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辣椒疫霉效应分子编码基因的克隆及功能分析

摘要第2-4页
ABSTRACT第4-5页
前言第9-26页
    1 辣椒疫霉及其引起的植物疫病第9-15页
        1.1 辣椒疫霉的分类地位和地理分布第9-10页
        1.2 辣椒疫霉的寄主范围及引起的主要病害第10-11页
        1.3 辣椒疫霉的生活史及侵染过程第11-14页
        1.4 辣椒疫霉的防治第14-15页
            1.4.1 农业防治第14-15页
            1.4.2 植物抗病性利用第15页
            1.4.3 化学防治第15页
    2 卵菌与植物的相互作用第15-17页
        2.1 植物免疫系统第16页
        2.2 卵菌AVR蛋白与植物R蛋白之间的互作第16-17页
    3 疫霉菌效应分子的研究进展第17-26页
        3.1 植物胞内效应分子(Cytoplasmic effectors)第17-23页
            3.1.1 RXLR效应分子第17-21页
            3.1.2 CRN效应分子第21-23页
        3.2 植物质外体效应分子(Apoplastic effectors)第23-26页
            3.2.1 Elicitin效应分子第23-24页
            3.2.2 PcF/SCR效应分子第24-25页
            3.2.3 NLP效应分子第25-26页
材料与方法第26-45页
    1 供试菌株和植物材料第26-27页
    2 主要质粒载体第27页
    3 核酸的提取第27-28页
        3.1 基因组DNA的提取第27页
        3.2 总RNA的提取第27-28页
        3.3 质粒DNA的提取第28页
    4 感受态细胞的制备第28-29页
        4.1 大肠杆菌感受态细胞的制备第28-29页
        4.2 农杆菌感受态细胞的制备第29页
    5 RNA-Seq及生物信息学分析第29-30页
    6 RT-PCR分析第30-32页
        6.1 cDNA第一链的合成第30-31页
        6.2 cDNA样品的检测及标定第31页
        6.3 基因转录水平分析第31-32页
    7 基因的克隆及载体构建第32-36页
        7.1 基因扩增与DNA片段回收第32-33页
        7.2 Over-lap PCR第33-34页
        7.3 载体的连接构建第34-36页
        7.4 大肠杆菌的转化第36页
        7.5 菌落PCR及测序第36页
    8 农杆菌介导的瞬时表达分析第36-38页
        8.1 农杆菌的转化及阳性克隆的筛选第36-37页
        8.2 本氏烟注射第37-38页
    9 基因瞬时沉默第38-41页
        9.1 基因dsRNA的体外合成第38-39页
        9.2 dsRNA转化辣椒疫霉原生质体第39-41页
        9.3 转化子沉默水平分析第41页
        9.4 沉默转化子的致病力测定第41页
    10 基因稳定沉默第41-44页
        10.1 辣椒疫霉原生质体的稳定转化第42页
        10.2 沉默转化子的筛选第42页
        10.3 沉默转化子的致病力测定第42-43页
        10.4 沉默转化子的形态学性状测定第43-44页
    11 统计分析第44-45页
结果与分析第45-76页
    1 辣椒疫霉与本氏烟互作体系的建立第45-46页
        1.1 辣椒疫霉从根部侵染本氏烟第45页
        1.2 辣椒疫霉休止孢在不同界面上的萌发第45-46页
    2 辣椒疫霉效应分子的获得第46-49页
        2.1 生长发育阶段高通量测序第47页
        2.2 效应分子的获得第47-49页
    3 辣椒疫霉效应分子编码基因的转录特征第49-53页
        3.1 不同阶段cDNA的合成及标定第49-50页
        3.2 效应分子编码基因的转录特征第50-53页
    4 辣椒疫霉效应分子激发PCD第53-54页
        4.1 植物质外体效应分子Elicitin和NLP激发PCD第53-54页
        4.2 植物胞内效应分子RXLR激发PCD第54页
    5 辣椒疫霉RXLR和CRN效应分子的毒性功能第54-57页
        5.1 RXLR和CRN效应分子对本氏烟PCD的抑制第54-56页
        5.2 CRN效应分子对病菌侵染本氏烟的促进第56-57页
    6 辣椒疫霉转化体系的建立第57页
    7 三个RXLR效应分子在病菌侵染中的作用第57-71页
        7.1 Pc107349第57-63页
            7.1.1 序列多态性第57-60页
            7.1.2 基因沉默导致病菌致病力下降第60-63页
        7.2 Pc503142第63-67页
            7.2.1 Pc503142属于一个高度同源的蛋白家族第63页
            7.2.2 功能位点第63-65页
            7.2.3 基因稳定沉默导致病菌致病力下降第65页
            7.2.4 基因沉默转化子对外源活性氧的敏感性增强第65-67页
        7.3 Pc129113第67-71页
            7.3.1 序列多态性第67页
            7.3.2 功能位点第67-70页
            7.3.3 基因稳定沉默导致病菌致病力下降第70-71页
    8 PcF/SCR效应分子Pc96045在病菌侵染中的作用第71-76页
        8.1 序列多态性第71-72页
        8.2 基因异源表达抑制病菌侵染第72-73页
        8.3 病菌侵染中的致病因子第73页
        8.4 稳定过表达增强病菌对活性氧的耐受性第73-76页
讨论第76-85页
    1 辣椒疫霉与本氏烟的互作体系第76页
    2 辣椒疫霉发育阶段转录组测序及效应分子编码基因的挖掘第76-77页
    3 辣椒疫霉效应分子编码基因的转录特征第77-79页
    4 辣椒疫霉效应分子的功能第79-85页
        4.1 RXLR和CRN效应分子的毒性功能第79-80页
        4.2 RXLR效应分子对辣椒疫霉致病性具有重要作用第80-82页
        4.3 质外体效应分子对辣椒疫霉致病性具有重要作用第82-85页
展望第85-86页
参考文献第86-99页
附录一 本研究使用的主要仪器设备第99-100页
附录二 本研究使用的菌株、培养基、引物及试剂第100-109页
附录三 本研究获得的其他结果图第109-112页
致谢第112-113页
攻读学位期间发表的论文第113-114页

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