| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 1 绪论 | 第9-23页 |
| ·DNA序列的几何图形表示方法 | 第10-17页 |
| ·图形表示应用于序列相似性分析的矩阵不变量方法 | 第17-19页 |
| ·DNA序列图形表示方法的其它应用 | 第19-21页 |
| ·本文研究计划 | 第21-23页 |
| 2 DNA序列的图形表示及其相似性分析 | 第23-49页 |
| ·一类2维图形表示及其数值特征 | 第24-33页 |
| ·分布曲线及其应用 | 第33-40页 |
| ·一个3维图形表示及其相似性分析 | 第40-49页 |
| 3 RNA二级结构的图形表示及其相似性分析 | 第49-69页 |
| ·RNA树图及其结构不变量 | 第50-51页 |
| ·一个2D图形表示及其相似性分析 | 第51-57页 |
| ·一类新的2D图形表示和它们的应用 | 第57-65页 |
| ·一个6D表示及相似性分析 | 第65-68页 |
| ·小结 | 第68-69页 |
| 4 蛋白质序列的图形表示及其相似性分析 | 第69-91页 |
| ·蛋白质序列的20D表示及其相似性分析 | 第71-77页 |
| ·基于氨基酸分类的蛋白质序列的3D图形表示及其相似性比较 | 第77-83页 |
| ·基于氨基酸理化性质的2D图形表示及其应用 | 第83-91页 |
| 5 种系发生树的构建 | 第91-99页 |
| ·常用种系发生树重建方法 | 第91-93页 |
| ·构建序列进化树的主要步骤及相关软件 | 第93-94页 |
| ·基于核苷酸三联体构建种系树 | 第94-99页 |
| 附录 | 第99-101页 |
| 参考文献 | 第101-106页 |
| 创新点摘要 | 第106-107页 |
| 攻读博士学位期间发表学术论文情况 | 第107-108页 |
| 致谢 | 第108-109页 |
| 大连理工大学学位论文版权使用授权书 | 第109页 |