| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 符号说明 | 第9-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-32页 |
| 1.1 TNFR超级家族 | 第14-18页 |
| 1.1.1 TNFR超级家族的分类 | 第14-15页 |
| 1.1.2 死亡受体家族的信号通路调控 | 第15-18页 |
| 1.2 死亡结构域(DD) | 第18-26页 |
| 1.2.1 DD超级家族的分类 | 第18页 |
| 1.2.2 DD超级家族的结构特征 | 第18-19页 |
| 1.2.3 DD超级家族的同型相互作用及信号传递 | 第19-26页 |
| 1.3 DR3概述 | 第26-32页 |
| 1.3.1 DR3信号通路的分子机制 | 第26-28页 |
| 1.3.2 DR3在免疫细胞中的作用 | 第28-29页 |
| 1.3.3 DR3在疾病中的作用 | 第29-32页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第32-44页 |
| 2.1 实验材料 | 第32-36页 |
| 2.1.1 细胞/细菌/酵母菌系 | 第32页 |
| 2.1.2 质粒 | 第32-33页 |
| 2.1.3 分子克隆相关试剂 | 第33-34页 |
| 2.1.4 蛋白纯化试剂及纯化柱 | 第34页 |
| 2.1.5 SDS-PAGE及western blotting相关试剂 | 第34-35页 |
| 2.1.6 酵母选择性培养基及酵母双杂交相关试剂 | 第35-36页 |
| 2.1.7 晶体筛选试剂盒及晶体防冻液配制 | 第36页 |
| 2.1.8 细胞转染相关试剂 | 第36页 |
| 2.2 实验仪器 | 第36-37页 |
| 2.3 实验方法 | 第37-44页 |
| 2.3.1 分子克隆 | 第37-38页 |
| 2.3.2 蛋白纯化 | 第38页 |
| 2.3.3 晶体筛选—悬滴法 | 第38页 |
| 2.3.4 X射线小角散射(SAXS) | 第38-39页 |
| 2.3.5 酵母双杂交 | 第39页 |
| 2.3.6 哺乳动物双杂交 | 第39-40页 |
| 2.3.7 荧光素酶报告基因检测 | 第40页 |
| 2.3.8 蛋白质交联(Cross-linking) | 第40页 |
| 2.3.9 Pull-down assay | 第40-41页 |
| 2.3.10 Western blot | 第41页 |
| 2.3.11 荧光偏振(FP) | 第41页 |
| 2.3.12 圆二色谱 | 第41页 |
| 2.3.13 质谱分析 | 第41-42页 |
| 2.3.14 统计学分析 | 第42-44页 |
| 第三章 实验结果及讨论 | 第44-122页 |
| 3.1 引言—科学问题 | 第44页 |
| 3.2 DR3 DD晶体结构 | 第44-80页 |
| 3.2.1 DR3 DD的蛋白纯化及晶体筛选 | 第44-47页 |
| 3.2.2 MBP-DR3 DD的晶体衍射数据的收集和处理 | 第47-52页 |
| 3.2.3 MBP-DR3 DD晶体结构的结构解析和模型优化 | 第52-54页 |
| 3.2.4 MBP-DR3 DD晶体结构的模型质量 | 第54-77页 |
| 3.2.5 DR3 DD的整体结构 | 第77-80页 |
| 3.3 人源与鼠源DR3 DD的氨基酸序列的差异不影响其结构 | 第80-90页 |
| 3.3.1 人源与鼠源DR3 DD氨基酸序列具有高度相似性 | 第80页 |
| 3.3.2 人源和鼠源DR3 DD晶体结构的差异不依赖与氨基酸序列的不同 | 第80-83页 |
| 3.3.3 溶液中hDR3 DD具有与mDR3 DD相似的构象 | 第83-86页 |
| 3.3.4 人源和鼠源MBP-DR3 DD的linker差异讨论 | 第86-90页 |
| 3.4 人源与鼠源DR3 DD的氨基酸序列的差异不影响其功能 | 第90-94页 |
| 3.4.1 氨基酸序列的差异不影响DR3 DD自我相互作用 | 第90-92页 |
| 3.4.2 氨基酸序列的差异不影响DR3的信号传递 | 第92-94页 |
| 3.5 DR3 DD的相互作用依赖于开放式构象 | 第94-100页 |
| 3.6 开放式构象对于DR3信号转导至关重要 | 第100-106页 |
| 3.7 DR3通过TRADD的β发卡花样介导信号传递 | 第106-113页 |
| 3.8 讨论 | 第113-122页 |
| 3.8.1 DD家族中其他成员构象变化案例 | 第113-114页 |
| 3.8.2 MBP标签蛋白对晶体堆积的影响 | 第114-117页 |
| 3.8.3 DR3信号传递模型 | 第117-122页 |
| 参考文献 | 第122-136页 |
| 附录 MBP Kit试剂盒 | 第136-138页 |
| 致谢 | 第138-140页 |
| 攻读博士学位期间所取得的主要研究成果 | 第140页 |
