| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-10页 |
| 第一部分 前言 | 第10-32页 |
| 1 线粒体及其生化特征 | 第10-22页 |
| ·线粒体分布及其形态特征 | 第10页 |
| ·线粒体的起源 | 第10页 |
| ·线粒体的增殖 | 第10-11页 |
| ·线粒体基因特征 | 第11-14页 |
| ·线粒体基因组成特征 | 第11-12页 |
| ·线粒体 DNA的扩增 | 第12-14页 |
| ·线粒体基因组特征 | 第14-20页 |
| ·线粒体基因组部分基因研究进展 | 第14-19页 |
| ·线粒体基因组的基因排序 | 第19-20页 |
| ·线粒体基因与核基因的互作 | 第20页 |
| ·线粒体的异质性 | 第20-21页 |
| ·线粒体的遗传特点 | 第21-22页 |
| 2 线粒体基因组的研究进展 | 第22-29页 |
| ·基因组学研究进展 | 第22-23页 |
| ·基因组学及其研究进展 | 第22页 |
| ·结构基因组学 | 第22-23页 |
| ·功能基因组学 | 第23页 |
| ·比较基因组学 | 第23页 |
| ·线粒体基因组学研究进展 | 第23-26页 |
| ·线粒体基因组研究方法 | 第26-28页 |
| ·线粒体基因组 DNA的分离 | 第26-27页 |
| ·线粒体基因组的测序策略 | 第27-28页 |
| ·线粒体基因组研究意义 | 第28-29页 |
| 3 直翅目昆虫全线粒体基因组研究进展 | 第29-32页 |
| ·直翅目简介 | 第29-31页 |
| ·斑腿蝗科研究 | 第29页 |
| ·中华稻蝗、长翅燕蝗和四川凸额蝗介绍 | 第29-31页 |
| ·直翅目昆虫线粒体的研究进展 | 第31页 |
| ·课题的来源、目的和意义 | 第31-32页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第32-44页 |
| 1 实验材料 | 第32-35页 |
| ·实验标本采集、保存和鉴定 | 第32页 |
| ·仪器和试剂 | 第32-35页 |
| ·主要的实验仪器 | 第32-33页 |
| ·主要的实验试剂 | 第33-34页 |
| ·生物信息学软件 | 第34-35页 |
| 2 实验方法 | 第35-41页 |
| ·总 DNA提取及检测 | 第35-36页 |
| ·提取过程所用的试剂 | 第35页 |
| ·总 DNA提取的步骤 | 第35页 |
| ·总 DNA的检测 | 第35-36页 |
| ·长 PCR和二次 PCR扩增 | 第36-41页 |
| ·长 PCR和二次 PCR引物的设计 | 第36-38页 |
| ·长 PCR的扩增和纯化 | 第38-39页 |
| ·Sub-PCR扩增和纯化 | 第39-41页 |
| ·二次PCR产物直接测序和克隆测序 | 第41页 |
| 3 数据处理和分析 | 第41-44页 |
| ·测序数据的处理和初步分析 | 第41页 |
| ·序列的拼接与注释 | 第41-44页 |
| ·测序结果的拼接 | 第41-42页 |
| ·线粒体基因组序列的注释与基因定位 | 第42页 |
| ·线粒体基因组基因组成情况的分析 | 第42页 |
| ·线粒体基因组的tRNA、srRNA和lrRNA二级结构的预测 | 第42页 |
| ·线粒体基因组的AT丰富区保守元件和茎环结构的预测 | 第42-43页 |
| ·斑腿蝗科三种蝗虫与其它昆虫线粒体基因组的比较 | 第43-44页 |
| 第三部分 结果分析与讨论 | 第44-89页 |
| 1 线粒体 DNA的获得和测序 | 第44-47页 |
| ·总 DNA的提取结果 | 第44-45页 |
| ·长 PCR的扩增和纯化 | 第45页 |
| ·二次 PCR的扩增和纯化 | 第45-46页 |
| ·二次 PCR产物测序策略 | 第46-47页 |
| 2 序列拼接结果 | 第47-49页 |
| ·中华稻蝗的序列拼接情况 | 第47页 |
| ·长翅燕蝗的序列拼接情况 | 第47页 |
| ·四川凸额蝗的序列拼接情况 | 第47-49页 |
| 3 全线粒体的基因组结构及其组成分析 | 第49-89页 |
| ·线粒体基因组的基本情况 | 第49-59页 |
| ·线粒体基因组结构 | 第49-50页 |
| ·线粒体基因间重叠 | 第50页 |
| ·线粒体基因间间隔 | 第50-56页 |
| ·碱基组成特点分析 | 第56-59页 |
| ·蛋白质基因组成及密码子偏向性的分析 | 第59-72页 |
| ·蛋白质起始和终止密码子使用分析 | 第59-60页 |
| ·蛋白质密码子使用情况分析 | 第60-63页 |
| ·蛋白质基因的碱基组成分析 | 第63-66页 |
| ·蛋白质基因的链间偏向性 | 第66-71页 |
| ·蛋白质基因亲水性分析 | 第71-72页 |
| ·tRNA基因的注释和分析 | 第72-77页 |
| ·rRNA基因的注释和分析 | 第77-82页 |
| ·AT丰富区的分析 | 第82-87页 |
| ·中华稻蝗、长翅燕蝗和四川凸额蝗与其他昆虫线粒体基因组比较 | 第87-89页 |
| 第四部分 总结 | 第89-91页 |
| 参考文献 | 第91-102页 |
| 附录 | 第102-104页 |
| 致谢 | 第104-105页 |
| 攻读学位期间的研究成果 | 第105页 |
