| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-25页 |
| ·课题背景 | 第11-13页 |
| ·国内外研究现状 | 第13-23页 |
| ·编码基因识别研究现状 | 第14-19页 |
| ·非编码RNA基因识别研究现状 | 第19-23页 |
| ·主要研究内容 | 第23-24页 |
| ·论文结构 | 第24-25页 |
| 第二章 非编码RNA相关知识 | 第25-35页 |
| ·生物信息学基本概念 | 第25-28页 |
| ·非编码RNA基本概念 | 第28-30页 |
| ·非编码RNA序列特征 | 第30-31页 |
| ·非编码RNA序列数据库 | 第31-35页 |
| 第三章 基于比较序列分析的非编码RNA二级结构模型设计 | 第35-60页 |
| ·非编码RNA二级结构模型 | 第35-46页 |
| ·隐马氏模型的基本原理 | 第36-37页 |
| ·上下文敏感的隐马氏模型 | 第37-41页 |
| ·模型基本算法 | 第41-46页 |
| ·比较基因组中的物种进化关系 | 第46-51页 |
| ·进化分析简介 | 第47-48页 |
| ·氨基酸置换矩阵 | 第48-51页 |
| ·非编码RNA基因识别模型的构建 | 第51-60页 |
| ·非编码RNA二级结构模型的构建 | 第51-58页 |
| ·运用pair-csHMM模型的实例 | 第58-60页 |
| 第四章 非编码RNA基因识别原型系统的实现 | 第60-72页 |
| ·非编码RNA基因识别模型的框架 | 第60-61页 |
| ·非编码RNA基因识别系统的实现技术 | 第61-66页 |
| ·识别模型的训练 | 第66-69页 |
| ·测试与讨论 | 第69-72页 |
| 第五章 结论与展望 | 第72-75页 |
| ·结论 | 第72-73页 |
| ·展望 | 第73-75页 |
| 致谢 | 第75-76页 |
| 参考文献 | 第76-80页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第80页 |