摘要 | 第1-4页 |
Abstract | 第4-7页 |
第1章 引言 | 第7-11页 |
·背景和意义 | 第7-10页 |
·论文各部分主要内容 | 第10-11页 |
第2章 基因芯片数据及预处理方法. | 第11-21页 |
·基因芯片表达谱数据 | 第11-14页 |
·基因芯片实验 | 第11-13页 |
·数据形式 | 第13-14页 |
·基因芯片数据库 | 第14页 |
·基因芯片数据的预处理 | 第14-21页 |
·数据的对数变换 | 第15页 |
·数据的标准化 | 第15-19页 |
·遗失数据的估计 | 第19-21页 |
第3章 基于基因集的基因芯片数据分析方法. | 第21-45页 |
·单个基因差异表达的统计描述 | 第21-29页 |
·单组实验条件下基因差异表达的统计描述 | 第21-23页 |
·两组实验条件间基因差异表达的统计描述 | 第23-25页 |
·时间序列芯片数据中基因差异表达的统计描述 | 第25-29页 |
·基于基因集的统计分析方法 | 第29-40页 |
·基因集显著性的统计描述 | 第31-36页 |
·基因集显著性的统计量的选取 | 第36-37页 |
·对基因集大小影响的修正 | 第37-39页 |
·基于基因集的芯片数据分析步骤及特殊情况的处理 | 第39-40页 |
·多重假设检验中的显著性分析 | 第40-45页 |
·False Discovery Rate 及其估计q-value | 第40-44页 |
·q-value 的计算步骤 | 第44-45页 |
第4章 与寒热证相关的基因芯片数据分析. | 第45-52页 |
·数据的采集与整理 | 第45-47页 |
·计算结果与分析 | 第47-52页 |
第5章 讨论与总结 | 第52-54页 |
·总结 | 第52页 |
·存在的问题和未来的工作 | 第52-54页 |
参考文献 | 第54-58页 |
致谢 | 第58-59页 |
附录A 低显著性阈值下与寒热证相关的基因集列表 | 第59-64页 |
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果 | 第64页 |