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几种颚口线虫线粒体基因组序列测定及系统发育研究

致谢第4-6页
摘要第6-8页
Abstract第8-9页
缩写和符号清单第14-16页
文献综述第16-22页
引言第22-23页
1 材料与方法第23-37页
    1.1 材料第23-26页
        1.1.1 样品来源第23页
        1.1.2 主要仪器设备第23-24页
        1.1.3 试剂和酶第24页
        1.1.4 溶液配制第24-25页
        1.1.5 培养基配制第25页
        1.1.6 相关生物信息学软件及在线网址第25-26页
    1.2 实验方法第26-33页
        1.2.1 虫体总DNA提取第26页
        1.2.2 引物设计与合成第26-29页
        1.2.3 线粒体全基因组DNA的PCR扩增第29-31页
        1.2.4 PCR 产物的回收与纯化第31-32页
        1.2.5 PCR 纯化产物的连接第32页
        1.2.6 重组质粒的转化及鉴定第32-33页
        1.2.7 序列测定第33页
    1.3 数据处理和分析第33-37页
        1.3.1 序列数据处理与拼接第33页
        1.3.2 线粒体基因的定位及注释第33-34页
        1.3.3 线粒体基因组生物信息学分析第34页
        1.3.4 系统发育分析第34-37页
2 结果与分析第37-57页
    2.1 PCR扩增结果第37-39页
    2.2 测序结果及序列拼接第39-40页
    2.3 颚口线虫线粒体基因组的基本特征第40-57页
        2.3.1 杜氏颚口线虫中国株(Gnathostoma doloresi China isolate)线粒体基因组的基本结构和特征第40-44页
        2.3.2 日本杜氏颚口线虫(Gnathostoma doloresi China isolate)线粒体基因组的基本结构和特征第44-48页
        2.3.3 日本颚口线虫(Gnathostoma nipponicum)线粒体基因组的基本结构和特征第48-52页
        2.3.4 韩国未知种颚口线虫(Gnathostoma species Korea isolate)线粒体基因组的基本结构和特征第52-57页
3 讨论第57-67页
    3.1 颚口线虫比较线粒体基因组学研究第57-64页
        3.1.1 颚口线虫线粒体基因组的大小第57-58页
        3.1.2 颚口线虫线粒体基因组的基因第58-59页
        3.1.3 颚口线虫线粒体基因组核苷酸组成第59-60页
        3.1.4 颚口线虫线粒体基因组起始密码子和终止密码子的使用第60-63页
        3.1.5 颚口线虫线粒体t RNA和r RNA二级结构第63页
        3.1.6 颚口线虫密码子使用偏性第63-64页
    3.2 颚口线虫系统发育研究第64-67页
结论第67-68页
参考文献第68-74页
附录第74-75页
作者简介第75页

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