | 第22页 |
| （三）系统开发设计 | 第22-24页 |
| （四）本章小结 | 第24-25页 |
| 四、生物信息工作流平台构建 | 第25-29页 |
| （一）设计思路 | 第25-26页 |
| （二）工作流引擎的设计 | 第26-28页 |
| （三）工作流引擎的关键技术 | 第28页 |
| （四）总结和讨论 | 第28-29页 |
| 五、面向生物信息学WEB服务资源管理的客户端设计 | 第29-38页 |
| （一）生物信息学WEBSERVICES客户端设计 | 第29-32页 |
| 1、生物信息学Web Services | 第30页 |
| 2、基于SOAP的Web Services客户端架构 | 第30-32页 |
| （二）WEBSERVICES客户端实现的关键技术 | 第32-35页 |
| 1、 WSDL复杂数据类型的解析 | 第32-33页 |
| 2、基于SOAP消息模板的动态组装 | 第33-35页 |
| （三）关键代码实现 | 第35-36页 |
| （四）结果和讨论 | 第36-38页 |
| 六、JDM JAVA 数据挖掘 | 第38-42页 |
| （一）数据挖掘在生物信息上的应用 | 第38-39页 |
| （二）基于JDM数据挖掘的设计 | 第39-40页 |
| （三）结果和讨论 | 第40-42页 |
| 七、系统开发环境与集成实现 | 第42-49页 |
| （一）系统开发环境 | 第42-43页 |
| （二）系统测试与集成实现 | 第43-47页 |
| 1、同源序列分析的数据 | 第44-45页 |
| 2、工作流组成所需元素 | 第45页 |
| 3、工作流实例化 | 第45-46页 |
| 4、配置工作流参数 | 第46-47页 |
| 5、结果分析 | 第47页 |
| （三）总结与讨论 | 第47-49页 |
| 八、总结与展望 | 第49-51页 |
| （一）总结与讨论 | 第49-50页 |
| （二）工作展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-55页 |
| 在读期间发表的论文 | 第55-56页 |
| 致谢 | 第56页 |