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循环肿瘤细胞团转录组分析新方法

中文摘要第4-6页
英文摘要第6-7页
第一章 绪论第12-33页
    1.1 肿瘤转移与循环肿瘤细胞团第12-13页
    1.2 循环肿瘤细胞团的发现历史第13页
    1.3 循环肿瘤细胞团生理学研究与临床研究现状第13-17页
        1.3.1 循环肿瘤细胞团的临床研究与预后价值第13-14页
        1.3.2 循环肿瘤细胞团的生物学意义与在肿瘤转移中的作用第14-17页
    1.4 循环肿瘤细胞团捕获鉴定技术研究现状第17-23页
        1.4.1 基于抗体的循环肿瘤细胞团捕获方法第17-19页
        1.4.2 基于循环肿瘤细胞团物理特性的捕获方法第19-22页
        1.4.3 循环肿瘤细胞团鉴定方法第22-23页
    1.5 单细胞获取方法第23-25页
    1.6 循环肿瘤细胞的解聚方法第25页
    1.7 单细胞RNA测序方法第25-29页
        1.7.1 Tang's method第27页
        1.7.2 Smart-seq和Smart-seq2第27-28页
        1.7.3 Cel-seq和STRT-seq第28页
        1.7.4 高通量的单细胞建库方法第28-29页
        1.7.5 Beads-seq第29页
    1.8 本课题的研究思路、研究内容与技术路线第29-33页
        1.8.1 研究思路第29-30页
        1.8.2 研究内容第30-32页
        1.8.3 技术路线第32-33页
第二章 循环肿瘤细胞团模型建立第33-43页
    2.1 引言第33-34页
    2.2 实验材料第34页
        2.2.1 试剂第34页
        2.2.2 仪器第34页
    2.3 实验方法第34-36页
        2.3.1 细胞的培养与消化第34-35页
        2.3.2 CTM体外模型构建第35-36页
        2.3.3 CTM体内模型构建第36页
    2.4 实验结果与讨论第36-42页
        2.4.1 CTM体外模型构建与评价第36-41页
        2.4.2 CTM体内模型的构建第41-42页
    2.5 本章小结第42-43页
第三章 无损的循环肿瘤细胞团前处理方法建立第43-62页
    3.1 引言第43-44页
    3.2 实验材料第44-45页
        3.2.1 试剂第44-45页
        3.2.2 仪器第45页
    3.3 实验方法第45-52页
        3.3.1 标准mRNA的制备第45-46页
        3.3.2 实时荧光定量PCR标准曲线模板的制备第46页
        3.3.3 CTM单细胞分离第46-47页
        3.3.4 CTM的捕获第47-51页
        3.3.5 单细胞mRNA逆转录定量第51-52页
        3.3.6 数据处理第52页
    3.4 实验结果与讨论第52-60页
        3.4.1 单细胞反转录效率评价方法的建立第52-53页
        3.4.2 CTM单细胞解聚试剂比较第53-55页
        3.4.3 CTM捕获试剂盒回收率比较第55-58页
        3.4.4 CTM捕获试剂盒与下游分析兼容性考察第58-60页
    3.5 本章小结第60-62页
第四章 带分子标签的单细胞转录组固相建库方法建立第62-81页
    4.1 引言第62-63页
    4.2 实验材料第63-64页
        4.2.1 试剂第63页
        4.2.2 仪器第63-64页
    4.3 实验方法第64-68页
        4.3.1 细胞的培养与消化第64页
        4.3.2 毛细管电泳第64-65页
        4.3.3 UMI引物设计第65页
        4.3.4 固相磁珠的修饰第65-66页
        4.3.5 单细胞mRNA的cDNA文库制备第66-67页
        4.3.6 看家基因的定量第67-68页
    4.4 实验结果与讨论第68-79页
        4.4.1 Beads-UMI-seq法文库质检方法建立第68-71页
        4.4.2 UMI引物设计第71-73页
        4.4.3 Beads-UMI-seq建库方法PCR扩增产物量低原因的考察第73-75页
        4.4.4 Beads-UMI-seq建库方法PCR扩增条件的优化第75-76页
        4.4.5 Beads-UMI-seq建库方法条件重复性考察第76页
        4.4.6 Beads-UMI-seq建库方法单细胞验证第76-77页
        4.4.7 CTM转录组分析方法流程确定与方法验证第77-79页
    4.5 本章小结第79-81页
第五章 结语第81-83页
    5.1 论文的主要结果和创新点第81-82页
    5.2 需要进一步解决的问题第82-83页
参考文献第83-90页
攻读硕士学位期间发表的论文第90-91页
致谢第91-92页
作者简介第92-93页

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