| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-34页 |
| 1 盐环境多样性 | 第12-14页 |
| 2 盐环境中的微生物多样性 | 第14-18页 |
| 3. 微生物多样性研究方法 | 第18-24页 |
| ·纯培养法(culture methods) | 第19-22页 |
| ·非培养分析法(culture-independent method) | 第22-24页 |
| 4 细菌分类学及多相分类学 | 第24-32页 |
| ·细菌分类学 | 第25-26页 |
| ·多相分类学 | 第26页 |
| ·多相分类学研究方法 | 第26-31页 |
| ·多相分类学未来发展 | 第31-32页 |
| 5 盐环境微生物研究目的和意义 | 第32-34页 |
| 第二章 盐环境微生物资源收集和种群结构研究 | 第34-56页 |
| 1 材料和方法 | 第34-37页 |
| ·样品的采集 | 第34页 |
| ·菌株的分离和培养 | 第34-36页 |
| ·耐盐性实验 | 第36页 |
| ·硝酸盐、亚硝酸盐还原实验 | 第36页 |
| ·分离纯化菌株的分子鉴定 | 第36页 |
| ·东海长江口细菌多样性分析 | 第36页 |
| ·M4-5多管上覆水样品总DNA提取和16S rRNA基因扩增 | 第36页 |
| ·硝酸盐还原基因napA、亚硝酸盐还原相关基因nirS扩增 | 第36-37页 |
| ·重组子筛选及测序 | 第37页 |
| 2 结果与讨论 | 第37-54页 |
| ·东海长江口细菌的分离及分子鉴定 | 第37-42页 |
| ·M4-5多管上腹水总DNA的提取及16S rRNA基因、硝酸盐还原基因napA和亚硝酸盐相关基因nirS扩增 | 第42-43页 |
| ·非培养16S rDNA序列比对分析 | 第43-48页 |
| ·东海长江口细菌多样性分析 | 第48-49页 |
| ·东海长江口硝酸盐还原相关基因多样性分析 | 第49-53页 |
| ·东海长江口亚硝酸盐还原相关基因多样性分析 | 第53-54页 |
| 3 讨论 | 第54-56页 |
| 第三章 新疆地区盐湖和盐矿中度嗜盐菌多相分类研究 | 第56-72页 |
| 1 材料与方法 | 第57-60页 |
| ·样品的采集及其环境 | 第57-58页 |
| ·菌株分离与培养条件 | 第58-59页 |
| ·多相分类菌株和参比菌株 | 第59页 |
| ·表型特征分析 | 第59页 |
| ·化学分类特征脂肪酸分析 | 第59页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第59页 |
| ·基于细菌16S rRNA基因序列系统发育学分析 | 第59-60页 |
| ·基因组DNA G+C mol%含量分析 | 第60页 |
| ·与相近种间的DNA-DNA同源性分析 | 第60页 |
| 2 结果与讨论 | 第60-72页 |
| ·细菌的表型特征 | 第60-65页 |
| ·化学分类特征脂肪酸分析 | 第65-66页 |
| ·基于16S RNA基因系统发育分析 | 第66-69页 |
| ·基因组的DNA G+C含量 | 第69页 |
| ·与相近种的DNA-DNA同源性 | 第69页 |
| ·讨论 | 第69-72页 |
| 第四章 深海多金属结核区耐盐菌多相分类研究 | 第72-94页 |
| 1 材料与方法 | 第73-76页 |
| ·样品的采集 | 第73页 |
| ·菌株分离与培养条件 | 第73-74页 |
| ·多相分类菌株和参比菌株 | 第74页 |
| ·表型特征分析 | 第74-75页 |
| ·脂肪酸成分分析 | 第75页 |
| ·呼吸醌类型分析 | 第75页 |
| ·极性脂组分分析 | 第75页 |
| ·细胞壁分析 | 第75页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第75页 |
| ·基于细菌16S rRNA基因序列系统发育学分析 | 第75-76页 |
| ·基因组DNA G+C mol%含量分析 | 第76页 |
| ·与相近种间的DNA-DNA同源性分析 | 第76页 |
| 2 结果与讨论 | 第76-94页 |
| ·细菌的表型特征 | 第76-82页 |
| ·脂肪酸成分分析 | 第82-83页 |
| ·呼吸醌类型分析 | 第83页 |
| ·极性脂组分分析 | 第83-85页 |
| ·细胞壁组分分析 | 第85-86页 |
| ·基于16S RNA基因系统发育分析 | 第86-89页 |
| ·基因组的DNA G+C含量 | 第89页 |
| ·与相近种的DNA-DNA同源性 | 第89页 |
| ·讨论 | 第89-94页 |
| 第五章 近海中度嗜盐菌多相分类研究 | 第94-122页 |
| 1 材料与方法 | 第95-98页 |
| ·样品的采集及其环境 | 第95页 |
| ·菌株分离与培养条件 | 第95-96页 |
| ·多相分类菌株和参比菌株 | 第96-97页 |
| ·表型特征分析 | 第97-98页 |
| ·脂肪酸成分分析 | 第98页 |
| ·呼吸醌类型分析 | 第98页 |
| ·细菌基因组DNA的提取 | 第98页 |
| ·基于细菌16S rRNA基因序列系统发育学分析 | 第98页 |
| ·基因组DNA G+C mol%含量分析 | 第98页 |
| ·与相近种间的DNA-DNA同源性分析 | 第98页 |
| 2 结果与讨论 | 第98-122页 |
| ·细菌的表型特征 | 第98-104页 |
| ·脂肪酸成分分析 | 第104-107页 |
| ·呼吸醌类型分析 | 第107-108页 |
| ·基于16S RNA基因系统发育分析 | 第108-112页 |
| ·基因组的DNA G+C含量 | 第112-113页 |
| ·与相近种的DNA-DNA同源性 | 第113页 |
| ·讨论 | 第113-122页 |
| 参考文献 | 第122-142页 |
| 细菌鉴定操作手册 | 第142-170页 |
| 主要成果 | 第170-172页 |
| 致谢 | 第172页 |
