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丝状真菌纤维素酶农杆菌介导转化系统的构建及其在纤维素酶学研究中的应用

摘要第1-9页
ABSTRACT第9-10页
第一章 绪论第10-27页
   ·纤维素酶的性质、分子结构分析、功能及应用第11-20页
     ·纤维素及纤维素酶第11-12页
     ·纤维素酶的研究历程第12-13页
     ·纤维素酶的性质及纤维素酶的降解机制第13-14页
     ·纤维素酶的分子结构与功能第14-18页
       ·CBD结构以及结构功能预测第15-17页
       ·催化区的结构特征与功能第17-18页
     ·纤维素酶的合成调控第18-19页
     ·纤维素酶的应用第19-20页
   ·农杆菌介导转化系统第20-26页
     ·农杆菌第20-21页
     ·根癌农杆菌分子生物学特征第21-22页
       ·Ti质粒的结构与功能第21页
       ·Ti质粒的转化机理第21-22页
     ·农杆菌转化法第22-24页
       ·农杆菌转化法第22页
       ·影响农杆菌转化的因素第22-24页
     ·根瘤农杆菌介导转化真菌体系第24-26页
       ·真菌转化中的技术优势第24页
       ·遗传转化筛选标记第24-26页
   ·本研究的目的和意义第26-27页
第二章 丝状真菌纤维素酶农杆菌转化系统的构建第27-45页
   ·实验材料第28-29页
     ·菌种和质粒第28页
     ·分子克隆用酶和试剂第28-29页
     ·培养基和溶液第29页
   ·实验方法第29-32页
     ·瑞氏木霉/粗糙脉孢菌孢子培养及处理第29页
     ·根癌农杆菌感受态细胞的制备和转化第29-30页
     ·根癌农杆菌中质粒的提取第30-31页
     ·根瘤农杆菌的培养及处理第31页
     ·根瘤农杆菌介导瑞氏木霉/粗糙脉孢菌转化第31页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第31-32页
     ·引物设计第32页
       ·cbh1真核表达元件构建引物定义为:P_1/P_2第32页
       ·cbh1真核表达元件扩增引物定义为P_3/P_4第32页
   ·结果与讨论第32-45页
     ·粗糙脉孢菌ppt抗性实验,确定抗生素浓度第32-33页
     ·根瘤农杆菌转化粗糙脉孢菌实验第33-34页
       ·乙酰丁香酮浓度以及孢子浓度对根瘤农杆菌转化的影响第33-34页
       ·农杆菌介导转化转化第34页
     ·野生型纤维素外切酶农杆菌介导转化质粒构建第34-38页
       ·丝状真菌组成型表达元件构建第35页
       ·cbh1基因获得第35-36页
       ·pBPT19一cbh1构建第36-38页
     ·构建农杆菌转化质粒pB01-cbh1-bar质粒第38-41页
     ·质粒转化根瘤农杆菌第41-42页
     ·农杆菌介导将CBHⅠ基因转化到粗糙脉孢菌第42-45页
       ·CBHⅠ基因组成型表达元件转化粗糙脉孢菌第42-45页
第三章 纤维素酶的组成型表达第45-54页
   ·实验材料第45-46页
     ·菌种和溶液第45-46页
   ·实验方法第46-50页
     ·发酵方法及生长曲线测定第46-47页
     ·SDS凝胶电泳第47页
     ·pNP法酶活测定第47-49页
       ·pNP标准曲线的绘制第47-48页
       ·pNPC测定外切酶CBHⅠ活性第48-49页
     ·蛋白浓度测定第49-50页
   ·结果与讨论第50-54页
     ·不同条件下纤维素酶组成型转化子的生长曲线及酶活测定第50-51页
     ·组成型表达的纤维素酶的初步纯化第51-52页
     ·蛋白比酶活测定第52-54页
第四章 CBHⅠ吸附结构域纤维单链剥离机制模式的验证第54-78页
   ·实验材料第55-56页
     ·菌种和质粒第55页
     ·培养基和溶液第55-56页
     ·实验用到的软件第56页
     ·农杆菌介导转化试剂及蛋白表达检测第56页
   ·实验方法第56-62页
     ·点突变试剂盒原理第56-57页
     ·选择性寡聚核糖核苷酸(Selection oligonucleotides)第57-58页
     ·碱变性第58页
     ·杂交反应体系第58-59页
     ·合成与连接第59页
     ·验证感受态细胞效率第59-60页
     ·转化感受态细胞BMH71-18mutS第60页
     ·转化感受态细胞JM109第60-61页
     ·点突变引物设计第61页
     ·纤维素酶组成型表达构建及丝状真菌转化方法第61页
     ·纤维素酶活测定以及蛋白浓缩及检测方法第61-62页
   ·结果讨论第62-78页
     ·CBHⅠ吸附结构域模拟第62-65页
       ·利用Pymol软件模拟纤维素与CBD结合情况第62-63页
       ·计算纤维素链受力情况:第63-65页
     ·对于确定的潜在位点进行相应的突变研究第65-70页
       ·模板DNA的准备第65-67页
       ·点突变以及转化BMH71-18mutS第67-68页
       ·JM109转化子提取质粒第68页
       ·pUCMT-cbh1突变子测序结果第68-70页
     ·将点突变基因组成型表达元件构建到粗糙脉孢菌中:第70-76页
       ·将突变的基因构建到含有真菌表达启动子和终止子的载体中去构建真菌表达元件第70-72页
       ·构建突变位点的农杆菌转化质粒第72-73页
       ·质粒转化农杆菌第73-74页
       ·农杆菌转化丝状真菌粗糙脉孢菌第74-76页
     ·转化子蛋白性质测定第76-78页
       ·蛋白表达第76页
       ·转化子蛋白比酶活性质测定第76-78页
总结与展望第78-79页
参考文献第79-82页
致谢第82-83页
学位论文评阅及答辩情况表第83页

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