基于氨基酸使用偏好及基因功能信息预测疾病相关基因
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-8页 |
1 绪论 | 第8-18页 |
·课题来源 | 第8页 |
·研究背景、目的、意义 | 第8-9页 |
·国内外研究现状 | 第9-17页 |
·主要研究工作 | 第17-18页 |
2 基于序列特征的疾病基因预测 | 第18-32页 |
·研究数据的获取 | 第18-20页 |
·疾病基因数据 | 第18-19页 |
·对照数据 | 第19-20页 |
·测试数据 | 第20页 |
·氨基酸使用特征 | 第20-26页 |
·氨基酸使用特征的计算方法 | 第20-22页 |
·疾病特异氨基酸使用特征 | 第22-26页 |
·基于氨基酸使用特征预测疾病基因 | 第26-30页 |
·疾病基因预测方法 | 第26-27页 |
·预测精度及其与同类方法的比较 | 第27-30页 |
·结果讨论 | 第30页 |
·本章小结 | 第30-32页 |
3 基于基因产物功能信息的疾病基因预测 | 第32-47页 |
·基因功能与疾病关联及相关性评价方法 | 第32页 |
·基于GO 间最短路径的的疾病基因预测 | 第32-41页 |
·基因功能与疾病的相关度 | 第33-35页 |
·预测框架 | 第35-36页 |
·预测精度及其与同类软件的比较 | 第36-40页 |
·讨论与结论 | 第40-41页 |
·在癌基因预测中的应用 | 第41-46页 |
·癌基因功能特点 | 第42-44页 |
·利用CDGMiner 预测 | 第44-45页 |
·同类工具的比较 | 第45-46页 |
·本章小结 | 第46-47页 |
4 总结与展望 | 第47-52页 |
·总结 | 第47-48页 |
·展望 | 第48-52页 |
致谢 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-58页 |
附录攻读学位期间发表论文目录 | 第58页 |