| 中文摘要 | 第1-14页 |
| 英文摘要 | 第14-16页 |
| 符号说明 | 第16-18页 |
| 第一章 引言 | 第18-24页 |
| ·单分子操纵方法的介绍 | 第18-19页 |
| ·单分子操纵的研究意义 | 第19-21页 |
| ·DNA 凝聚的研究现状 | 第21-22页 |
| ·本论文的研究内容与结论 | 第22-24页 |
| 第二章 实验仪器原理与实验方法 | 第24-42页 |
| ·原子力显微镜的介绍 | 第24-34页 |
| ·AFM 的工作原理 | 第24-26页 |
| ·AFM 的组成部分 | 第26-28页 |
| ·力检测部分 | 第26-27页 |
| ·位置检测部分 | 第27-28页 |
| ·反馈系统 | 第28页 |
| ·AFM 的成像载体 | 第28-29页 |
| ·AFM 的工作模式 | 第29-32页 |
| ·接触模式 | 第29-30页 |
| ·轻敲模式 | 第30-31页 |
| ·非接触模式 | 第31-32页 |
| ·AFM 在生物学中的应用 | 第32-34页 |
| ·AFM 对生物细胞的表面形态观察 | 第32页 |
| ·生物大分子的结构及其他性质的观测研究 | 第32-33页 |
| ·原子力显微镜对生物分子之间力谱曲线的观测 | 第33-34页 |
| ·磁镊装置的原理与操作过程 | 第34-41页 |
| ·实验前期准备 | 第34-36页 |
| ·磷酸缓冲液的配置 | 第35页 |
| ·PBST 溶液的配制 | 第35页 |
| ·磁球预处理 | 第35-36页 |
| ·lambda-DNA 修饰 | 第36页 |
| ·样品槽的制备 | 第36-37页 |
| ·样品制备原理 | 第37-38页 |
| ·磁镊装置及其原理 | 第38-40页 |
| ·磁镊的实验过程 | 第40-41页 |
| ·本章小结 | 第41-42页 |
| 第三章 酒精与三氯六氨合钴共同作用导致的 DNA 凝聚 | 第42-56页 |
| ·用 AFM 观察不同方法下lambda-DNA 的成像 | 第42-47页 |
| ·实验仪器与材料 | 第42-43页 |
| ·实验方法与结果 | 第43-46页 |
| ·APTES 处理方法 | 第43-44页 |
| ·使用 Ca~(2+)作为桥梁成像DNA | 第44-45页 |
| ·使用多价钴离子成像 DNA | 第45-46页 |
| ·三种成像结果的对比 | 第46-47页 |
| ·乙醇与三氯六氨络合钴共同作用导致的 DNA 凝聚 | 第47-55页 |
| ·实验材料与方法 | 第48-50页 |
| ·材料 | 第48-49页 |
| ·样品准备 | 第49页 |
| ·原子力显微镜测量 | 第49-50页 |
| ·结果与讨论 | 第50-55页 |
| ·乙醇导致的 DNA 凝聚 | 第50-51页 |
| ·三氯六氨络合钴导致的 DNA 凝聚 | 第51-53页 |
| ·乙醇与三氯六氨络合钴共同作用导致的 DNA 凝聚 | 第53-55页 |
| ·结论 | 第55页 |
| ·本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 酒精导致的DNA 凝聚 | 第56-74页 |
| ·酒精导致的单分子 DNA 的凝聚的背景 | 第56-58页 |
| ·实验材料与方法 | 第58-60页 |
| ·材料 | 第58页 |
| ·磁镊研究过程的DNA 的修饰 | 第58页 |
| ·磁镊装置 | 第58-59页 |
| ·单分子测量 | 第59页 |
| ·AFM 样品的制备与成像 | 第59-60页 |
| ·酒精导致DNA 凝聚的实验结果 | 第60-67页 |
| ·DNA 拉伸曲线的测量 | 第60-64页 |
| ·DNA 凝聚的 AFM 成像 | 第64-67页 |
| ·讨论 | 第67-73页 |
| ·持久长度随着酒精浓度的变化状况 | 第67-69页 |
| ·DNA 拉伸实验 | 第69-72页 |
| ·酒精导致DNA 凝聚的分析 | 第72-73页 |
| ·本章小结 | 第73-74页 |
| 第五章 DNA 与蛋白（限制性内切酶）相互作用的研究 | 第74-94页 |
| ·内切酶的介绍 | 第75-77页 |
| ·内切酶的发现和功能 | 第75-76页 |
| ·内切酶的分类 | 第76-77页 |
| ·环状 PBR322DNA 与内切酶 EcoRI 之间的相互作用的研究 | 第77-82页 |
| ·材料与方法 | 第78-79页 |
| ·材料 | 第78页 |
| ·AFM 成像 | 第78页 |
| ·AFM 样品准备 | 第78-79页 |
| ·结果与讨论 | 第79-82页 |
| ·内切酶与 DNA 的切割作用 | 第79-81页 |
| ·内切酶与 DNA 的结合作用 | 第81-82页 |
| ·结论 | 第82页 |
| ·噬菌体lambda-DNA 与内切酶 BspMI 的相互作用的研究 | 第82-92页 |
| ·材料与方法 | 第83-85页 |
| ·DNA 与内切酶 | 第83-84页 |
| ·AFM 图像 | 第84页 |
| ·AFM 样品制备 | 第84页 |
| ·数据分析 | 第84-85页 |
| ·结果与讨论 | 第85-90页 |
| ·蛋白与DNA 分子的特异性与非特异性结合 | 第85-86页 |
| ·AFM 图片上面的内切酶BspMI 的体积与形态分析 | 第86-88页 |
| ·通过改变 BspMI 的浓度，绑定率与成环率的统计 | 第88-89页 |
| ·BspMI 导致 DNA 内切酶的环的大小统计 | 第89-90页 |
| ·机制分析 | 第90-91页 |
| ·结论 | 第91-92页 |
| ·本章小结 | 第92-94页 |
| 第六章 总结与展望 | 第94-96页 |
| ·主要结果 | 第94-95页 |
| ·主要创新点 | 第95-96页 |
| 参考文献 | 第96-110页 |
| 博士期间发表的学术论文(按照时间顺序) | 第110-112页 |
| 致谢 | 第112页 |
