| 目录 | 第1-12页 |
| 缩略语 | 第12-13页 |
| 摘要 | 第13-15页 |
| ABSTRACT | 第15-17页 |
| 项目流程图 | 第17-18页 |
| 第一章 文献综述--EST分子标记开发及在基因组学的应用 | 第18-32页 |
| 1 EST分子标记的类型及特点 | 第18-19页 |
| 2 EST标记的开发策略 | 第19-22页 |
| ·EST数据的取得与前期处理 | 第19页 |
| ·EST聚类 | 第19页 |
| ·各类EST标记的开发 | 第19-22页 |
| ·EST-PCR和EST-SSR标记的开发 | 第19-20页 |
| ·EST-SNP的开发 | 第20-21页 |
| ·EST-AFLP标记的开发 | 第21-22页 |
| ·EST-RFLP标记的开发 | 第22页 |
| 3 EST标记在比较基因组学研究中的应用 | 第22-25页 |
| ·比较作图研究 | 第22-23页 |
| ·遗传多样性评价 | 第23-24页 |
| ·系统发育学研究 | 第24-25页 |
| 4 EST在基因功能研究上的应用 | 第25页 |
| 5 结束语 | 第25-32页 |
| 第二章 油菜EST资源的SSR信息分析 | 第32-42页 |
| 1 材料和方法 | 第33页 |
| ·油菜EST来源 | 第33页 |
| ·EST前处理 | 第33页 |
| ·去冗余——聚类 | 第33页 |
| ·聚类拼接序列的注释 | 第33页 |
| ·SSR筛选 | 第33页 |
| 2 结果和分析 | 第33-37页 |
| ·油菜EST中出现SSR的频率 | 第33-34页 |
| ·油菜EST-SSR的特性 | 第34页 |
| ·油菜EST-SSR的可用性评价 | 第34-37页 |
| 3 讨论 | 第37-42页 |
| 第三章 油菜EST-SSR标记的建立 | 第42-52页 |
| 1 材料和方法 | 第42-45页 |
| ·植物材料与模板DNA的提取 | 第42-43页 |
| ·EST中SSR序列的获得 | 第43页 |
| ·EST-SSR引物设计 | 第43页 |
| ·退火温度的测试 | 第43-45页 |
| ·非变性聚丙烯胺凝胶的制备 | 第45页 |
| ·电泳分离 | 第45页 |
| ·银染 | 第45页 |
| 2 结果与分析 | 第45-47页 |
| ·退火温度的确定和引物筛选 | 第45-46页 |
| ·EST-SSR标记的多态性 | 第46-47页 |
| 3 讨论 | 第47-52页 |
| 第四章 EST-SSRS检测油菜亲本遗传多样性 | 第52-59页 |
| 1 材料与方法 | 第52-56页 |
| ·供试材料 | 第52-54页 |
| ·样本DNA的提取 | 第54页 |
| ·PCR体系的建立 | 第54页 |
| ·非变性聚丙烯胺凝胶的配制 | 第54页 |
| ·电泳分离 | 第54页 |
| ·银染 | 第54页 |
| ·统计分析 | 第54-56页 |
| 2 结果与分析 | 第56-57页 |
| ·SSR标记多态性分析 | 第56页 |
| ·SSR标记聚类结果 | 第56-57页 |
| 3 讨论 | 第57-59页 |
| 附图 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 附录 | 第64页 |