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曼氏无针乌贼SCD基因克隆与生物信息学分析

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-14页
第一章 文献综述第14-24页
   ·曼氏无针乌贼的相关研究第14-15页
     ·曼氏无针乌贼生物学特性第14页
     ·曼氏无针乌贼资源研究第14页
     ·曼氏无针乌贼繁殖习性研究第14页
     ·曼氏无针乌贼分子生物学研究第14-15页
   ·SCD 基因的研究进展第15-18页
     ·SCD1 的化学结构与种类第15-16页
     ·SCD 基因的功能第16-18页
   ·多不饱和脂肪酸研究进展第18-20页
     ·ω-3 和ω-6 脂肪酸第18页
     ·共轭脂肪酸第18页
     ·多不饱和脂肪酸的来源第18页
     ·多不饱和脂肪酸的功能第18-20页
   ·饱和脂肪酸的研究进展第20页
   ·生物信息学研究进展第20-24页
     ·生物信息学第20-21页
     ·生物信息数据库第21页
     ·生物信息学在基因克隆中的应用第21页
     ·生物信息学在序列分析中的应用第21-22页
     ·蛋白质结构和功能分析第22-24页
第二章 绪论第24-27页
   ·研究的目的与意义第24-25页
   ·研究内容与技术路线第25-27页
     ·研究内容第25页
     ·主要研究方法与路线第25-27页
第三章 曼氏无针乌贼 SCD 基因克隆与生物信息学分析第27-57页
   ·材料,仪器与试剂配制方法第27-29页
     ·实验动物、载体和菌种第27页
       ·实验动物第27页
       ·载体与菌株第27页
     ·主要试剂及配制方法第27-28页
     ·主要仪器与设备第28-29页
   ·实验方法第29-39页
     ·总 RNA 的提取第29-31页
       ·实验器具的处理第29页
       ·总 RNA 提取步骤第29-30页
       ·总 RNA 质量鉴定第30-31页
         ·吸光度检测第30页
         ·电泳检测第30-31页
     ·用于 PCR 扩增的第一链 cDNA 合成第31页
     ·引物设计与合成第31-32页
     ·曼氏无针乌贼 SCD 基因全长 cDNA 序列的扩增第32-38页
       ·曼氏无针乌贼 SCD 基因核心片段的克隆第32-33页
       ·曼氏无针乌贼 SCD 基因 5′端 cDNA 扩增第33-34页
       ·曼氏无针乌贼 SCD 基因 3′端 cDNA 扩增第34-35页
       ·PCR 产物琼脂糖凝胶电泳纯化第35-36页
       ·PCR 产物的克隆第36-38页
         ·制平板第36页
         ·感受态细胞的制备第36页
         ·连接反应第36-37页
         ·转化培养第37页
         ·PCR 鉴定及测序第37-38页
     ·生物信息学分析第38-39页
       ·开放阅读框分析第38页
       ·同源性分析第38页
       ·多序列比对及分子进化分析第38-39页
   ·结果与分析第39-50页
     ·总 RNA 的提取第39页
     ·RT-PCR 扩增结果第39-40页
       ·5′RACE 和 3′RACE 结果第40页
       ·曼氏无针乌贼 SCD 基因的全长 cDNA 序列第40-41页
       ·生物信息学分析第41-50页
       ·开放阅读框分析第41-42页
       ·核苷酸序列同源性分析第42-43页
       ·SCD 氨基酸序列的同源性分析第43页
       ·跨膜螺旋和信号肽分析第43-44页
       ·亚细胞定位分析第44-45页
       ·SCD 蛋白性质预测结果第45-47页
       ·SCD 蛋白二级结构预测结果第47页
       ·蛋白结构功能位点分析第47-48页
       ·SCD 三级结构第48-49页
       ·系统发育分析第49-50页
   ·讨论第50-57页
     ·曼氏无针乌贼总 RNA 的提取第50页
     ·PCR 扩增引物的设计及反应条件的优化第50-53页
     ·曼氏无针乌贼 SCD 蛋白的同源性分析第53页
     ·跨膜螺旋和信号肽及亲疏水性分析第53-56页
     ·SCD 蛋白质性质分析第56-57页
第四章 结论第57-58页
参考文献第58-62页
致谢第62-63页
在读期间发表的学术论文及研究成果第63页

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