| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-33页 |
| 1.1 水稻研究的重要性 | 第12页 |
| 1.2 水稻产量的主要影响因素 | 第12-16页 |
| 1.3 水稻粒型及粒重性状的遗传研究进展 | 第16-20页 |
| 1.3.1 水稻粒长基因的研究进展 | 第17-18页 |
| 1.3.2 水稻粒宽基因的研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.3 水稻粒厚基因的研究进展 | 第19页 |
| 1.3.4 水稻粒长宽比遗传研究进展 | 第19-20页 |
| 1.3.5 水稻粒重的遗传研究进展 | 第20页 |
| 1.4 水稻遗传学研究中应用到的定位群体 | 第20-22页 |
| 1.4.1 F2群体 | 第20-21页 |
| 1.4.2 回交群体(BC) | 第21页 |
| 1.4.3 加倍单倍体群体 | 第21页 |
| 1.4.4 近等基因系 | 第21-22页 |
| 1.4.5 重组自交系 | 第22页 |
| 1.4.6 染色体片段置换系 | 第22页 |
| 1.5 水稻遗传研究中的分子标记 | 第22-25页 |
| 1.5.1 简单重复序列 | 第23页 |
| 1.5.2 限制性片段长度多态性 | 第23-24页 |
| 1.5.3 序列标签位点 | 第24页 |
| 1.5.4 酶切扩増序列多态性(CAPS)标记 | 第24页 |
| 1.5.5 扩増片段长度多态性(AFLP) | 第24-25页 |
| 1.5.6 单核苷酸多态性(SNP) | 第25页 |
| 1.6 QTL定位的原理和方法 | 第25-32页 |
| 1.6.1 QTL定位的原理 | 第25页 |
| 1.6.2 QTL定位的前提条件 | 第25-26页 |
| 1.6.3 QTL定位的步驟 | 第26页 |
| 1.6.4 遗传图谱的构建 | 第26-27页 |
| 1.6.5 QTL作图方法 | 第27-29页 |
| 1.6.5.1 单标记分析方法 | 第27-28页 |
| 1.6.5.2 区间作图法 | 第28页 |
| 1.6.5.3 复合区间作图法 | 第28页 |
| 1.6.5.4 混合线性模型复合区间作图法 | 第28-29页 |
| 1.6.5.5 多重区间作图法 | 第29页 |
| 1.6.6 影响QTL作图的主要因素 | 第29-30页 |
| 1.6.7 QTL的初定位 | 第30-31页 |
| 1.6.8 QTL的精细定位 | 第31页 |
| 1.6.9 水稻产量QTL的特点 | 第31-32页 |
| 1.7 本研究的目的意义 | 第32-33页 |
| 2 材料与方法 | 第33-45页 |
| 2.1 材料 | 第33-39页 |
| 2.1.1 植物材料 | 第33页 |
| 2.1.2 试剂 | 第33页 |
| 2.1.3 仪器和设备 | 第33页 |
| 2.1.4 实验引物 | 第33-39页 |
| 2.2 实验方法 | 第39-44页 |
| 2.2.1 性状调查和取样 | 第39页 |
| 2.2.2 水稻样品粒形和粒重的测量方法 | 第39-40页 |
| 2.2.3 CTAB法提取水稻基因组DNA | 第40页 |
| 2.2.4 SSR分子引物的筛选 | 第40-41页 |
| 2.2.5 PCR反应 | 第41页 |
| 2.2.6 跑电泳检测来检测分析数据 | 第41-42页 |
| 2.2.7 对电泳结果进行统计分析 | 第42页 |
| 2.2.8 相关溶液的配置方法 | 第42-43页 |
| 2.2.8.1 CTAB溶液的配置方法和个别试剂的作用 | 第42-43页 |
| 2.2.8.2 霍格兰溶液的配置方法 | 第43页 |
| 2.2.9 QTLIciMapping3.0软件的使用方法 | 第43-44页 |
| 2.3 高通量测序 | 第44-45页 |
| 3 结果与分析 | 第45-62页 |
| 3.1 水稻粒型的表型分析 | 第45-47页 |
| 3.2 水稻粒型性状的相关性分析 | 第47-48页 |
| 3.3 QTL定位分析 | 第48-54页 |
| 3.3.1 QTL定位电泳结果数据准备 | 第48页 |
| 3.3.2 遗传图谱的构建 | 第48-49页 |
| 3.3.3 QTL定位和位点分析 | 第49-54页 |
| 3.4 高通量测序结果 | 第54-62页 |
| 3.4.1 测序数据质量情况汇总 | 第54页 |
| 3.4.2 测序数据评估小结 | 第54-55页 |
| 3.4.3 比对统计 | 第55页 |
| 3.4.4 SNP检测及注释结果统计 | 第55-56页 |
| 3.4.5 子代SNP频率差异分析 | 第56-59页 |
| 3.4.5.1 子代SNP频率计算 | 第56-58页 |
| 3.4.5.2 子代SNP频率分布 | 第58-59页 |
| 3.4.5.3 子代SNP频率差异分布 | 第59页 |
| 3.4.6 目标性状区域定位 | 第59-60页 |
| 3.4.7 候选基因的验证 | 第60-62页 |
| 4 讨论 | 第62-64页 |
| 5 结论 | 第64-65页 |
| 参考文献 | 第65-70页 |
| 致谢 | 第70页 |