| 图表索引 | 第1-9页 |
| 英语缩略词 | 第9-10页 |
| 摘要 | 第10-13页 |
| ABSTRACT | 第13-16页 |
| 第一章 导论(含文献综述) | 第16-38页 |
| 一、概述 | 第16-17页 |
| 二、膀胱癌诊断相关的分子标志物研究 | 第17-23页 |
| ·膀胱癌的染色体DNA区段肿瘤标志物 | 第18-19页 |
| ·膀胱癌的功能基因相关肿瘤分子标志物 | 第19-21页 |
| ·原癌基因 | 第19-20页 |
| ·抑癌基因 | 第20-21页 |
| ·细胞周期调控基因 | 第21页 |
| ·膀胱癌的RNA相关肿瘤分子标志物 | 第21-22页 |
| ·mRNA肿瘤分子标志物 | 第21-22页 |
| ·miRNA肿瘤分子标志物 | 第22页 |
| ·膀胱癌相关的蛋白质标志物 | 第22-23页 |
| ·膀胱癌肿瘤分子标志物的应用前景 | 第23页 |
| 三、乳腺癌新辅助化疗后组织病理学治疗反应预测相关的分子标志物研究 | 第23-35页 |
| ·乳腺癌的新辅助化疗 | 第24页 |
| ·乳腺癌新辅助化疗后组织病理学治疗反应相关分子标志物 | 第24-35页 |
| ·雌激素受体 | 第25页 |
| ·孕激素受体 | 第25-26页 |
| ·雄激素受体 | 第26-28页 |
| ·人类表皮生长因子受体2 | 第28页 |
| ·Ki-67抗原 | 第28-29页 |
| ·凋亡抑制蛋白 | 第29-30页 |
| ·Cyclin B1蛋白 | 第30-31页 |
| ·Cyclin D1蛋白 | 第31-33页 |
| ·14-3-3σ蛋白 | 第33-34页 |
| ·14-3-3ζ蛋白 | 第34-35页 |
| ·乳腺癌新辅助化疗疗效预测的潜在意义 | 第35页 |
| 四、本课题的研究目的和研究策略 | 第35-38页 |
| 第二章 以DNA拷贝数异常改变作为膀胱癌诊断相关分子标志物的研究 | 第38-87页 |
| 一、引言 | 第38页 |
| 二、材料与方法 | 第38-61页 |
| (一) 研究对象与实验材料 | 第38-53页 |
| 1 膀胱癌患者及其组织样品 | 第38-52页 |
| ·新鲜冻存膀胱癌组织 | 第39-40页 |
| ·开放性手术切除膀胱癌组织 | 第39页 |
| ·经尿道电切(TURBT)膀胱癌组织 | 第39-40页 |
| ·甲醛固定石蜡包埋(FFPE)膀胱癌组织 | 第40页 |
| ·膀胱癌患者和对照个体的尿沉渣 | 第40页 |
| ·正常人外周血白细胞 | 第40-52页 |
| 2 主要试剂 | 第52页 |
| ·生物样品收集、制备和鉴定所需试剂 | 第52页 |
| ·实时荧光定量PCR试剂(盒) | 第52页 |
| 3 主要仪器设备 | 第52-53页 |
| (二) 实验方法 | 第53-61页 |
| 1 基因组DNA制备 | 第53-55页 |
| ·新鲜冻存肿瘤组织DNA制备 | 第53页 |
| ·甲醛固定石蜡包埋(FFPE)肿瘤组织DNA制备 | 第53-54页 |
| ·尿脱落细胞DNA制备 | 第54页 |
| ·外周血白细胞DNA制备 | 第54页 |
| ·DNA样品的质量鉴定 | 第54-55页 |
| 2 实时荧光定量PCR分析 | 第55-60页 |
| ·实时荧光定量PCR的反应体系和反应条件 | 第55-59页 |
| ·样品检测的质量控制与结果的判定标准 | 第59页 |
| ·实验样品检测拷贝数变化的计算公式 | 第59-60页 |
| 3 实验数据的统计学处理与分析 | 第60-61页 |
| 三、结果 | 第61-81页 |
| 1 膀胱癌基因组中高频拷贝数改变的DNA片段/基因的初步筛选 | 第63页 |
| 2 针对候选基因设计Real-time PCR引物 | 第63-66页 |
| 3 候选基因的Real-time PCR扩增条件及特性 | 第66页 |
| 4 以Real-time PCR对11个候选基因进行“跨技术平台核查” | 第66-69页 |
| 5 以Real-time PCR对“跨技术平台核查”筛选所获5个候选基因进行膀胱癌肿瘤组织的独立样本验证 | 第69-76页 |
| 6 以Real-time PCR分析经肿瘤组织独立样本验证的5个候选基因在膀胱癌患者尿脱落细胞中的拷贝数改变及其意义 | 第76-81页 |
| 四、讨论 | 第81-86页 |
| 1 目的基因和内参基因的筛选 | 第81页 |
| 2 候选目的基因的“跨技术平台”核查 | 第81-82页 |
| 3 验证用膀胱癌组织“独立样本”的选择 | 第82页 |
| 4 膀胱癌组织中候选目的基因拷贝数的改变 | 第82-84页 |
| 5 膀胱癌患者尿液脱落细胞中候选目的基因拷贝数的改变及其意义 | 第84-86页 |
| 五、本章小结 | 第86-87页 |
| 第三章 乳腺癌新辅助化疗组织病理学治疗反应相关分子标志物的研究 | 第87-133页 |
| 一、引言 | 第87-91页 |
| 二、材料与方法 | 第91-106页 |
| (一) 研究对象与实验材料 | 第91-101页 |
| 1 乳腺癌患者及其组织样品 | 第91-100页 |
| 2 主要试剂 | 第100页 |
| ·第一抗体 | 第100页 |
| ·实验试剂 | 第100页 |
| 3 主要仪器设备 | 第100-101页 |
| (二) 实验方法 | 第101-106页 |
| 1 病理组织处理 | 第101页 |
| 2 免疫组织化学染色 | 第101-102页 |
| 3 HER2基因扩增的检测(荧光原位杂交) | 第102-103页 |
| 4 研究结果的判定标准 | 第103-105页 |
| ·病理类型及病理分级标准 | 第103页 |
| ·组织病理学治疗反应评价标准 | 第103页 |
| ·被测分子标志物的免疫组化结果判定标准 | 第103-105页 |
| ·ER与PR | 第103-104页 |
| ·HER2 | 第104页 |
| ·CK5/6 | 第104页 |
| ·EGFR | 第104页 |
| ·Cyclin B1 | 第104页 |
| ·14-3-3σ | 第104页 |
| ·14-3-3ζ | 第104-105页 |
| ·HER2基因的FISH分析结果判断标准 | 第105页 |
| 5 统计学分析 | 第105-106页 |
| 三、结果 | 第106-122页 |
| 1 入组乳腺癌病例的基本特征 | 第106-108页 |
| 2 乳腺癌病例核芯针穿刺FFPE组织中8个候选蛋白的表达情况 | 第108-110页 |
| 3 乳腺癌组织中8个候选蛋白的表达与临床及病理特征的关系 | 第110-117页 |
| ·与乳腺癌患者人口学及临床特征的关系 | 第110-111页 |
| ·年龄 | 第110-111页 |
| ·月经状态 | 第111页 |
| ·临床分期 | 第111页 |
| ·与乳腺癌患者组织病理学特征的关系 | 第111-117页 |
| ·病理类型 | 第111页 |
| ·病理分级 | 第111页 |
| ·MP分级 | 第111-117页 |
| 4 病理特征及8个候选蛋白的表达与新辅助化疗组织病理学治疗反应的关系 | 第117-122页 |
| ·临床及病理特征与病理治疗反应(MP分级)的关系 | 第117-118页 |
| ·8个候选蛋白的表达与新辅助化疗组织病理学治疗反应(MP分级)的关系 | 第118-119页 |
| ·乳腺癌组织病理特征与蛋白分子标志物联合预测新辅助化疗后组织病理学治疗反应(MP分级)的效能 | 第119-122页 |
| 四、讨论 | 第122-131页 |
| 1 蛋白分子检测的发展以及免疫组化技术的优势 | 第122-123页 |
| 2 入组病例的筛选以及化疗方案的均一性 | 第123-124页 |
| 3 临床和病理特征对新辅助化疗组织病理学治疗反应的影响 | 第124-125页 |
| 4 分子标志物表达模式与新辅助化疗组织病理学治疗反应的关系 | 第125-130页 |
| 5 多因素/多分子联合检测优于单因素/单分子的检测效能 | 第130-131页 |
| 五、本章小结 | 第131-133页 |
| 参考文献 | 第133-150页 |
| 致谢 | 第150-153页 |
| 个人简历 | 第153-154页 |
