基于转录组数据的长序木通物种形成研究
| 摘要 | 第6-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-16页 |
| 1.1 三叶木通的简介及研究现状 | 第9-11页 |
| 1.1.1 三叶木通的形态特征及应用价值 | 第9-10页 |
| 1.1.2 木通科系统分类研究进展 | 第10-11页 |
| 1.2 转录组数据在系统发育中的应用 | 第11-13页 |
| 1.2.1 转录组基因测序背景 | 第11-13页 |
| 1.3 直系同源基因的推导 | 第13页 |
| 1.3.1 直系同源基因 | 第13页 |
| 1.3.2 直系同源推导 | 第13页 |
| 1.4 杂种的物种形成 | 第13-14页 |
| 1.4.1 自然杂交与物种形成 | 第13页 |
| 1.4.2 种间杂交的主要方式以及物种的形成 | 第13-14页 |
| 1.4.3 鉴定自然杂交的方法介绍 | 第14页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第14-16页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第16-27页 |
| 2.1 实验材料 | 第16页 |
| 2.1.1 样品采集 | 第16页 |
| 2.2 实验方法 | 第16-27页 |
| 2.2.1 转录组总RNA提取、测序 | 第16页 |
| 2.2.2 转录组的组装 | 第16页 |
| 2.2.3 Unigene功能注释和COG分类 | 第16-17页 |
| 2.2.4 基于转录组数据的系统发育分析 | 第17-25页 |
| 2.2.5 基因流检测 | 第25页 |
| 2.2.6 计算直系同源基因对的Ka/Ks | 第25-27页 |
| 第三章 结果与分析 | 第27-39页 |
| 3.1 转录组测序的结果 | 第27-32页 |
| 3.1.1 MT组装结果统计 | 第27-29页 |
| 3.1.2 CEMT组装结果统计 | 第29-30页 |
| 3.1.3 CXMT组装结果统计 | 第30-31页 |
| 3.1.4 BMT组装结果统计 | 第31-32页 |
| 3.2 注释结果统计 | 第32-34页 |
| 3.3 同源推导 | 第34-35页 |
| 3.4 基于转录组数据的系统发育分析 | 第35-36页 |
| 3.5 基因流检测 | 第36-37页 |
| 3.6 正向选择基因 | 第37-39页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第39-42页 |
| 4.1 转录组数据的系统发育分析 | 第39页 |
| 4.2 基于转录组数据分析种间关系 | 第39-40页 |
| 4.3 正向选择基因及其功能 | 第40页 |
| 4.4 长序木通物种形成探讨 | 第40-42页 |
| 参考文献 | 第42-47页 |
| 附录 | 第47-59页 |
| 致谢 | 第59页 |
