| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-25页 |
| 第一节 选题背景与研究意义 | 第11-14页 |
| 一、 立题目的及意义 | 第11-12页 |
| 二、 研究意义 | 第12-14页 |
| 第二节 国内外研究进展 | 第14-23页 |
| 一、 T4 型细菌病毒 | 第14-15页 |
| 二、 T4 型细菌病毒基因多样性 | 第15-17页 |
| 三、 不同生态环境中T4 型细菌病毒g23 基因多样性 | 第17-23页 |
| （一） 海洋T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第17-18页 |
| （二） 稻田T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第18-19页 |
| （三） 湖泊T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第19-23页 |
| 第三节 研究内容、技术路线和创新点 | 第23-25页 |
| 一、 主要研究内容 | 第23页 |
| （一） 旱地黑土农田中T4 型细菌病毒g23 基因多样性 | 第23页 |
| （二） 稻田土壤T4 型细菌病毒g23 基因多样性 | 第23页 |
| （三） 稻田田面水T4 型细菌病毒g23 基因多样性 | 第23页 |
| （四） 稻旱转化及根际与非根际土壤T4 型细菌病毒g23 基因分布特征 | 第23页 |
| 二、 技术路线 | 第23-24页 |
| 三、 论文创新点 | 第24-25页 |
| 第二章 材料方法 | 第25-34页 |
| 第一节 试验设备及材料 | 第25-29页 |
| 一、 主要仪器设备及试剂配方 | 第25-29页 |
| （一） 仪器设备 | 第25页 |
| （二） 试剂配方 | 第25-29页 |
| 第二节 研究方法 | 第29-33页 |
| 一、 微生物总DNA的提取 | 第29-30页 |
| （一） 土壤DNA的提取 | 第29页 |
| （二） 水样DNA提取 | 第29-30页 |
| 二、 T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究方法 | 第30-33页 |
| （一） PCR扩增 | 第30页 |
| （二） PCR产物克隆测序分析 | 第30页 |
| （三） PCR产物的纯化 | 第30-31页 |
| （四） 大肠杆菌感受态的制备（热激感受态） | 第31页 |
| （五） PCR产物克隆 | 第31-32页 |
| （六） DGGE筛选单一条带 | 第32-33页 |
| 第三节 数据统计分析 | 第33-34页 |
| 第三章 旱地黑土T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第34-49页 |
| 第一节 供试材料 | 第34-36页 |
| 一、 供试土壤 | 第34页 |
| 二、 环境样品g23 基因描述 | 第34-36页 |
| 第二节 结果分析 | 第36-47页 |
| 一、 DNA提取及PCR扩增 | 第36页 |
| 二、 PCR产物纯化及克隆测序 | 第36-37页 |
| 三、 氨基酸序列分析 | 第37-38页 |
| 四、 旱地黑土g23 基因与NCBI数据库比对结果 | 第38-41页 |
| 五、 旱地黑土与海洋和湖泊系统进化关系分析 | 第41-42页 |
| 六、 旱地黑土与中日稻田和中国旱地系统进化关系分析 | 第42-44页 |
| 七、 旱地黑土与不同环境T4 型细菌病毒氨基酸序列的UniFrac分析 | 第44-47页 |
| 第三节 讨论 | 第47-48页 |
| 第四节 小结 | 第48-49页 |
| 第四章 稻田土壤T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第49-63页 |
| 第一节 供试材料 | 第49-51页 |
| 一、 供试土壤 | 第49页 |
| 二、 环境样品g23 基因信息 | 第49-51页 |
| 第二节 结果分析 | 第51-61页 |
| 一、 稻田土壤g23 基因与NCBI数据库比对结果 | 第51-54页 |
| 二、 稻田土壤与海洋和湖泊系统进化关系分析 | 第54-55页 |
| 三、 稻田土壤与中国部分稻田土壤和旱地黑土的系统进化关系分析 | 第55页 |
| 四、 稻田土壤与中日稻田土壤的系统进化关系分析 | 第55-57页 |
| 五、 中国东北稻田土壤与不同环境T4 型细菌病毒氨基酸距离的UniFrac分析 | 第57-61页 |
| （一） 稻田土壤T4 型细菌病毒g23 基因UniFrac分析 | 第57-59页 |
| （二） 稻田土壤与各环境中T4 型细菌病毒g23 基因UniFrac分析 | 第59-61页 |
| 第三节 讨论 | 第61-62页 |
| 第四节 小结 | 第62-63页 |
| 第五章 稻田田面水T4 型细菌病毒g23 基因多样性研究 | 第63-80页 |
| 第一节 供试材料 | 第63-64页 |
| 一、 供试土壤 | 第63页 |
| 二、 环境样品g23 基因描述 | 第63-64页 |
| 第二节 结果分析 | 第64-78页 |
| 一、 稻田田面水g23 基因与NCBI数据库比对结果 | 第64-68页 |
| 二、 稻田田面水与海洋和湖泊系统进化关系分析 | 第68页 |
| 三、 稻田田面水与中国稻田土壤和旱地黑土的系统进化关系分析 | 第68-69页 |
| 四、 稻田田面水与中日稻田土壤和日本稻田田面水系统进化关系分析 | 第69-70页 |
| 五、 稻田田面水与不同环境T4 型细菌病毒氨基酸距离的UniFrac分析 | 第70-78页 |
| （一） 稻田田面水与稻田土壤g23 基因UniFrac分析 | 第70页 |
| （二） 稻田田面水、土壤与日本稻田田面水、土壤间的UniFrac分析 | 第70-74页 |
| （三） 稻田田面水T4 型细菌病毒g23 基因UniFrac分析 | 第74-76页 |
| （四） 稻田田面水与各环境中T4 型细菌病毒g23 基因UniFrac分析 | 第76-78页 |
| 第三节 讨论 | 第78-79页 |
| 第四节 小结 | 第79-80页 |
| 第六章 旱稻转化解析T4 型细菌病毒g23 基因分布特征 | 第80-92页 |
| 第一节 旱稻转化试验设计 | 第80-83页 |
| 一、 供试材料 | 第80页 |
| 二、 试验设计 | 第80-83页 |
| 第二节 结果分析 | 第83-90页 |
| 一、 旱稻转化g23 基因与NCBI数据库比对结果 | 第83-85页 |
| 二、 旱稻转化g23 基因的系统进化关系分析 | 第85页 |
| 三、 旱稻转化试验细菌病毒g23 基因UniFrac分析 | 第85-90页 |
| （一） 土壤类型对细菌病毒g23 基因分布影响的UniFrac分析 | 第85-87页 |
| （二） 根际效应对细菌病毒g23 基因分布影响的UniFrac分析 | 第87-88页 |
| （三） 生育期对细菌病毒g23 基因分布影响的UniFrac分析 | 第88-90页 |
| 第三节 讨论 | 第90-91页 |
| 第四节 小结 | 第91-92页 |
| 第七章 结论与展望 | 第92-95页 |
| 一、研究结论 | 第92-93页 |
| 二、本研究中的不足 | 第93页 |
| 三、研究展望 | 第93-95页 |
| 参考文献 | 第95-103页 |
| 发表文章目录 | 第103-104页 |
| 致谢 | 第104页 |
