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微卫星DNA标记与SNP芯片鉴定宁乡猪亲缘关系

摘要第4-5页
Abstract第5页
1.文献综述第10-21页
    1.1 亲缘鉴定发展历程第10-11页
        1.1.1 表型识别第10页
        1.1.2 滴血验亲第10页
        1.1.3 血型测试第10-11页
        1.1.4 染色体多态性鉴定第11页
        1.1.5 DNA鉴定第11页
    1.2 微卫星标记及其在亲缘关系鉴定中的应用第11-14页
        1.2.1 微卫星标记的结构第11页
        1.2.2 微卫星标记的特点第11-12页
        1.2.3 微卫星标记在亲缘关系鉴定中的应用第12-13页
        1.2.4 微卫星DNA扩增产物的分型方法第13-14页
    1.3 SNP标记及其在亲缘关系鉴定中的应用第14-18页
        1.3.1 SNP概述第14页
        1.3.2 SNP标记优点第14-15页
        1.3.3 SNP常用的检测方法第15-18页
        1.3.4 SNP标记在亲缘关系鉴定中的应用第18页
    1.4 研究内容与目的意义第18-21页
2.材料与方法第21-27页
    2.1 实验材料第21-22页
        2.1.1 实验样品采集第21页
        2.1.2 实验主要仪器设备第21页
        2.1.3 实验主要试剂第21-22页
    2.2 试验方法第22-25页
        2.2.1 耳样DNA的提取第22页
        2.2.2 DNA浓度、纯度及质量检测第22页
        2.2.3 微卫星基因组分型第22-24页
        2.2.4 SNP基因组分型第24-25页
    2.3 数据分析方法第25-27页
        2.3.1 微卫星基因频率的计算第25页
        2.3.2 微卫星基因座杂合度和有效等位基因数的计算第25-26页
        2.3.3 多态信息含量(PIC)的计算第26页
        2.3.4 亲缘鉴定的分析参数的估计第26页
        2.3.5 SNP数据处理第26-27页
3.结果分析第27-38页
    3.1 宁乡猪基因组DNA提取结果第27页
    3.2 微卫星基因组分型第27-34页
        3.2.1 微卫星位点检测分型第27-28页
        3.2.2 微卫星遗传多样性及亲缘鉴定的评价第28-34页
    3.3 SNP分型结果第34-38页
        3.3.1 SNP位点筛选第34页
        3.3.2 群体遗传结构第34-37页
        3.3.3 亲缘关系的鉴定第37-38页
4.讨论第38-40页
    4.1 STR标记亲子鉴定准确性的影响因素第38-39页
        4.1.1 DNA提取及PCR扩增第38页
        4.1.2 微卫星判型第38页
        4.1.3 遗传标记的多态性第38页
        4.1.4 宁乡猪系谱资料的记载第38-39页
    4.2 SNP芯片亲子鉴定准确性的影响因素第39页
        4.2.1 提取的DNA第39页
        4.2.2 群体遗传结构第39页
    4.3 STR标记与SNP芯片鉴定效力的比较第39-40页
        4.3.1 STR标记与SNP标记鉴定效率的比较第39页
        4.3.2 STR标记与SNP芯片鉴定结果的比较第39-40页
5.结论第40-41页
参考文献第41-47页
缩略词表第47-48页
致谢第48-49页
作者简介第49页

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