| 中文摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-13页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章 内生真菌及兰科植物内生真菌研究概述 | 第14-30页 |
| ·内生真菌的概念及研究历史 | 第14-17页 |
| ·内生真菌多样性与生态功能 | 第17-21页 |
| ·麦角类系统内生真菌 | 第17-18页 |
| ·非麦角类系统内生真菌 | 第18-21页 |
| ·兰科植物菌根菌和非菌根内生真菌研究概况 | 第21-23页 |
| ·内生真菌的研究方法 | 第23-27页 |
| ·传统的植物组织块培养分离及鉴定方法 | 第23-24页 |
| ·形态学分类与系统演化关系 | 第24-25页 |
| ·分子系统学与分子系统发育分析 | 第25-26页 |
| ·分子生物学技术的应用 | 第26-27页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第27-30页 |
| 第二章 白及内生真菌的形态学分类鉴定 | 第30-78页 |
| ·前言 | 第30-31页 |
| ·材料与方法 | 第31-33页 |
| ·实验材料的采集 | 第31页 |
| ·内生真菌的分离与培养 | 第31-32页 |
| ·内生真菌的鉴定 | 第32-33页 |
| ·结果与分析 | 第33-78页 |
| ·顶孢霉属Acremonium Link ex Fr. | 第33-35页 |
| ·链格孢属Alternaria Nees ex Fr. | 第35-36页 |
| ·节菱孢属Arthrinium Kunze ex Fr. | 第36-37页 |
| ·角菌根菌属Ceratorhiza Moore | 第37-39页 |
| ·刺盘孢属Colletotrichum Corda | 第39-45页 |
| ·柱孢属Cylindrocarpon Wollenw. | 第45-48页 |
| ·瘤菌根菌属Epulorhiza Moore | 第48-57页 |
| ·镰刀菌属Fusarium Link ex Fr. | 第57-61页 |
| ·黑团孢属Periconia Tode | 第61-63页 |
| ·齿梗孢属Scolecobasidium Abbott | 第63-65页 |
| ·蜡壳菌属Sebacina Tul. | 第65-73页 |
| ·轮枝孢属Verticillium Nees ex Link | 第73-74页 |
| ·Tulasnellaceae sp.1 | 第74-76页 |
| ·Tulasnellaceae sp.2 | 第76页 |
| ·其他分类单元 | 第76-78页 |
| 第三章 白及内生真菌形态型菌株的分子鉴定 | 第78-100页 |
| ·前言 | 第78-79页 |
| ·材料与方法 | 第79-82页 |
| ·形态型菌株的来源 | 第79-80页 |
| ·形态型菌株的基因组DNA的提取 | 第80-81页 |
| ·形态型菌株的ITS的PCR扩增、检测和测序 | 第81-82页 |
| ·形态型菌株的ITS序列分析及系统发育树的构建 | 第82页 |
| ·结果与分析 | 第82-100页 |
| ·形态型菌株基于5.8S基因的系统发育分析 | 第82-83页 |
| ·担子菌起源的2个形态型菌株 | 第83-86页 |
| ·Apiosporaceae起源的2个形态型菌株 | 第86-87页 |
| ·Botryosphaeriaceae起源的3个形态型菌株 | 第87-89页 |
| ·Chaetomiaceae起源的1个形态型菌株 | 第89页 |
| ·Lasiosphaeriaceae起源的2个形态型菌株 | 第89-90页 |
| ·Microascaceae起源的2个形态型菌株 | 第90-92页 |
| ·Mycosphaerellaceae起源的6个形态型菌株 | 第92-93页 |
| ·Pezizaceae起源的1个形态型菌株 | 第93-94页 |
| ·Phyllachoraceae起源的5个形态型菌株 | 第94-95页 |
| ·Valsaceae起源的7个形态型菌株 | 第95页 |
| ·Xylariaceae起源的3个形态型菌株 | 第95页 |
| ·Hypocreales起源的1个形态型菌株 | 第95-96页 |
| ·Leotiomycetes起源的1个形态型菌株 | 第96-98页 |
| ·Pleosporales起源的2个形态型菌株 | 第98-100页 |
| 第四章 白及根和叶组织内生真菌的分子检测与鉴定 | 第100-134页 |
| ·前言 | 第100-102页 |
| ·材料与方法 | 第102-110页 |
| ·样品采集与处理 | 第102页 |
| ·样品总基因组DNA的提取 | 第102-103页 |
| ·真菌ITS序列的扩增和克隆 | 第103-104页 |
| ·真菌ITS序列的GC-clamp扩增 | 第104-105页 |
| ·真菌ITS序列的DGGE分析和序列测定 | 第105-107页 |
| ·基于ITS序列的系统发育分析 | 第107-109页 |
| ·真菌类群的多样性分析 | 第109-110页 |
| ·结果与分析 | 第110-128页 |
| ·PCR扩增和ITS克隆 | 第110-111页 |
| ·DGGE分析 | 第111-112页 |
| ·叶片组织内生真菌的ITS序列分析和系统发育分析 | 第112-122页 |
| ·基于5.8S基因的系统发育分析 | 第112-114页 |
| ·基于ITS区序列的系统发育分析 | 第114-122页 |
| ·根组织内生真菌的ITS序列分析和系统发育分析 | 第122-126页 |
| ·基于5.8S基因的系统发育分析 | 第122页 |
| ·基于ITS区序列的系统发育分析 | 第122-126页 |
| ·真菌的类群组成和真菌多样性 | 第126-128页 |
| ·讨论 | 第128-134页 |
| ·相关研究真菌类群的比较 | 第128-129页 |
| ·兰科植物内生真菌类群的专一性和多样性 | 第129-130页 |
| ·兰科植物叶和根组织内生真菌多样性 | 第130页 |
| ·内生真菌研究方法的比较 | 第130-134页 |
| 第五章 白及内生真菌多样性与生态分析 | 第134-152页 |
| ·前言 | 第134-135页 |
| ·材料与方法 | 第135-137页 |
| ·实验材料的采集 | 第135页 |
| ·内生真菌的分离与培养 | 第135页 |
| ·内生真菌的鉴定 | 第135页 |
| ·数据分析方法 | 第135-137页 |
| ·内生真菌多样性分析 | 第135-136页 |
| ·主成分分析 | 第136-137页 |
| ·结果与分析 | 第137-148页 |
| ·内生真菌的种类组成与分布 | 第137-143页 |
| ·根组织内生真菌的种类组成与分布 | 第137-139页 |
| ·叶组织内生真菌的种类组成与分布 | 第139-143页 |
| ·内生真菌类群的多样性 | 第143-145页 |
| ·内生真菌类群的主成分分析及与地理环境因素相关分析 | 第145-148页 |
| ·内生真菌类群的主成分分析 | 第145-147页 |
| ·内生真菌类群与地理环境因素相关分析 | 第147-148页 |
| ·讨论 | 第148-152页 |
| ·地理环境对兰科植物内生真菌类群丰度和分布的影响 | 第148-149页 |
| ·地理环境对兰科物内生真菌类群组成及多样性影响 | 第149-152页 |
| ·地理环境对兰科物内生真菌类群组成的影响 | 第149-151页 |
| ·地理环境对兰科物内生真菌类群多样性的影响 | 第151-152页 |
| 结论 | 第152-154页 |
| 参考文献 | 第154-177页 |
| 在读博士期间发表文章目录 | 第177-178页 |
| 致谢 | 第178页 |
