基于极光激酶的药物设计及化合物酸碱解离常数的预测
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-28页 |
| ·计算机辅助药物设计 | 第12-13页 |
| ·计算机辅助药物设计方法 | 第13-16页 |
| ·分子对接 | 第13-14页 |
| ·药效团模型方法 | 第14-15页 |
| ·数据库搜索和虚拟筛选 | 第15-16页 |
| ·定量构效关系 | 第16-23页 |
| ·QSAR参数 | 第17-18页 |
| ·活性参数 | 第17页 |
| ·结构参数 | 第17-18页 |
| ·二维定量构效关系 | 第18-21页 |
| ·常见构建2D-QSAR模型的统计方法 | 第18-21页 |
| ·三维定量构效关系 | 第21-22页 |
| ·Lipinski五规则 | 第22-23页 |
| ·极光激酶及其抑制剂 | 第23-26页 |
| ·激酶和激酶抑制剂 | 第23-24页 |
| ·极光激酶家族 | 第24-25页 |
| ·基于极光激酶A的药物设计 | 第25-26页 |
| ·酸碱解离常数预测 | 第26-27页 |
| ·本课题主要研究工作 | 第27-28页 |
| 第二章 极光激酶A与B的相似性和差异性比较研究 | 第28-36页 |
| ·背景介绍 | 第28页 |
| ·实验数据 | 第28页 |
| ·结果与讨论 | 第28-35页 |
| ·序列和二级结构比对 | 第28-29页 |
| ·三维空间结构比对 | 第29-30页 |
| ·CRMS计算 | 第30-31页 |
| ·聚类分析 | 第31-33页 |
| ·ATP活性口袋分析 | 第33-35页 |
| ·本章小结 | 第35-36页 |
| 第三章 基于Aurora-2的抑制剂设计 | 第36-48页 |
| ·极光激酶抑制剂 | 第36-40页 |
| ·VX-680 | 第36页 |
| ·PHA-680632 | 第36-37页 |
| ·极光激酶A和其抑制剂的相互作用特点分析 | 第37-40页 |
| ·极光激酶A抑制剂的类似物设计 | 第40-41页 |
| ·常见抑制剂拆分 | 第41-42页 |
| ·新的小分子设计路线 | 第42-45页 |
| ·初步结果 | 第45-46页 |
| ·合成难度分析 | 第46-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第四章 化合物的pKa预测 | 第48-56页 |
| ·pKa数据来源和结构参数来源 | 第48-51页 |
| ·结构描述符的计算与选择 | 第51-53页 |
| ·结果与讨论 | 第53-55页 |
| ·多元线性回归建模(MLR) | 第53-54页 |
| ·支持向量机(SVM) | 第54-55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第五章 结论 | 第56-57页 |
| ·全文总结 | 第56页 |
| ·建议 | 第56-57页 |
| 参考文献 | 第57-61页 |
| 附录 | 第61-63页 |
| 致谢 | 第63-64页 |
| 研究成果及发表的学术论文 | 第64-65页 |
| 作者与导师简介 | 第65-66页 |
| 北京化工大学硕士研究生学位论文答辩委员会决议书 | 第66-67页 |
