| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 引言 | 第7-9页 |
| 第一章 应用抑制削减杂交进行鼠疫耶尔森氏菌的比较基因组研究 | 第9-20页 |
| 1.材料与方法 | 第10-14页 |
| 2.结果与讨论 | 第14-18页 |
| ·克隆测序质量 | 第14页 |
| ·鼠疫菌生物型特异DNA片段的确定 | 第14页 |
| ·差异片段在260株鼠疫菌和7株假结核菌中的分布 | 第14-16页 |
| ·基于DFR谱的鼠疫菌微进化分析 | 第16-18页 |
| 参考文献 | 第18-20页 |
| 第二章 鼠疫菌基因组重排谱与适应性进化的研究 | 第20-39页 |
| 1.材料与方法 | 第21-24页 |
| 2.结果与讨论 | 第24-36页 |
| ·比较基因组学分析 | 第24-25页 |
| ·基于基因组重排的基因分型 | 第25-26页 |
| ·基因组重排与病原菌表型和毒力变异的关系 | 第26-33页 |
| ·基因组重排与和宿主扩张的关系 | 第33页 |
| ·基因组重排和鼠疫菌种形成 | 第33-34页 |
| ·鼠疫菌的微进化 | 第34-36页 |
| 参考文献 | 第36-39页 |
| 第三章 中国鼠疫菌基因分型系统的建立 | 第39-49页 |
| 1.材料与方法 | 第40-44页 |
| 2.结果与讨论 | 第44-48页 |
| ·个鼠疫菌基因分型标志物的分型意义 | 第44页 |
| ·鼠疫菌基因分型系统的建立 | 第44-48页 |
| 参考文献 | 第48-49页 |
| 第四章 中国鼠疫菌基因分型的研究 | 第49-99页 |
| 1.材料与方法 | 第51-53页 |
| 2.结果与讨论 | 第53-96页 |
| ·中国902株鼠疫菌基因分型结果 | 第53-61页 |
| ·鼠疫菌主要基因组型和次要基因组型概念的提出 | 第61-62页 |
| ·帕米尔高原长尾旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第62页 |
| ·天山山地灰旱獭、长尾黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第62-65页 |
| ·青藏高原喜马拉雅旱獭鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第65-70页 |
| ·滇西山地齐氏姬鼠、大绒鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第70-71页 |
| ·滇西山地闽广沿海居民区黄胸鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第71-73页 |
| ·松辽平原达乌尔黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第73-74页 |
| ·内蒙古高原长爪沙鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第74-75页 |
| ·甘宁黄土高原阿拉善黄鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第75-76页 |
| ·锡林郭勒高原布氏田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第76-77页 |
| ·青藏高原青海田鼠鼠疫自然疫源地鼠疫菌基因分型结果 | 第77-79页 |
| ·中国902株鼠疫菌基因分型小结 | 第79-82页 |
| ·鼠疫菌基因分型系统在青海人间鼠疫暴发流行病学调查中的应用 | 第82-83页 |
| ·鼠疫的进化分析 | 第83-96页 |
| 参考文献 | 第96-99页 |
| 综述--鼠疫耶尔森氏菌适应性进化与基因分型的研究进展 | 第99-128页 |
| 与本研究相关的术语 | 第128-131页 |
| 攻读博士学位期间发表的综述和研究论文 | 第131-133页 |
| 致谢 | 第133-134页 |
