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基于内含子剪切的人工miRNA结构和靶向位点与基因沉默效率的关系研究

摘要第1-7页
Abstract第7-12页
引言第12-14页
第一章 RNA干扰以及人工miRNA第14-25页
   ·RNA干扰第14-21页
     ·RNA干扰的发现第14-15页
     ·RNA干扰的机制第15-20页
     ·RNA干扰在病毒性疾病治疗中的应用第20-21页
   ·人工 miRNA(artificial microRNA,amiRNA)第21-25页
第二章 H5N1型禽流感病毒简介以及针对H5N1型禽流感病毒的RNA干扰第25-39页
   ·H5N1型禽流感病毒简介第25-37页
     ·禽流感病毒及其致病性第25-27页
     ·A型流感病毒的形态和结构第27-28页
     ·A型流感病毒基因及其蛋白产物第28-34页
     ·A型流感病毒的感染过程第34-37页
   ·针对H5N1型禽流感病毒基因的RNA干扰第37-38页
   ·本研究目的与意义第38-39页
第三章 以外源基因的5'-UTR,3'-UTR以及ORF为靶点设计的不同人工miRNA所产生的基因沉默效应的研究第39-73页
   ·引言第39-40页
   ·实验材料第40-42页
     ·实验仪器第40-41页
     ·实验用耗材,化学药品试剂第41页
     ·工具酶、试剂盒第41-42页
     ·菌种、载体、细胞第42页
   ·实验方法第42-62页
     ·常规实验方法第42-50页
     ·基于miR155的人工miRNA表达载体的构建第50-53页
     ·报告基因Luc以及Luc-PB2(包括3'-UTR)表达载体的构建第53-54页
     ·精选SM155-miRNA靶向基因PB23'-UTR和Luc ORF靶序列以及设计人工miRNA茎环状结构第54-56页
     ·构建报告基因表达载体pcDNA3.0/5'-UTR(NP)-Luc-3'-UTR(NP)以及精选SM155-miRNA靶向Luc ORF(包括NP 5'-UTR、3’-UTR)靶序列第56-58页
     ·多个串联miRNA表达载体的构建第58-59页
     ·不同配对方式靶向NP(3'-UTR)的人工SM155-miRNA设计第59-60页
     ·293T细胞培养和转染第60页
     ·Real-time RT-PCR第60-61页
     ·荧光素酶实验第61-62页
   ·研究结果第62-69页
     ·基于miR155的人工miRNA表达载体的基因沉默效果以及在293T细胞中报告基因的表达第62-63页
     ·针对外源基因5'-UTR,3’-UTR及ORF人工SM155-miRNA的基因沉默效果第63-64页
     ·不同茎结构的人工SM155-miRNA对荧光素酶基因ORF沉默效率的影响第64-65页
     ·不同茎结构的人工SM155-miRNA对PB2基因3’-UTR沉默效率的影响第65-66页
     ·不同茎结构的人工SM155-miRNA诱导干扰素的表达水平第66-68页
     ·Seed-match对人工SM155-miRNA靶向NP基因3’-UTR沉默效率的影响第68-69页
   ·讨论第69-73页
第四章 人工SM155-miRNA对AIV基因沉默效果第73-88页
   ·引言第73-74页
   ·实验材料第74-75页
   ·实验方法第75-80页
     ·Luc-PB2以及Luc-NP(包括5’-UTR和3’-UTR)表达载体的构建第75-76页
     ·精选对禽流感基因PB2和NP的靶序列以及设计人工miRNA茎环状结构第76-78页
     ·293T细胞培养和转染第78页
     ·Real-time RT-PCR第78-79页
     ·荧光素酶实验第79-80页
   ·研究结果第80-85页
     ·单个或多个串联人工SM155-miRNA针对PB2基因5'-UTR、ORF及3'-UTR沉默的效率第80-82页
     ·单个或多个串联人工SM155-miRNA对NP基因5'-UTR、ORF、3' -UTR的沉默效率第82-85页
   ·讨论第85-88页
研究总结与创新点第88-90页
参考文献第90-107页
博士期间发表论文第107-108页
致谢第108页

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