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来源于Alcaligenes A-6的D-氨基酰化酶基因工程菌的构建与酶学性质的研究

中文摘要第4-6页
Abstract第6-7页
第一章 前言第13-31页
    1.1 D-氨基酰化酶第13-24页
        1.1.1 D-氨基酰化酶的发现第13-14页
        1.1.2 D-氨基酰化酶的来源第14-16页
        1.1.3 D-氨基酰化酶的性质第16-18页
        1.1.4 D-氨基酰化酶的应用第18-22页
        1.1.5 Alcaligenes 来源的 D-氨基酰化酶与 D-缬氨酸第22-24页
    1.2 E.coli 工程菌的构建第24-28页
        1.2.1 酶促与化学合成法制备外源基因第24-27页
        1.2.2 TIR 区二级结构对外源蛋白表达的影响第27-28页
    1.3 酶的固定化第28-29页
        1.3.1 酶的固定化第28-29页
        1.3.2 固定化酶的酶学性质第29页
        1.3.3 固定化酶的应用第29页
    1.4 本研究目的与意义第29-31页
第二章 来源于 AlcaligenesA-6 D-氨基酰化酶基因的合成第31-61页
    2.1 材料与方法第31-40页
        2.1.1 试剂与材料第31-32页
        2.1.2 溶液配制第32-33页
        2.1.3 仪器与设备第33页
        2.1.4 D-氨基酰化酶基因的合成第33-35页
        2.1.5 测序亚克隆载体 pUC-dan 的构建第35-40页
    2.2 结果与讨论第40-59页
        2.2.1 来源于 Alcaligenes A-6 D-氨基酰化酶的氨基酸序列第40页
        2.2.2 E.coli 密码子频率表第40页
        2.2.3 E.coli 偏爱密码子编码的 D-氨基酰化酶第40-41页
        2.2.4 拟合成序列全长第41-44页
        2.2.5 寡核苷酸的拆分第44-46页
        2.2.6 D-aminoacylase 的两步法合成第46-47页
        2.2.7 D-aminoacylase 的三步法合成第47-50页
        2.2.8 测序载体 pUC-dan 的构建第50页
        2.2.9 测序结果第50-56页
        2.2.10 合成基因中碱基错误的修复第56-59页
    2.3 本章小结第59-61页
第三章 D-aminoazylase 基因工程菌的构建与表达第61-83页
    3.1 材料与方法第61-67页
        3.1.1 试剂与材料第61页
        3.1.2 溶液配制第61-62页
        3.1.3 融合表达载体 pET-trx-dan 的构建第62-64页
        3.1.4 非融合表达载体 pET-dan 的构建第64页
        3.1.5 D-aminoazylase 的诱导表达第64-65页
        3.1.6 表达蛋白可溶性分析第65页
        3.1.7 D-aminoazylase 的酶活力测定第65-66页
        3.1.8 Western-blot 检测第66-67页
    3.2 结果与讨论第67-80页
        3.2.1 融合表达载体 pET-trx-dan 的构建第67-69页
        3.2.2 非融合表达载体 pET-dan 的构建第69-70页
        3.2.3 表达载体测序结果第70-75页
        3.2.4 D-aminoazylase 的诱导表达第75-78页
        3.2.5 D-aminoazylase 的可溶性分析第78页
        3.2.6 D-aminoazylase 的发酵活力测定第78-79页
        3.2.7 D-aminoazylase 的 Western-Blot 分析第79-80页
    3.3 本章小结第80-83页
第四章 TIR 区密码子选择对 D-aminoazylase 表达的影响第83-97页
    4.1 材料与方法第83-84页
        4.1.1 试剂与材料第83页
        4.1.2 密码子的替换第83页
        4.1.3 mRNA 翻译起始区二级结构的预测第83页
        4.1.4 点突变第83页
        4.1.5 SDS-PAGE 检测目的蛋白的表达第83-84页
        4.1.6 D-aminoazylase 的发酵活力测定第84页
    4.2 结果与讨论第84-94页
        4.2.1 同义密码子的选择第84页
        4.2.2 同义密码子编码的 SGSA 序列第84-88页
        4.2.3 TIR 区 mRNA 二级结构第88-90页
        4.2.4 TIR 区密码子选择对 D-aminoazylase 表达的影响第90-94页
    4.3 本章小结第94-97页
第五章 D-aminoazylase 发酵工艺研究第97-107页
    5.1 材料与方法第97-98页
        5.1.1 试剂与仪器第97页
        5.1.2 D-aminoazylase 活性测定第97页
        5.1.3 蛋白胨浓度对 D-ANase 表达的影响第97页
        5.1.4 酵母浸粉浓度对 D-ANase 表达的影响第97页
        5.1.5 葡萄糖浓度对 D-ANase 表达的影响第97页
        5.1.6 培养基初始 pH 对 D-ANase 表达的影响第97-98页
        5.1.7 培养温度对 D-ANase 表达的影响第98页
        5.1.8 IPTG 浓度对 D-ANase 表达的影响第98页
        5.1.9 诱导时机对 D-ANase 表达的影响第98页
        5.1.10 诱导时间对 D-ANase 表达的影响第98页
    5.2 结果与讨论第98-104页
        5.2.1 蛋白胨浓度对 D-ANase 表达的影响第98-99页
        5.2.2 酵母浸粉浓度对 D-ANase 表达的影响第99-100页
        5.2.3 葡萄糖浓度对 D-ANase 表达的影响第100页
        5.2.4 培养基初始 pH 对 D-ANase 表达的影响第100-101页
        5.2.5 培养温度对 D-ANase 表达量的影响第101-102页
        5.2.6 IPTG 浓度对 D-ANase 表达量的影响第102页
        5.2.7 诱导时机对 D-ANase 表达的影响第102-103页
        5.2.8 诱导时间对 D-ANase 表达量的影响第103-104页
        5.2.9 最适发酵工艺条件下的 D-ANase 表达第104页
    5.3 本章小结第104-107页
第六章 D-aminoazylase 纯化工艺研究第107-117页
    6.1 材料与方法第107-110页
        6.1.1 试剂与仪器第107-108页
        6.1.2 蛋白质含量标准曲线第108页
        6.1.3 D-ANase 酶活测定第108页
        6.1.4 菌体破碎工艺探索第108-109页
        6.1.5 D-aminoazylase 纯化工艺探索第109-110页
        6.1.6 D-ANase 蛋白纯度和分子量鉴定第110页
    6.2 结果与讨论第110-115页
        6.2.1 蛋白质含量标准曲线第110-111页
        6.2.2 菌体破碎工艺探索第111-113页
        6.2.3 融合表达 D-ANase 蛋白纯化结果第113-114页
        6.2.4 非融合表达 D-aminoazylase 层析纯化工艺第114-115页
    6.3 本章小结第115-117页
第七章 D-aminoazylase 酶学性质研究第117-127页
    7.1 材料与方法第117-119页
        7.1.1 试剂与材料第117页
        7.1.2 仪器与设备第117-118页
        7.1.3 D-ANase 底物特异性检测第118页
        7.1.4 pH 值对酶活性的影响第118页
        7.1.5 温度对酶活性的影响第118页
        7.1.6 金属离子对酶活性的影响第118页
        7.1.7 底物浓度对酶促反应的影响第118-119页
        7.1.8 D-ANase 热稳定性分析第119页
        7.1.9 D-ANase pH 稳定性分析第119页
    7.2 结果与讨论第119-126页
        7.2.1 D-ANase 催化底物特异性第119页
        7.2.2 pH 值对酶活性的影响第119-121页
        7.2.3 温度对酶活性的影响第121页
        7.2.4 金属离子对酶活性的影响第121-122页
        7.2.5 底物浓度对酶活性的影响第122-124页
        7.2.6 D-ANase 热稳定性分析第124-125页
        7.2.7 D-ANase pH 稳定性分析第125-126页
    7.3 本章小结第126-127页
第八章 D-aminoacylase 的固定化第127-135页
    8.1 材料与方法第127-128页
        8.1.1 试剂与材料第127页
        8.1.2 D-aminoacylase 的固定化第127-128页
        8.1.3 卡拉胶浓度的优化第128页
        8.1.4 D-氨基酰化酶浓度的优化第128页
        8.1.5 D-氨基酰化酶硬化条件的优化第128页
        8.1.6 固定化酶胶球机械强度的估测第128页
        8.1.7 D-aminoacylase 酶活测定第128页
    8.2 结果与讨论第128-133页
        8.2.1 卡拉胶浓度的优化第128-129页
        8.2.2 D-氨基酰化酶浓度的优化第129-130页
        8.2.3 D-氨基酰化酶硬化条件的优化第130-132页
        8.2.4 固定化 D-aminoacylase 应用第132-133页
    8.3 本章小结第133-135页
第九章 结论第135-139页
参考文献第139-147页
致谢第147-149页
攻博期间发表的学术论文第149页

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