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牦牛的起源与系统发育分析

中文摘要第1-10页
ABSTRACT第10-12页
第一部分 文献综述第12-38页
 第一章 牦牛的起源及系统发育分析第12-24页
  1 牦牛的起源第12-13页
  2 牦牛与牛亚科其它物种系统发育研究第13-21页
   ·古生物学研究第13-14页
   ·形态学研究第14页
   ·血液蛋白多态性研究第14-15页
   ·分子生物学研究第15-21页
     ·mtDNA的研究第15-18页
     ·微卫星DNA的研究第18页
     ·核基因组研究第18-21页
  参考文献第21-24页
 第二章 与系统发育相关的几个基因介绍第24-38页
  1 线粒体DNA及其在系统发育研究中的应用第24-28页
   ·牛线粒体DNA第24-27页
     ·线粒体DNA的结构第24-25页
     ·线粒体DNA的遗传特点第25-26页
     ·线粒体D-loop区的结构与特点第26-27页
   ·线粒体DNA在牛系统发育研究中的应用第27-28页
  2 Y染色体及其在系统发育研究中的应用第28-30页
   ·牛Y染色体第28-29页
     ·Y染色体的发现第28页
     ·Y染色体的组成第28-29页
     ·Y染色体上基因的遗传特性第29页
   ·Y染色体基因在哺乳动物系统发育研究中的应用第29-30页
  3 MHC及其在系统发育研究中的应用第30-34页
   ·牛主要相容性复合体(BoLA)第30-32页
     ·BoLA的发现与命名第30页
     ·BoLA的结构第30-31页
     ·BoLA的基本特征第31-32页
     ·BoLA的进化速率第32页
   ·MHC在系统发育研究中的应用第32-34页
  参考文献第34-38页
第二部分 试验研究第38-74页
 第三章 牦牛线粒体D-loop区的序列测定核系统发育分析第38-54页
  1 试验材料第38-40页
   ·试验动物第38页
   ·网络资源及软件第38-39页
   ·主要仪器设备第39页
   ·药品及试剂第39页
   ·常规溶液及试剂配制第39-40页
  2 试验方法第40-43页
   ·DNA的提取第40-41页
   ·PCR扩增第41页
     ·引物设计与合成第41页
     ·最PCR条件的建立第41页
   ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测第41-42页
     ·12%聚丙烯酰胺凝胶制作及电泳第41-42页
     ·硝酸银染色第42页
   ·PCR产物纯化第42页
   ·PCR产物序列测定第42页
   ·数据分析第42-43页
   ·分化时间估计第43页
  3 结果与分析第43-49页
   ·PCR产物扩增结果第43页
   ·牛亚科线粒体D-loop区序列变异及系统发育分析第43-45页
   ·第一高变区的序列变异与系统发育分析第45-47页
   ·第二高变区的序列变异分析与系统发育分析第47-49页
   ·分歧时间的计算第49页
  4 讨论第49-52页
   ·牛亚科动物D-loop区的多态性第49-50页
   ·牦牛的起源第50页
   ·牦牛的系统发育分析第50-52页
  参考文献第52-54页
 第四章 TSPY与DBY序列测定与系统发育分析第54-65页
  1 试验材料(同第三章)第54页
  2 试验方法第54-56页
   ·DNA的提取第54页
   ·PCR扩增(同第三章)第54-55页
     ·引物的设计与合成第54-55页
     ·最佳PCR条件的建立第55页
   ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测(同第三章)第55页
   ·PCR产物纯化(同第三章)第55页
   ·PCR产物序列测定(同第三章)第55页
   ·数据分析(同第三章)第55-56页
   ·分化时间估计(同第三章)第56页
  3 结果与分析第56-60页
   ·PCR产物扩增结果第56页
   ·牦牛TSPY及DBY基因序列第56页
   ·牛亚科TSPY及DBY基因序列变异第56-58页
   ·牛亚科系统发育分析第58-60页
   ·分化时间的计算第60页
  4 讨论第60-63页
   ·牦牛的起源第60-61页
   ·牦牛的系统发育分析第61-63页
  参考文献第63-65页
 第五章 MHC-DRB基因上游调控区的序列测定和系统发育分析第65-74页
  1 材料与方法(同第三章)第65页
   ·试验动物第65页
   ·网络资源及软件(同第三章)第65页
   ·主要仪器设备(同第三章)第65页
   ·药品及试剂(同第三章)第65页
   ·常规溶液及试剂配制(同第三章)第65页
  2 试验方法第65-66页
   ·DNA的提取(同第三章第66页
   ·PCR扩增第66页
     ·引物设计与合成第66页
     ·最佳PCR条件的建立第66页
   ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测(同第三章)第66页
   ·PCR产物纯化(同第三章)第66页
   ·PCR产物序列测定(同第三章)第66页
   ·数据分析第66页
  3 结果第66-68页
   ·PCR扩增结果第66-67页
   ·BoLA-DRB基因上游调控区的序列变异第67-68页
   ·BoLA-DRB基因上游调控区序列系统发育分析第68页
  4 讨论第68-71页
  参考文献第71-74页
全文结论第74-76页
致谢第76-78页
硕士期间发表论文第78页

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