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十字花科植物BcMF2和BcMF4同源基因的克隆、表达及其进化关系研究

缩写词第1-13页
摘要第13-15页
Abstract第15-18页
前言第18-20页
1 文献综述第20-42页
   ·植物花粉发育的分子生物学研究进展第20-24页
     ·植物花粉的发育过程第20-21页
     ·花粉发育相关基因的克隆与表达第21-23页
     ·花粉发育的基因工程第23-24页
   ·DNA序列分析在植物系统学研究中的应用第24-31页
     ·进化研究中几个易混淆的概念第25-26页
       ·分子进化与生物进化第25页
       ·基因树和物种树第25-26页
       ·相似性和同源性第26页
     ·植物系统进化研究中常用的基因序列第26-29页
       ·核基因组第26-27页
       ·叶绿体基因组第27-29页
     ·分子进化研究的生物信息学方法第29-31页
       ·基因序列和氨基酸残基序列同源性比对第29页
       ·分子系统树的构建第29-30页
       ·分子进化研究中常用分析软件包第30-31页
   ·十字花科植物系统演化关系的研究第31-34页
   ·植物多聚半乳糖醛酸酶的研究第34-38页
     ·PG的作用方式和组织定位第34页
     ·不同PG基因家族之间序列的差异性第34-35页
     ·PG功能的多样性第35-37页
       ·PG与果实成熟第35-36页
       ·PG与器官脱落第36页
       ·PG与花粉授粉第36-37页
     ·PG基因的表达调控及应用第37-38页
   ·植物多聚半乳糖醛酸酶抑制蛋白的研究第38-42页
     ·PGIP的性质第38页
     ·PGIP的结构及分子特征第38-39页
     ·PGIP基因研究进展第39-42页
2 白菜花粉发育相关基因BcMF2全长序列的克隆及其序列分析第42-56页
   ·材料与方法第43-47页
     ·植物材料与主要试剂第43页
     ·DNA提取第43页
     ·RNA分离及检测第43-44页
     ·cDNA的合成第44-46页
     ·PCR引物设计第46页
     ·PCR扩增及其产物克隆第46-47页
     ·BcMF2基因全长序列的特征分析第47页
   ·结果与分析第47-54页
     ·BcMF2基因DNA全长和cDNA全长的获得第47页
     ·BcMF2基因核苷酸序列分析第47-48页
     ·BcMF2基因编码蛋白的特征分析第48-49页
     ·BcMF2基因编码蛋白二级结构预测及疏水性分析第49-53页
     ·BcMF2与其它植物PG基因的同源比对第53-54页
   ·讨论第54-56页
     ·BcMF2基因全长序列的结构特征分析第54页
     ·BcMF2基因编码蛋白的功能预测第54-56页
3 BcMF2基因在大肠杆菌中的高效表达第56-62页
   ·材料与方法第56-58页
     ·菌株和质粒第56页
     ·工具酶和试剂第56页
     ·BcMF2基因原核表达载体的构建第56-57页
     ·在大肠杆菌BL21中诱导BcMF2基因的高效表达第57页
     ·不同浓度IPTG诱导pET-BcMF2的表达第57页
     ·不同诱导时间下pET-BcMF2的表达第57页
     ·聚丙烯酰胺凝胶电泳检测表达产物第57-58页
   ·结果与分析第58-60页
     ·用于原核表达的目的片段的PCR扩增和克隆第58页
     ·原核表达载体的构建第58页
     ·BcMF2基因在大肠杆菌BL21中的高效表达第58-60页
   ·讨论第60-62页
4 十字花科植物BcMF2基因同源序列的克隆及系统进化分析第62-78页
   ·材料与方法第63-65页
     ·试验材料第63-64页
     ·BcMF2同源基因的克隆和测序第64页
     ·BcMF2同源基因的序列差异分析第64页
     ·十字花科植物系统进化分析第64-65页
   ·结果与分析第65-74页
     ·BcMF2同源序列的扩增和克隆第65-67页
     ·BcMF2同源基因的序列特征分析第67页
     ·BcMF2同源基因的序列比对第67-72页
     ·序列变异和遗传信息指数第72页
     ·十字花科植物BcMF2同源基因序列的遗传距离分析第72页
     ·根据BcMF2基因同源性分析十字花科植物物种进化关系第72-74页
   ·讨论第74-78页
     ·十字花科植物BcMF2同源基因的分子克隆第74-75页
     ·不同物种中BcMF2同源基因的序列差异第75页
     ·系统树构建方法的选择第75页
     ·十字花科植物的系统进化分析第75-78页
5 多聚半乳糖醛酸酶基因家族的比较分析第78-96页
   ·材料与方法第78-80页
   ·结果分析第80-83页
     ·多聚半乳糖醛酸酶保守结构域分析第80-81页
     ·保守的半胱氨酸残基第81页
     ·细菌PG的比较分析第81-82页
     ·真菌PG的比较分析第82-83页
     ·植物内切PG与外切PG第83页
     ·PG系统进化树的构建第83页
   ·讨论第83-96页
     ·PG蛋白保守性分析第83-84页
     ·PG蛋白的系统发育分析第84-96页
6 白菜BcMF4基因的克隆、测序及特征分析第96-108页
   ·材料与方法第96-98页
     ·试验材料第96页
     ·菌株和主要试剂第96-97页
     ·DNA提取和RNA分离第97页
     ·引物设计与合成第97页
     ·BcMF4基因的PCR扩增第97页
     ·PCR产物的克隆和测序第97页
     ·序列特征分析第97-98页
   ·结果与分析第98-105页
     ·BcMF4基因DNA和cDNA全长的分离及克隆第98页
     ·BcMF4基因的测序结果第98-99页
     ·利用Blast软件进行序列相似性分析第99页
     ·BcMF4基因蛋白质序列的基本特征分析第99-103页
     ·编码蛋白功能位点的分析第103页
     ·结构功能域的确定第103-104页
     ·编码蛋白的二级结构预测及亲/疏水性分析第104-105页
   ·讨论第105-108页
     ·BcMF4核苷酸和蛋白质序列基本性质分析第106页
     ·BcMF4蛋白质的功能预测第106-108页
7 十字花科植物BcMF4基因同源序列的克隆及进化分析第108-122页
   ·材料与方法第108-109页
     ·试验材料第108-109页
     ·BcMF4同源基因的克隆和测序第109页
     ·十字花科植物BcMF4同源基因序列的比较分析第109页
     ·不同物种PGIP的分子相关性分析第109页
   ·结果与分析第109-115页
     ·BcMF4同源基因的克隆和测序第109-111页
     ·BcMF4同源基因序列特征的比较分析第111-112页
     ·BcMF4同源基因的序列比对和分析第112-113页
     ·不同物种PGIP的分子相关性分析第113-115页
       ·不同物种PGIP保守的Leu残基第113-114页
       ·保守的Cys残基分析第114-115页
       ·PGIP蛋白保守的结构功能域分析第115页
       ·PGIP分子进化树的构建第115页
   ·讨论第115-122页
     ·十字花科植物BcMF4同源基因的序列特征分析第115-119页
     ·不同物种中PGIP保守性分析第119页
     ·PGIP的系统进化及其在物种进化研究中的可行性分析第119-122页
结论第122-124页
参考文献第124-136页
博士期间发表的论文第136页

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