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淹水胁迫下薏苡乙醇脱氢酶(ADH1)和丙酮酸脱羧酶(PDC1)基因cDNA片段的克隆及其表达的初步分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-9页
缩略词表第9-10页
第一章 文献综述第10-23页
 1 植物基因克隆方法概述第10-15页
   ·正向遗传学与基因克隆策略第10-12页
     ·功能克隆第10页
     ·表型克隆第10-12页
     ·基因表达序列分析及基因芯片第12页
   ·反向遗传学与基因克隆策略第12-14页
   ·TILLING技术第14页
   ·基因陷阱第14-15页
 2 植物厌氧响应相关基因的表达调控机制第15-21页
   ·厌氧应答基因序列特点第16-17页
   ·高等植物感受厌氧信号的模式第17-19页
   ·厌氧响应相关基因的表达调控特点第19-20页
     ·AtMYB2参与厌氧反应的调控第20-21页
 3.研究的目的与意义第21-23页
第二章 薏苡乙醇脱氢酶(ADH1)及丙酮酸脱羧酶(PDC1)基因CDNA的克隆第23-36页
 1 材料与方法第23-30页
   ·材料第23-24页
     ·分子生物学试剂及来源第23页
     ·菌株及载体第23页
     ·常用缓冲液、溶液及培养基第23-24页
     ·引物序列第24页
   ·实验方法第24-30页
     ·材料种植第24-25页
     ·总RNA的提取第25页
     ·甲醛变性电泳检测RNA第25-26页
     ·引物的设计第26页
     ·cDNA链的合成第26页
     ·cDNA链质量的检测第26-27页
     ·目的基因PCR扩增体系的建立第27页
     ·目的基因的电泳检测第27页
     ·PCR产物的回收第27-28页
     ·回收片段的连接第28页
     ·大肠杆菌感受态细胞的制备第28页
     ·连接产物的转化第28-29页
     ·转化子的筛选第29页
     ·重组质粒的快速检测第29页
     ·质粒的提取第29-30页
     ·重组质粒的酶切鉴定第30页
     ·菌种的保存及测序第30页
 2 结果与分析第30-34页
   ·薏苡根部及叶片RNA提取第30-31页
   ·cDNA的合成及其质量的检测第31页
   ·目的基因扩增条件的优化第31-32页
   ·薏苡ADH1及PDC1基因的扩增第32-33页
   ·阳性克隆的筛选及鉴定第33页
   ·序列的测定第33-34页
 3 讨论第34-36页
   ·有关薏苡RNA的提取第34-35页
   ·关于RT-PCR与质粒的转化及克隆第35-36页
第三章 薏苡乙醇脱氢酶(ADH1)及丙酮酸脱羧酶(PDC1)基因CDNA的生物信息学分析第36-49页
 1.材料与方法第36-37页
   ·材料第36-37页
   ·生物信息学分析方法第37页
 2 结果与分析第37-47页
   ·ADH1基因核苷酸序列分析第37-38页
   ·ADH1基因编码的氨基酸序列分析第38-40页
   ·ADH1基因的分子进化分析第40-41页
   ·PDC1基因核苷酸序列分析第41-42页
   ·PDC1基因编码的氨基酸的序列分析第42-46页
   ·PDC基因家族的分子进化分析第46-47页
 3 讨论第47-49页
第四章 ADH1、PDC1基因淹水胁迫下的表达模式及酶活性变化分析第49-60页
 1.材料与方法第49-51页
   ·材料第49页
     ·药品与试剂第49页
     ·引物序列第49页
   ·方法第49-51页
     ·实验材料第49页
     ·RNA提取及检测第49页
     ·反转录反应第49-50页
     ·PCR扩增体系第50页
     ·循环参数的确定第50页
     ·ADH、PDC酶蛋白的提取第50-51页
     ·酶活性的测定第51页
     ·半定量分析第51页
     ·数据处理及方差分析第51页
 2.结果及分析第51-56页
   ·循环参数的确定第51-53页
   ·薏苡根尖ADH1、PDC1基因表达的相对定量结果第53-54页
   ·薏苡叶片ADH1、PDC1基因表达的相对定量结果第54页
   ·ADH、PDC酶活力变化情况第54-56页
 3.讨论第56-60页
   ·关于半定量RT-PCR技术第56-57页
   ·ADH1,PDC1表达量及酶活力与耐渍性关系第57-60页
参考文献第60-71页
致谢第71页

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