| 摘要 | 第10-12页 |
| ABSTRACT | 第12-13页 |
| 缩略词 | 第14-15页 |
| 第一章 绪论 | 第15-25页 |
| 1.1 海洋微生物多样性的研究进展 | 第15-16页 |
| 1.2 微生物培养的限制因素 | 第16-18页 |
| 1.3 微生物分离培养策略 | 第18-20页 |
| 1.3.1 模拟自然环境的培养方法 | 第18-19页 |
| 1.3.2 富集培养法 | 第19-20页 |
| 1.4 菌休眠及复苏研究现状 | 第20-22页 |
| 1.5 宏转录学技术在微生物组中的应用 | 第22-23页 |
| 1.5.1 宏基因组学 | 第22页 |
| 1.5.2 宏转录组学 | 第22-23页 |
| 1.6 立项依据 | 第23-25页 |
| 第二章 宏转录组分析富集过程中微生物的活跃程度 | 第25-52页 |
| 2.1 实验材料 | 第25-26页 |
| 2.1.1 实验对象 | 第25页 |
| 2.1.2 培养基与溶液 | 第25-26页 |
| 2.1.3 主要试剂 | 第26页 |
| 2.1.4 主要仪器 | 第26页 |
| 2.2 实验方法 | 第26-34页 |
| 2.2.1 样品的富集培养 | 第26页 |
| 2.2.2 细菌的分离及宏转录组样品的准备 | 第26页 |
| 2.2.3 细菌16S rRNA基因的扩增与鉴定 | 第26-27页 |
| 2.2.4 菌种保藏 | 第27-28页 |
| 2.2.5 宏转录组测序实验流程 | 第28-31页 |
| 2.2.6 生物信息学分析 | 第31-34页 |
| 2.3 实验结果 | 第34-50页 |
| 2.3.1 数据质量的控制 | 第34-35页 |
| 2.3.2 宏转录组测序中物种组成分析 | 第35-37页 |
| 2.3.3 样品微生物群落结构比较分析 | 第37-43页 |
| 2.3.4 富集过程中微生物基因表达模块分析 | 第43-45页 |
| 2.3.5 富集培养过程中关键基因应答分析 | 第45-48页 |
| 2.3.6 富集培养过程中关键类群应答情况 | 第48-50页 |
| 2.4 本章小结 | 第50-52页 |
| 第三章 一株海洋滑动菌VBNC的诱导及复苏 | 第52-62页 |
| 3.1 实验材料 | 第52-53页 |
| 3.1.1 样品和菌株 | 第52页 |
| 3.1.2 培养基 | 第52-53页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第53页 |
| 3.1.4 实验仪器 | 第53页 |
| 3.2 实验方法 | 第53-55页 |
| 3.2.1 鲑色海洋滑动菌VBNC状态的诱导方法 | 第53页 |
| 3.2.2 死活细胞染色方法 | 第53-54页 |
| 3.2.3 鲑色海洋滑动菌的稀释涂布及VBNC状态的判定方法 | 第54页 |
| 3.2.4 鲑色海洋滑动菌的休眠状态的复苏实验 | 第54-55页 |
| 3.3 实验结果与分析 | 第55-61页 |
| 3.3.1 鲑色海洋滑动菌的休眠状态的诱导 | 第55-56页 |
| 3.3.2 鲑色海洋滑动菌的休眠状态的复苏实验 | 第56-61页 |
| 3.4 本章小结 | 第61-62页 |
| 第四章 三株新菌的多相分类 | 第62-83页 |
| 4.1 实验材料 | 第62-63页 |
| 4.1.1 样品和菌株 | 第62-63页 |
| 4.1.2 培养基 | 第63页 |
| 4.1.3 实验试剂 | 第63页 |
| 4.1.4 实验仪器 | 第63页 |
| 4.2 实验方法 | 第63-69页 |
| 4.2.1 菌株的表型特征 | 第63页 |
| 4.2.2 生理生化特征的测定 | 第63-65页 |
| 4.2.3 基于遗传学的鉴定 | 第65-67页 |
| 4.2.4 化学组分测定 | 第67-69页 |
| 4.3 实验结果与分析 | 第69-82页 |
| 4.3.1 海螺菌(Marinospirillum perlucida)F3212~T的多相分类鉴定 | 第69-74页 |
| 4.3.2 水生水弯曲菌(Aquiflexum aquatile)Z0201~T的多相分类鉴定 | 第74-78页 |
| 4.3.3 玫瑰单孢菌(Roseomonas bellus)CQN31~T的多相分类鉴定 | 第78-82页 |
| 4.4 本章小结 | 第82-83页 |
| 全文总结与展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-95页 |
| 附录 | 第95-97页 |
| 致谢 | 第97-99页 |
| 资助情况 | 第99-100页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第100-101页 |
| 学位论文评阅及答辩情况表 | 第101页 |
