| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-12页 |
| 第一章 基因表达系统中的随机性及其研究方法 | 第12-35页 |
| ·基因表达体系中的分子生物学概念 | 第12-19页 |
| ·基因及其表达机制 | 第12-15页 |
| ·基因表达的调控 | 第15-19页 |
| ·基因转录调节网络的随机性研究的现状 | 第19-22页 |
| ·基因调节网络中内噪声的研究现状 | 第20-21页 |
| ·基因调节网络中外噪声的研究现状 | 第21-22页 |
| ·非线性系统的随机理论和研究方法 | 第22-33页 |
| ·噪声 | 第22-24页 |
| ·朗之万方法 | 第24-32页 |
| ·Gillespie方法 | 第32页 |
| ·τ-leap方法 | 第32-33页 |
| ·本文的主要工作及安排 | 第33-35页 |
| 第二章 单细胞中一般基因调控过程的随机动力学研究 | 第35-55页 |
| ·生物基因开关及其动力学方程 | 第35-38页 |
| ·大肠杆菌中的基因开关 | 第36页 |
| ·基因转录开关的动力学方程 | 第36-38页 |
| ·外噪声诱导基因开关 | 第38-49页 |
| ·无关联的噪声对基因开关的控制 | 第39-42页 |
| ·有关联的噪声对基因开关的控制 | 第42-48页 |
| ·讨论 | 第48-49页 |
| ·内噪声诱导基因开关 | 第49-53页 |
| ·内噪声存在下的随机模型 | 第49-51页 |
| ·内噪声调控基因开关的转换 | 第51-53页 |
| ·讨论 | 第53页 |
| ·本章小结 | 第53-55页 |
| 第三章 多细胞耦合系统中时钟基因表达调控过程的信号噪声效应 | 第55-80页 |
| ·人工设计的多细胞生理时钟模型及其生物背景 | 第56-65页 |
| ·生理时钟发生的结构基础和分子基础 | 第56-58页 |
| ·SCN神经元的耦合方式 | 第58-61页 |
| ·人工设计多细胞生理时钟模型 | 第61-65页 |
| ·耦合信号诱导人工设计振子细胞进入同步状态 | 第65-69页 |
| ·时间序列上观测固有频率不同的细胞进入同步 | 第65-66页 |
| ·细胞同步性的定量研究 | 第66-69页 |
| ·耦合信号中的涨落对双细胞系统同步行为的影响 | 第69-78页 |
| ·耦合系统从非同步到同步过程中的分岔机制 | 第70-71页 |
| ·信号流中的噪声对耦合系统同时起到积极和消极的作用 | 第71-74页 |
| ·讨论 | 第74-78页 |
| ·小结 | 第78-80页 |
| 第四章 T淋巴细胞中钙信号调控基因表达的随机性研究 | 第80-108页 |
| ·生物背景 | 第81-86页 |
| ·T淋巴细胞的特点 | 第81页 |
| ·活性T淋巴细胞中钙离子波的形成 | 第81-83页 |
| ·细胞对Ca~(2+)信号所包含的刺激信息的记忆过程 | 第83-86页 |
| ·[Ca~(2+)]_i调控基因表达过程的动力学方程 | 第86-100页 |
| ·T淋巴细胞中Ca~(2+)浓度的振荡方程 | 第87-90页 |
| ·转录因子NF-AT活性调控的数学模型 | 第90-93页 |
| ·NF-AT调控基因IL-2表达的动力学方程 | 第93-97页 |
| ·模拟钙信号对编码IL-2的报告基因的调控 | 第97-100页 |
| ·讨论 | 第100页 |
| ·基因对钙刺激产生记忆过程的随机性研究 | 第100-106页 |
| ·直流钙信号中内噪声作用 | 第100-103页 |
| ·方波信号中的内噪声作用 | 第103-105页 |
| ·讨论 | 第105-106页 |
| ·本章小结 | 第106-108页 |
| 第五章 总结与展望 | 第108-111页 |
| 参考文献 | 第111-120页 |
| 博士期间完成论文情况 | 第120页 |
