西伯利亚杏SSR引物开发及燕山群体遗传多样性研究
| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-8页 |
| 目录 | 第8-11页 |
| 1 引言 | 第11-21页 |
| ·西伯利亚杏种质资源 | 第11-12页 |
| ·形态特征及分布 | 第11-12页 |
| ·生态价值及经济价值 | 第12页 |
| ·西伯利亚杏种质资源研究进展 | 第12-15页 |
| ·生物及生理生态特性研究进展 | 第12-13页 |
| ·遗传多样性研究进展 | 第13-14页 |
| ·丰产栽培研究进展 | 第14-15页 |
| ·微卫星标记的开发策略 | 第15-19页 |
| ·基于生物信息学手段开发SSR引物 | 第15页 |
| ·基于实验手段开发SSR引物 | 第15-19页 |
| ·文库法 | 第15页 |
| ·富集法 | 第15-18页 |
| ·省略库法 | 第18页 |
| ·利用比较遗传学从近缘物种中获得SSR引物 | 第18-19页 |
| ·研究的主要内容与技术路线 | 第19-21页 |
| 2 磁珠富集法开发西伯利亚杏基因组微卫星标记 | 第21-45页 |
| ·材料与方法 | 第21-29页 |
| ·试验材料 | 第21-24页 |
| ·植物材料 | 第21页 |
| ·试验仪器 | 第21页 |
| ·试验试剂 | 第21-24页 |
| ·基因组DNA提取试剂 | 第21-23页 |
| ·文库构建试剂 | 第23-24页 |
| ·试验方法 | 第24-29页 |
| ·基因组DNA的提取与检测 | 第24-25页 |
| ·基因组DNA(大量)的提取 | 第24页 |
| ·基因组DNA(微量)的提取 | 第24-25页 |
| ·基因组DNA的检测 | 第25页 |
| ·富集文库的构建 | 第25-27页 |
| ·DNA的酶切、回收 | 第25页 |
| ·酶切产物与接头连接 | 第25-26页 |
| ·微卫星序列的富集 | 第26页 |
| ·微卫星序列的克隆 | 第26-27页 |
| ·阳性克隆筛选 | 第27页 |
| ·阳性克隆测序 | 第27页 |
| ·序列分析 | 第27-28页 |
| ·载体及接头序列的去除 | 第27-28页 |
| ·冗余序列的检测 | 第28页 |
| ·微卫星位点的搜索 | 第28页 |
| ·引物设计 | 第28页 |
| ·引物的有效性检测 | 第28页 |
| ·引物的多态性筛选 | 第28-29页 |
| ·多态性引物的测评 | 第29页 |
| ·结果与分析 | 第29-42页 |
| ·基因组DNA的酶切结果 | 第29页 |
| ·PCR检测接头连接情况 | 第29-30页 |
| ·磁珠富集效果的检测 | 第30页 |
| ·含微卫星位点阳性克隆的筛选 | 第30-31页 |
| ·测序 | 第31-32页 |
| ·序列分析 | 第32-36页 |
| ·载体及接头序列的屏蔽 | 第32页 |
| ·冗余序列的检测 | 第32-35页 |
| ·序列长度分析 | 第35页 |
| ·微卫星位点的筛选 | 第35-36页 |
| ·引物设计 | 第36-37页 |
| ·微卫星引物的有效性和多态性筛选 | 第37-41页 |
| ·多态性引物的测评 | 第41-42页 |
| ·讨论 | 第42-43页 |
| ·西伯利亚杏全基因组DNA的提取 | 第42页 |
| ·磁珠富集法构建微卫星富集文库 | 第42-43页 |
| ·小结 | 第43-45页 |
| 3 燕山西伯利亚杏群体遗传多样性和遗传结构研究 | 第45-55页 |
| ·材料与方法 | 第45-48页 |
| ·试验材料 | 第45页 |
| ·样品采集 | 第45页 |
| ·仪器设备 | 第45页 |
| ·试剂 | 第45页 |
| ·试验方法 | 第45-47页 |
| ·基因组DNA的提取和检测 | 第45-46页 |
| ·SSR引物 | 第46-47页 |
| ·SSR引物的扩增 | 第47页 |
| ·数据分析 | 第47-48页 |
| ·遗传多样性的测定 | 第47页 |
| ·群体遗传分化与遗传结构的测定 | 第47页 |
| ·群体间聚类分析 | 第47-48页 |
| ·结果与分析 | 第48-51页 |
| ·群体遗传多样性 | 第48-49页 |
| ·群体的遗传分化与遗传结构 | 第49-51页 |
| ·讨论 | 第51-53页 |
| ·西伯利亚杏遗传多样性水平 | 第51-52页 |
| ·群体遗传分化 | 第52-53页 |
| ·西伯利亚杏特异种质资源的收集策略 | 第53页 |
| ·小结 | 第53-55页 |
| 4 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-63页 |
| 附录 | 第63-67页 |
| 个人简介 | 第67-69页 |
| 导师简介 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71页 |
