| 第一章 绪论 | 第1-11页 |
| ·论文选题背景 | 第7-8页 |
| ·马铃薯研究的重要性 | 第7页 |
| ·课题的提出 | 第7-8页 |
| ·论文的主要工作及结构安排 | 第8-11页 |
| 第二章 生物信息学与XML简介 | 第11-22页 |
| ·生物信息学概述 | 第11-17页 |
| ·蛋白质结构和功能预测的重要作用和理论基础 | 第17-20页 |
| ·XML技术及应用 | 第20-22页 |
| 第三章 马铃薯生物学二级数据库的构建 | 第22-27页 |
| ·数据来源、格式、内容 | 第22-23页 |
| ·数据的获取 | 第23-24页 |
| ·数据的存储 | 第24-26页 |
| ·数据的映射及二级数据库结构 | 第24-25页 |
| ·数据的批量存储及实现 | 第25-26页 |
| ·本章小结 | 第26-27页 |
| 第四章 马铃薯生物数据处理软件基本模块实现 | 第27-31页 |
| ·打开各种格式文件和格式转换模块 | 第27-29页 |
| ·数据格式转换的必要性 | 第27-28页 |
| ·打开各种格式的数据文件 | 第28页 |
| ·数据格式转换 | 第28-29页 |
| ·数据库基本操作模块 | 第29页 |
| ·数据提交模块 | 第29-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第五章 马铃薯生物数据处理软件的主要模块实现 | 第31-50页 |
| ·序列基本分析模块 | 第31-34页 |
| ·基于BLAST本地化的数据库相似性搜索模块 | 第34-35页 |
| ·多序列比对模块 | 第35页 |
| ·构建进化树模块 | 第35-36页 |
| ·蛋白质二级结构预测模块 | 第36-49页 |
| ·问题的提出及改进 | 第36-37页 |
| ·基于遗传多神经网络蛋白质二级结构预测模块设计和实现 | 第37-49页 |
| ·样本和测试数据的来源 | 第37-38页 |
| ·改进的遗传算法的设计 | 第38-41页 |
| ·遗传多神经网络模型设计和实现 | 第41-48页 |
| ·蛋白质二级结构预测模块的实现 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第六章 马铃薯生物信息研究平台应用实例 | 第50-63页 |
| ·马铃薯蔗糖转运蛋白实例分析 | 第50-60页 |
| ·基因StSUT2密码子统计图、寻找ORF结果、密度分布图、相似性搜索 | 第52-56页 |
| ·蔗糖转运蛋白序列分析-多序列比对、发育树 | 第56-58页 |
| ·基因StSUT2编码的蛋白质二级结构预测 | 第58-60页 |
| ·胰岛素实例分析 | 第60-62页 |
| ·胰岛素介绍 | 第60-61页 |
| ·胰岛素二级结构预测 | 第61-62页 |
| ·本章小结 | 第62-63页 |
| 第七章 结束语 | 第63-65页 |
| ·总结 | 第63页 |
| ·展望及进一步的工作 | 第63-65页 |
| 致谢 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-69页 |
| 附录A 攻读学位期间发表论文目录 | 第69-70页 |
| 附录B INSDSeqxml文件的DTD模型 | 第70-71页 |
| 附录C 数据格式 | 第71-72页 |
| 附录D 有根树 | 第72-73页 |
| 附录E 无根树 | 第73页 |