| 中文摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-12页 |
| 第一章 磷酸化蛋白质组学技术研究进展及应用 | 第12-34页 |
| ·磷酸化蛋白质组学的概念及内容 | 第13-14页 |
| ·磷酸化蛋白质组学样品制备技术 | 第14-15页 |
| ·磷酸化蛋白质组学富集分离技术 | 第15-23页 |
| ·磷酸化蛋白分离富集方法 | 第15-17页 |
| ·磷酸化肽段的分离富集方法 | 第17-23页 |
| ·磷酸肽识别及磷酸化位点鉴定技术 | 第23-29页 |
| ·[~(32)p]放射性标记 | 第24页 |
| ·生物质谱技术 | 第24-29页 |
| ·磷酸化蛋白质组学的生物信息学技术和计算机技术 | 第29-32页 |
| ·磷酸化蛋白质组学研究总结与展望 | 第32-34页 |
| 第二章 一种新的化学标记方法结合生物质谱分析蛋白质磷酸化修饰 | 第34-59页 |
| ·前言 | 第34-38页 |
| ·材料与方法 | 第38-43页 |
| ·材料 | 第38页 |
| ·4—甲基哌嗪乙酰乙二胺盐酸盐的合成 | 第38-39页 |
| ·标准磷酸化肽的化学修饰 | 第39-40页 |
| ·标准蛋白的溶液酶解 | 第40-41页 |
| ·液相酶解肽段的化学修饰 | 第41页 |
| ·生物质谱分析 | 第41-42页 |
| ·蛋白质的数据库搜寻鉴定 | 第42-43页 |
| ·结果 | 第43-55页 |
| ·化学标记试剂的合成 | 第43-45页 |
| ·化学标记结合生物质谱分析蛋白质磷酸化方法的建立 | 第45-52页 |
| ·化学标记结合生物质谱分析蛋白质磷酸化方法的特异性 | 第52-54页 |
| ·化学标记结合生物质谱分析蛋白质磷酸化方法的灵敏度 | 第54-55页 |
| ·讨论 | 第55-58页 |
| ·酯化反应对标记反应的影响 | 第55-56页 |
| ·数据库搜寻和磷酸化位点确定 | 第56-58页 |
| ·小结 | 第58-59页 |
| 第三章 磷酸化蛋白质数据分析平台的建立 | 第59-75页 |
| ·前言 | 第59-61页 |
| ·材料与方法 | 第61-64页 |
| ·材料 | 第61页 |
| ·标准蛋白混合物的酶解 | 第61页 |
| ·C17.2神经干细胞的培养 | 第61页 |
| ·细胞裂解和全蛋白的提取 | 第61-62页 |
| ·SDS-PAGE与胶内酶解 | 第62-63页 |
| ·生物质谱分析 | 第63页 |
| ·蛋白质的数据库搜寻 | 第63-64页 |
| ·磷酸化位点定位程序P_score编写及应用 | 第64页 |
| ·结果 | 第64-73页 |
| ·最大漏切位点数(missed cleavage)的选择对鉴定结果的影响及确定 | 第64-66页 |
| ·肽段质量容忍误差(Mr tolerance)的选择对鉴定结果的影响及确定 | 第66-68页 |
| ·优化的肽段质量容忍误差及漏切位点提高鉴定结果的准确性和可靠性 | 第68-69页 |
| ·碎片离子质量容忍误差(Mr tolerance)的选择对鉴定结果的影响及确定 | 第69-70页 |
| ·磷酸化位点定位程序P_score编写及应用 | 第70-73页 |
| ·讨论 | 第73-74页 |
| ·小结 | 第74-75页 |
| 第四章 基于化学标记和生物质谱鉴定策略分析小鼠C17.2神经干细胞磷酸化蛋白质组学 | 第75-102页 |
| ·前言 | 第75-76页 |
| ·材料与方法 | 第76-80页 |
| ·材料 | 第76-77页 |
| ·C17.2神经干细胞的培养 | 第77页 |
| ·细胞裂解和全蛋白的提取 | 第77页 |
| ·还原烷基化 | 第77页 |
| ·溶液酶解 | 第77页 |
| ·肽段脱盐 | 第77-78页 |
| ·阳离子交换色谱 | 第78页 |
| ·肽段脱盐 | 第78页 |
| ·甲酯化及其标记 | 第78-79页 |
| ·肽段脱盐 | 第79页 |
| ·酶解肽段的质谱分析 | 第79-80页 |
| ·数据处理和生物信息学分析 | 第80页 |
| ·结果 | 第80-98页 |
| ·化学标记与生物质谱分析方法对C17.2神经干细胞大规模磷酸化鉴定 | 第80-88页 |
| ·磷酸化肽串联质谱分析与磷酸化位点确定 | 第88-91页 |
| ·新鉴定的磷酸化蛋白及分析 | 第91-95页 |
| ·磷酸化模式分析 | 第95-96页 |
| ·磷酸化蛋白质的功能分析 | 第96-98页 |
| ·讨论 | 第98-101页 |
| ·小结 | 第101-102页 |
| 第五章 主要研究结果与进一步研究设想 | 第102-106页 |
| ·主要研究结论 | 第102-103页 |
| ·进一步研究设想 | 第103-106页 |
| 参考文献 | 第106-116页 |
| 缩写表 | 第116-119页 |
| 附表1 | 第119-129页 |
| 附表2 | 第129-137页 |
| 论文发表情况 | 第137-138页 |
| 参加学术会议情况 | 第138-139页 |
| 基金项目资助 | 第139-140页 |
| 致谢 | 第140-141页 |
